日本在距今約2000多到16000年前，被稱作繩文時代，直到來自亞洲大陸，配備稻米與金屬的彌生人陸續抵達為止。儘管日本地區在這一萬多年，都被歸類為連續的繩文時期，但各地的繩文文化之間，仍存在一些差異，並非鐵板一塊
Hunting dogs as environmental adaptations in Jomon Japan
依靠採集狩獵維生，會使用陶器的繩文人，有個很有意思的問題是，他們與狗的關係。狩獵是繩文人獲取資源的一大手段，而狗，一向都是人類打獵的好夥伴。
這個論文整理惹目前已知的繩文古狗資訊。在一萬多年前，地球回暖，由更新世轉為全新世，論文設定的繩文分期，把正式開始設在一萬年前，更早之前到16000年前，則是當成初始期。
在繩文時期開始以後，本洲島的東半部，也就是太平洋側，陸續出現大批的古狗墓葬。一開始比較少，7000到一萬年前這段期間，只有2個遺址。
隨後到繩文時期結束，一共有37個遺址發現古狗遺骸，至少出土110位古狗。這些墓葬中的狗，不少來自貝冢，絕大部分看起來是被有意的掩埋，有些骨骼還有痊癒的特徵，似乎受過人為照料。年齡上，從新生小狗，到12歲老狗都有。
論文認為，古狗墓葬只集中在本洲的太平洋側，與當地環境關係密切。在島的另一邊，也就是日本海側，氣候比東岸寒冷得多，也就少有大型動物。
不像東部森林多，住著許多梅花鹿（sika deer，學名 Cervus nippon）與野豬（wild boar，學名 Sus scrofa leucomystax），狗的大量出現與受到妥善對待，很可能與太平洋側，繩文族群的狩獵需求有關。
距今 2350 年前，農業首度於日本出現以後，事情就不一樣惹。此後的墓葬，出土的古狗遺骸不但數量大不如前，而且多半都是隨意亂丟，生前被肢解的殘骸（朝鮮半島......來的......吃狗？），與繩文時期很不一樣。
繩文人真是現代日本人的祖先？有多少遺傳留下？──繩文人DNA研究（上）
日本的繩文人從哪裡來？和台灣原住民又有什麼淵源？──繩文人DNA研究（下）
論文推論，由於環境因素，使得本州島東部太平洋沿岸的繩文族群，比其他地方的人，更依賴狩獵有蹄動物，這導致與獵狗合作的需求，獵人與獵狗雙方發展出親密的關係，形成當地特殊的文化特色。
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Prehistoric Japanese graves provide best evidence yet that dogs were our ancient hunting companions
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