盲眼的尼安德塔石器匠

美洲一直都只有野牛，沒有馴化牛，歐洲人前來殖民才帶來馴化牛。歐洲以外，殖民者也引進原產非洲的牛。 現今美洲的牛源自歐洲和非洲，照已知的歷史紀錄看來，歐洲牛比較早，不過不清楚非洲牛什麼時候來。這個 2023 年的論文，調查殖民早期，墨西哥、海地牛牛的古代DNA。

Ancient DNA confirms diverse origins of early post-Columbian cattle in the Americas

美洲在一萬多年前，冰河時期結束後，大量大型動物滅團。這個 2023 年的論文深入探討美國西南部的加州，卻發現早於冰河時期結束前已經有不少動物消失，而火災 🔥 是關鍵因素。但是論文強調的人類角色，我覺得十分可疑。

Pre–Younger Dryas megafaunal extirpation at Rancho La Brea linked to fire-driven state shift

人類活動會影響自然環境，以及周圍的生物，例如不少動物就習慣在人類附近出沒。這個 2023 年的論文報告，早在 3 萬年前的捷克，似乎就有渡鴉跟在人類身邊吃吃喝喝。

Evidence for hunter-gatherer impacts on raven diet and ecology in the Gravettian of Southern Moravia

遠遠早於黑死病，5000 年前就有人類感染鼠疫桿菌（Yersinia pestis），針對微生物的古代DNA 研究中這方面探討不少。這個 2023 年的論文報告，4000 年前英國有居民感染鼠疫桿菌，可見當時歐洲大陸的細菌，成功跨海前進不列顛。

Yersinia pestis genomes reveal plague in Britain 4000 years ago  

古早人種植葡萄，主要目的是釀葡萄酒。這個 2023 年的論文調查以色列出土 8 世紀的葡萄，發現不只一款品系，當中一款和現代流行的一個品系一模一樣，另外也見到已知最早的白葡萄。

Ancient DNA from a lost Negev Highlands desert grape reveals a Late Antiquity wine lineage

雞是大家最熟悉的馴化動物之一，這個 2023 年的論文報告將近 2400 年前，彌生時期的雞骨，是至今確認日本最早有雞的紀錄。

The earliest evidence of domestic chickens in the Japanese Archipelago

埃及斑蚊（Aedes aegypti）本來住在非洲西部，幾百年前才隨著奴隸貿易廣傳世界。另一件事很多人不知道：埃及斑蚊的祖先取食對象更廣，後來才變得特別針對人。這個 2023 年的論文巧妙地利用奴隸貿易作年代尺標，估計專情於人的埃及斑蚊族群，約莫 5000 年前衍生，差不多也是非洲變乾燥的時候。

Dating the origin and spread of specialization on human hosts in Aedes aegypti mosquitoes

鼠疫桿菌最知名的大爆炸是黑死病，另外還有一堆大小瘟疫。這個 2023 年的論文鎖定單一一個小國家：丹麥，深入鑽研此處不同年代的狀況，得知從黑死病開始，鼠疫桿菌至少獨立入侵過丹麥 3 次。

Emergence, continuity, and evolution of Yersinia pestis throughout medieval and early modern Denmark

麵包樹原產於大洋洲，除此之外，世界上存在感最高的地區是加勒比海，由歐洲人在兩百多年前引進。這個 2023 年的論文調查各地麵包樹的 DNA，判斷加勒比海地區大部份麵包樹，是英國殖民者於公元 1790 年代從大溪地進口的後裔。

Linking breadfruit cultivar names across the globe connects histories after 230 years of separation

多久以前的人就會養狗？這個 2022 年的論文報告，西班牙出土 1.7 萬年前的骨頭應該是狗，不是狼或豺。這也是至今比較能確認，歐洲最早狗勾的紀錄。

The domestic dog that lived ∼17,000 years ago in the Lower Magdalenian of Erralla site (Basque Country): A radiometric and genetic analysis

驢子是史上最重要的馴化動物之一，扮演吃重的勞工與駝獸角色。但是講到這個議題通常會排在馬的後面，儘管驢的馴化比馬更早。這個 2022 年的論文探討馴化驢的遺傳史，判斷只有一次馴化，源自 7000 年前的非洲。

The genomic history and global expansion of domestic donkeys

單純疱疹病毒（herpes simplex virus）是十分常見的人類病原體，可分為第一型、第二型，第一型又可以分為三大群，非洲的型號最早分家。有人因此推測，它能追溯到智人祖宗離開非洲的時期；卻也有人估計，其實歷史只有幾千年而已。這個 2022 年的論文取得古代基因組，判斷共同祖先為 5000 多年。

Ancient herpes simplex 1 genomes reveal recent viral structure in Eurasia

人類一直與各種傳染病為伍，藉由古代DNA，也有機會探討古早人的疾病。這個 2022 年的論文報告，在希臘 4000 年前的米諾斯文明遺址中，尋獲鼠疫桿菌和傷寒的蹤影。

Ancient Yersinia pestis and Salmonella enterica genomes from Bronze Age Crete

一百多年前公元 1918 年 1 月開始，流感廣傳世界各地，殺傷力相當嚴重，可能消滅數千萬智人，史稱「西班牙流感」。但是照現在政治正確的說法，要稱之為「1918年新型流感」。這個 2022 年的論文取得幾個當時的病毒樣本，探討這場疫情中病毒的變化與適應。

Archival influenza virus genomes from Europe reveal genomic variability during the 1918 pandemic

老鼠有好幾款，如今最常見的家鼠以外，還有大鼠戰隊旗下的褐鼠、黑鼠等等。鼠輩們的分佈常常受到人類活動影響，這個 2022 年的論文調查羅馬帝國以來，歐洲與北非的黑鼠，探討黑鼠的情慾流動史。

Palaeogenomic analysis of black rat (Rattus rattus) reveals multiple European introductions associated with human economic history  

貿易是維京人的一大產業，一項主力商品是海象牙。維京人獵捕大批海象，供應西歐的需求，留下「路易斯棋」等文物。 東歐也有象牙，以前認為主要來自俄羅斯北極區，不是維京人；這個 2022 年的論文卻發現，烏克蘭的基輔，有些海象牙源於相距 4000 公里遠的格陵蘭。

Walruses on the Dnieper: new evidence for the intercontinental trade of Greenlandic ivory in the Middle Ages

澳洲野犬 dingo 是一款非常獨特的狗勾。狗是狼馴化而來，澳洲野犬似乎是狗，卻不與人一起生活。考古學指出，他們大概是在數千年抵達澳洲，脫離人類走上自己的路。 這個 2022 年的論文調查澳洲野犬的基因組、DNA甲基化、腸道菌，探討與品種養殖狗的差異。

The Australian dingo is an early offshoot of modern breed dogs

16 世紀開始，歐洲勢力大舉殖民美洲，又從非洲引進勞動人口，形成動態的三角形，促進交流，也增添不少苦難。流動的除惹人口與貨物，還有傳染病。這個 2021 年的論文報告，墨西哥城在殖民初期的遺骸牙齒中，發現的微小病毒B19型、B肝病毒。

Ancient viral genomes reveal introduction of human pathogenic viruses into Mexico during the transatlantic slave trade

伊朗的札格羅斯山區，算是肥沃月灣的最東部，也是一萬多年前，人類轉型為新石器時代的地區之一。這個 2021 年的論文報告，最古早馴化山羊的古代DNA 🐑 

Herded and hunted goat genomes from the dawn of domestication in the Zagros Mountains

世界各地都有兔兔，馴化兔卻只有歐洲的穴兔一種。人類移民美洲後，也與當地的兔兔發生關係，卻沒有類似歐洲的馴化上演。為什麼呢？這個 2021 年的論文主張，可能和不同兔兔的社交習性有關。

Why were New World rabbits not domesticated?