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美洲在一萬多年前,冰河時期結束後,大量大型動物滅團。這個 2023 年的論文深入探討美國西南部的加州,卻發現早於冰河時期結束前已經有不少動物消失,而火災 🔥 是關鍵因素。但是論文強調的人類角色,我覺得十分可疑。

Pre–Younger Dryas megafaunal extirpation at Rancho La Brea linked to fire-driven state shift

1.3萬年前加州大火,動物滅團,人類影響?

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人類活動會影響自然環境,以及周圍的生物,例如不少動物就習慣在人類附近出沒。這個 2023 年的論文報告,早在 3 萬年前的捷克,似乎就有渡鴉跟在人類身邊吃吃喝喝。

Evidence for hunter-gatherer impacts on raven diet and ecology in the Gravettian of Southern Moravia

3萬年前渡鴉,跟人一起享用猛獁象?

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遠遠早於黑死病,5000 年前就有人類感染鼠疫桿菌(Yersinia pestis),針對微生物的古代DNA 研究中這方面探討不少。這個 2023 年的論文報告,4000 年前英國有居民感染鼠疫桿菌,可見當時歐洲大陸的細菌,成功跨海前進不列顛。

Yersinia pestis genomes reveal plague in Britain 4000 years ago  

鼠疫桿菌4000年前入侵英格蘭

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古早人種植葡萄,主要目的是釀葡萄酒。這個 2023 年的論文調查以色列出土 8 世紀的葡萄,發現不只一款品系,當中一款和現代流行的一個品系一模一樣,另外也見到已知最早的白葡萄。

Ancient DNA from a lost Negev Highlands desert grape reveals a Late Antiquity wine lineage

以色列8世紀,白葡萄,黑葡萄

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雞是大家最熟悉的馴化動物之一,這個 2023 年的論文報告將近 2400 年前,彌生時期的雞骨,是至今確認日本最早有雞的紀錄。

The earliest evidence of domestic chickens in the Japanese Archipelago

日本2400年前彌生時期,最早的馴化雞

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埃及斑蚊(Aedes aegypti)本來住在非洲西部,幾百年前才隨著奴隸貿易廣傳世界。另一件事很多人不知道:埃及斑蚊的祖先取食對象更廣,後來才變得特別針對人。這個 2023 年的論文巧妙地利用奴隸貿易作年代尺標,估計專情於人的埃及斑蚊族群,約莫 5000 年前衍生,差不多也是非洲變乾燥的時候。

Dating the origin and spread of specialization on human hosts in Aedes aegypti mosquitoes

埃及斑蚊與人同行,非洲變乾,奴隸貿易,西非城市化

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鼠疫桿菌最知名的大爆炸是黑死病,另外還有一堆大小瘟疫。這個 2023 年的論文鎖定單一一個小國家:丹麥,深入鑽研此處不同年代的狀況,得知從黑死病開始,鼠疫桿菌至少獨立入侵過丹麥 3 次。

Emergence, continuity, and evolution of Yersinia pestis throughout medieval and early modern Denmark

黑死病開始後300年,鼠疫桿菌多次入侵丹麥

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麵包樹原產於大洋洲,除此之外,世界上存在感最高的地區是加勒比海,由歐洲人在兩百多年前引進。這個 2023 年的論文調查各地麵包樹的 DNA,判斷加勒比海地區大部份麵包樹,是英國殖民者於公元 1790 年代從大溪地進口的後裔。

Linking breadfruit cultivar names across the globe connects histories after 230 years of separation

叛艦喋血記之後,送麵包樹到加勒比海

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多久以前的人就會養狗?這個 2022 年的論文報告,西班牙出土 1.7 萬年前的骨頭應該是狗,不是狼或豺。這也是至今比較能確認,歐洲最早狗勾的紀錄。

The domestic dog that lived ∼17,000 years ago in the Lower Magdalenian of Erralla site (Basque Country): A radiometric and genetic analysis

1.7萬年前的西班牙狗勾

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驢子是史上最重要的馴化動物之一,扮演吃重的勞工與駝獸角色。但是講到這個議題通常會排在馬的後面,儘管驢的馴化比馬更早。這個 2022 年的論文探討馴化驢的遺傳史,判斷只有一次馴化,源自 7000 年前的非洲。

The genomic history and global expansion of domestic donkeys

驢子馴化,非洲7000多年前

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單純疱疹病毒(herpes simplex virus)是十分常見的人類病原體,可分為第一型、第二型,第一型又可以分為三大群,非洲的型號最早分家。有人因此推測,它能追溯到智人祖宗離開非洲的時期;卻也有人估計,其實歷史只有幾千年而已。這個 2022 年的論文取得古代基因組,判斷共同祖先為 5000 多年。

Ancient herpes simplex 1 genomes reveal recent viral structure in Eurasia

單純疱疹病毒,在青銅時代起家?

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人類一直與各種傳染病為伍,藉由古代DNA,也有機會探討古早人的疾病。這個 2022 年的論文報告,在希臘 4000 年前的米諾斯文明遺址中,尋獲鼠疫桿菌和傷寒的蹤影。

Ancient Yersinia pestis and Salmonella enterica genomes from Bronze Age Crete

希臘米諾斯文明,4000年傷寒與鼠疫桿菌

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一百多年前公元 1918 年 1 月開始,流感廣傳世界各地,殺傷力相當嚴重,可能消滅數千萬智人,史稱「西班牙流感」。但是照現在政治正確的說法,要稱之為「1918年新型流感」。這個 2022 年的論文取得幾個當時的病毒樣本,探討這場疫情中病毒的變化與適應。

Archival influenza virus genomes from Europe reveal genomic variability during the 1918 pandemic

西班牙流感1918年的遺傳適應

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老鼠有好幾款,如今最常見的家鼠以外,還有大鼠戰隊旗下的褐鼠、黑鼠等等。鼠輩們的分佈常常受到人類活動影響,這個 2022 年的論文調查羅馬帝國以來,歐洲與北非的黑鼠,探討黑鼠的情慾流動史。

Palaeogenomic analysis of black rat (Rattus rattus) reveals multiple European introductions associated with human economic history  

歐洲黑鼠帝國興亡史

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貿易是維京人的一大產業,一項主力商品是海象牙。維京人獵捕大批海象,供應西歐的需求,留下「路易斯棋」等文物。 東歐也有象牙,以前認為主要來自俄羅斯北極區,不是維京人;這個 2022 年的論文卻發現,烏克蘭的基輔,有些海象牙源於相距 4000 公里遠的格陵蘭。

Walruses on the Dnieper: new evidence for the intercontinental trade of Greenlandic ivory in the Middle Ages

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澳洲野犬 dingo 是一款非常獨特的狗勾。狗是狼馴化而來,澳洲野犬似乎是狗,卻不與人一起生活。考古學指出,他們大概是在數千年抵達澳洲,脫離人類走上自己的路。 這個 2022 年的論文調查澳洲野犬的基因組、DNA甲基化、腸道菌,探討與品種養殖狗的差異。

The Australian dingo is an early offshoot of modern breed dogs

澳洲野犬和品種狗,不同的基因組,腸道菌

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16 世紀開始,歐洲勢力大舉殖民美洲,又從非洲引進勞動人口,形成動態的三角形,促進交流,也增添不少苦難。流動的除惹人口與貨物,還有傳染病。這個 2021 年的論文報告,墨西哥城在殖民初期的遺骸牙齒中,發現的微小病毒B19型、B肝病毒。

Ancient viral genomes reveal introduction of human pathogenic viruses into Mexico during the transatlantic slave trade

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伊朗的札格羅斯山區,算是肥沃月灣的最東部,也是一萬多年前,人類轉型為新石器時代的地區之一。這個 2021 年的論文報告,最古早馴化山羊的古代DNA 🐑 

Herded and hunted goat genomes from the dawn of domestication in the Zagros Mountains

伊朗1萬年前最初馴化羊,長得還很野生

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世界各地都有兔兔,馴化兔卻只有歐洲的穴兔一種。人類移民美洲後,也與當地的兔兔發生關係,卻沒有類似歐洲的馴化上演。為什麼呢?這個 2021 年的論文主張,可能和不同兔兔的社交習性有關。

Why were New World rabbits not domesticated?

歐洲兔被馴化,美洲兔為什麼沒有被馴化?

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美洲的狗勾當初隨著人類移民,時間肯定超過一萬年,但是目前仍缺乏直接證據。這個 2021 年的論文報告,阿拉斯加海邊發現一萬多年前的狗勾骨頭。

An early dog from southeast Alaska supports a coastal route for the first dog migration into the Americas

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