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麵包樹原產於大洋洲,除此之外,世界上存在感最高的地區是加勒比海,由歐洲人在兩百多年前引進。這個 2023 年的論文調查各地麵包樹的 DNA,判斷加勒比海地區大部份麵包樹,是英國殖民者於公元 1790 年代從大溪地進口的後裔。

Linking breadfruit cultivar names across the globe connects histories after 230 years of separation

叛艦喋血記之後,送麵包樹到加勒比海

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多久以前的人就會養狗?這個 2022 年的論文報告,西班牙出土 1.7 萬年前的骨頭應該是狗,不是狼或豺。這也是至今比較能確認,歐洲最早狗勾的紀錄。

The domestic dog that lived ∼17,000 years ago in the Lower Magdalenian of Erralla site (Basque Country): A radiometric and genetic analysis

1.7萬年前的西班牙狗勾

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驢子是史上最重要的馴化動物之一,扮演吃重的勞工與駝獸角色。但是講到這個議題通常會排在馬的後面,儘管驢的馴化比馬更早。這個 2022 年的論文探討馴化驢的遺傳史,判斷只有一次馴化,源自 7000 年前的非洲。

The genomic history and global expansion of domestic donkeys

驢子馴化,非洲7000多年前

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單純疱疹病毒(herpes simplex virus)是十分常見的人類病原體,可分為第一型、第二型,第一型又可以分為三大群,非洲的型號最早分家。有人因此推測,它能追溯到智人祖宗離開非洲的時期;卻也有人估計,其實歷史只有幾千年而已。這個 2022 年的論文取得古代基因組,判斷共同祖先為 5000 多年。

Ancient herpes simplex 1 genomes reveal recent viral structure in Eurasia

單純疱疹病毒,在青銅時代起家?

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人類一直與各種傳染病為伍,藉由古代DNA,也有機會探討古早人的疾病。這個 2022 年的論文報告,在希臘 4000 年前的米諾斯文明遺址中,尋獲鼠疫桿菌和傷寒的蹤影。

Ancient Yersinia pestis and Salmonella enterica genomes from Bronze Age Crete

希臘米諾斯文明,4000年傷寒與鼠疫桿菌

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一百多年前公元 1918 年 1 月開始,流感廣傳世界各地,殺傷力相當嚴重,可能消滅數千萬智人,史稱「西班牙流感」。但是照現在政治正確的說法,要稱之為「1918年新型流感」。這個 2022 年的論文取得幾個當時的病毒樣本,探討這場疫情中病毒的變化與適應。

Archival influenza virus genomes from Europe reveal genomic variability during the 1918 pandemic

西班牙流感1918年的遺傳適應

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老鼠有好幾款,如今最常見的家鼠以外,還有大鼠戰隊旗下的褐鼠、黑鼠等等。鼠輩們的分佈常常受到人類活動影響,這個 2022 年的論文調查羅馬帝國以來,歐洲與北非的黑鼠,探討黑鼠的情慾流動史。

Palaeogenomic analysis of black rat (Rattus rattus) reveals multiple European introductions associated with human economic history  

歐洲黑鼠帝國興亡史

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貿易是維京人的一大產業,一項主力商品是海象牙。維京人獵捕大批海象,供應西歐的需求,留下「路易斯棋」等文物。 東歐也有象牙,以前認為主要來自俄羅斯北極區,不是維京人;這個 2022 年的論文卻發現,烏克蘭的基輔,有些海象牙源於相距 4000 公里遠的格陵蘭。

Walruses on the Dnieper: new evidence for the intercontinental trade of Greenlandic ivory in the Middle Ages

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澳洲野犬 dingo 是一款非常獨特的狗勾。狗是狼馴化而來,澳洲野犬似乎是狗,卻不與人一起生活。考古學指出,他們大概是在數千年抵達澳洲,脫離人類走上自己的路。 這個 2022 年的論文調查澳洲野犬的基因組、DNA甲基化、腸道菌,探討與品種養殖狗的差異。

The Australian dingo is an early offshoot of modern breed dogs

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16 世紀開始,歐洲勢力大舉殖民美洲,又從非洲引進勞動人口,形成動態的三角形,促進交流,也增添不少苦難。流動的除惹人口與貨物,還有傳染病。這個 2021 年的論文報告,墨西哥城在殖民初期的遺骸牙齒中,發現的微小病毒B19型、B肝病毒。

Ancient viral genomes reveal introduction of human pathogenic viruses into Mexico during the transatlantic slave trade

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伊朗的札格羅斯山區,算是肥沃月灣的最東部,也是一萬多年前,人類轉型為新石器時代的地區之一。這個 2021 年的論文報告,最古早馴化山羊的古代DNA 🐑 

Herded and hunted goat genomes from the dawn of domestication in the Zagros Mountains

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世界各地都有兔兔,馴化兔卻只有歐洲的穴兔一種。人類移民美洲後,也與當地的兔兔發生關係,卻沒有類似歐洲的馴化上演。為什麼呢?這個 2021 年的論文主張,可能和不同兔兔的社交習性有關。

Why were New World rabbits not domesticated?

歐洲兔被馴化,美洲兔為什麼沒有被馴化?

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美洲的狗勾當初隨著人類移民,時間肯定超過一萬年,但是目前仍缺乏直接證據。這個 2021 年的論文報告,阿拉斯加海邊發現一萬多年前的狗勾骨頭。

An early dog from southeast Alaska supports a coastal route for the first dog migration into the Americas

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這個 2021 年的論文報告,猶他的遺址中發現距今 12300 年前的菸草種子,是已知最古早的菸草使用紀錄。利益申報,本文沒有接受菸商贊助。

Earliest evidence for human use of tobacco in the Pleistocene Americas

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超過距今 4000 年前,美索不達米亞北部(大部分是現在的伊拉克)和敘利亞,尚未引進馴化馬,不過已經有馴化的驢子,以及叫作「Kunga」的馬屬動物,牠們比驢子強大,卻在馬傳入以後漸漸消失。 這個 2022 年的論文首度獲得 Kunga 的古代基因組,發現是馴化驢媽媽,和亞洲野驢爸爸混血的後代。這似乎是人類史上,最早培育的跨物種混血動物。

The genetic identity of the earliest human-made hybrid animals, the kungas of Syro-Mesopotamia

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這個 2022 年的論文,探討雞在什麼時候傳入歐洲,答案是不超過三千年。最有趣的是,雞傳入歐洲各地一開始幾百年,似乎都沒有被當成食物,而是作為稀罕鳥類飼養,角色可能類似鸚鵡?

Redefining the timing and circumstances of the chicken's introduction to Europe and north-west Africa

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馬是重要的馴化動物,馬改變人的歷史,人也改變馬的歷史。這個 2020 年的論文報告,青銅時代以前人類養馬沒有偏好特定性別,但是青銅時代後期開始,公馬的比例占多數。

Horse males became over-represented in archaeological assemblages during the Bronze Age

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各式狗狗都是同一個物種,遺傳差異極為有限,但是體型差異非常大,可以大到如藏獒,也能小到如吉娃娃。這個 2022 年的論文偵測到一個遺傳變異,會影響狗的體型大小,而且追溯下去發現其誕生年代比狗的馴化更早,已經有些古早的狼配備。

Natural and human-driven selection of a single non-coding body size variant in ancient and modern canids

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眾多傳染病當中,肺結核的知名度高,又在世界廣傳,很多真實名人或林黛玉這類虛構角色都有肺結核。這個 2020 年的論文取得 1 個古代肺結核的基因組,來自 17 世紀的北歐。論文認為,肺結核的歷史應該沒有幾萬年,只有幾千年。

A seventeenth-century Mycobacterium tuberculosis genome supports a Neolithic emergence of the Mycobacterium tuberculosis complex

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玉米起源於中美洲,美洲居民耗費數千年培育,玉米也成為傳統文化的重要部分,像玉米大神之類的。這個  2020 年的論文報告,玉米從中美洲傳到南美洲以後,某個時刻又回傳中美洲,或許也促進玉米的普及,讓玉米成為馬雅人的重要糧食。

Archaeological Central American maize genomes suggest ancient gene flow from South America

中美洲2300年前玉米,來自南美洲情慾流動

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