盲眼的尼安德塔石器匠

驢子是史上最重要的馴化動物之一，扮演吃重的勞工與駝獸角色。但是講到這個議題通常會排在馬的後面，儘管驢的馴化比馬更早。這個 2022 年的論文探討馴化驢的遺傳史，判斷只有一次馴化，源自 7000 年前的非洲。

The genomic history and global expansion of domestic donkeys

單純疱疹病毒（herpes simplex virus）是十分常見的人類病原體，可分為第一型、第二型，第一型又可以分為三大群，非洲的型號最早分家。有人因此推測，它能追溯到智人祖宗離開非洲的時期；卻也有人估計，其實歷史只有幾千年而已。這個 2022 年的論文取得古代基因組，判斷共同祖先為 5000 多年。

Ancient herpes simplex 1 genomes reveal recent viral structure in Eurasia

人類一直與各種傳染病為伍，藉由古代DNA，也有機會探討古早人的疾病。這個 2022 年的論文報告，在希臘 4000 年前的米諾斯文明遺址中，尋獲鼠疫桿菌和傷寒的蹤影。

Ancient Yersinia pestis and Salmonella enterica genomes from Bronze Age Crete

一百多年前公元 1918 年 1 月開始，流感廣傳世界各地，殺傷力相當嚴重，可能消滅數千萬智人，史稱「西班牙流感」。但是照現在政治正確的說法，要稱之為「1918年新型流感」。這個 2022 年的論文取得幾個當時的病毒樣本，探討這場疫情中病毒的變化與適應。

Archival influenza virus genomes from Europe reveal genomic variability during the 1918 pandemic

老鼠有好幾款，如今最常見的家鼠以外，還有大鼠戰隊旗下的褐鼠、黑鼠等等。鼠輩們的分佈常常受到人類活動影響，這個 2022 年的論文調查羅馬帝國以來，歐洲與北非的黑鼠，探討黑鼠的情慾流動史。

Palaeogenomic analysis of black rat (Rattus rattus) reveals multiple European introductions associated with human economic history  

貿易是維京人的一大產業，一項主力商品是海象牙。維京人獵捕大批海象，供應西歐的需求，留下「路易斯棋」等文物。 東歐也有象牙，以前認為主要來自俄羅斯北極區，不是維京人；這個 2022 年的論文卻發現，烏克蘭的基輔，有些海象牙源於相距 4000 公里遠的格陵蘭。

Walruses on the Dnieper: new evidence for the intercontinental trade of Greenlandic ivory in the Middle Ages

澳洲野犬 dingo 是一款非常獨特的狗勾。狗是狼馴化而來，澳洲野犬似乎是狗，卻不與人一起生活。考古學指出，他們大概是在數千年抵達澳洲，脫離人類走上自己的路。 這個 2022 年的論文調查澳洲野犬的基因組、DNA甲基化、腸道菌，探討與品種養殖狗的差異。

The Australian dingo is an early offshoot of modern breed dogs

16 世紀開始，歐洲勢力大舉殖民美洲，又從非洲引進勞動人口，形成動態的三角形，促進交流，也增添不少苦難。流動的除惹人口與貨物，還有傳染病。這個 2021 年的論文報告，墨西哥城在殖民初期的遺骸牙齒中，發現的微小病毒B19型、B肝病毒。

Ancient viral genomes reveal introduction of human pathogenic viruses into Mexico during the transatlantic slave trade

伊朗的札格羅斯山區，算是肥沃月灣的最東部，也是一萬多年前，人類轉型為新石器時代的地區之一。這個 2021 年的論文報告，最古早馴化山羊的古代DNA 🐑 

Herded and hunted goat genomes from the dawn of domestication in the Zagros Mountains

世界各地都有兔兔，馴化兔卻只有歐洲的穴兔一種。人類移民美洲後，也與當地的兔兔發生關係，卻沒有類似歐洲的馴化上演。為什麼呢？這個 2021 年的論文主張，可能和不同兔兔的社交習性有關。

Why were New World rabbits not domesticated?

美洲的狗勾當初隨著人類移民，時間肯定超過一萬年，但是目前仍缺乏直接證據。這個 2021 年的論文報告，阿拉斯加海邊發現一萬多年前的狗勾骨頭。

An early dog from southeast Alaska supports a coastal route for the first dog migration into the Americas

這個 2021 年的論文報告，猶他的遺址中發現距今 12300 年前的菸草種子，是已知最古早的菸草使用紀錄。利益申報，本文沒有接受菸商贊助。

Earliest evidence for human use of tobacco in the Pleistocene Americas

超過距今 4000 年前，美索不達米亞北部（大部分是現在的伊拉克）和敘利亞，尚未引進馴化馬，不過已經有馴化的驢子，以及叫作「Kunga」的馬屬動物，牠們比驢子強大，卻在馬傳入以後漸漸消失。 這個 2022 年的論文首度獲得 Kunga 的古代基因組，發現是馴化驢媽媽，和亞洲野驢爸爸混血的後代。這似乎是人類史上，最早培育的跨物種混血動物。

The genetic identity of the earliest human-made hybrid animals, the kungas of Syro-Mesopotamia

這個 2022 年的論文，探討雞在什麼時候傳入歐洲，答案是不超過三千年。最有趣的是，雞傳入歐洲各地一開始幾百年，似乎都沒有被當成食物，而是作為稀罕鳥類飼養，角色可能類似鸚鵡？

Redefining the timing and circumstances of the chicken's introduction to Europe and north-west Africa

馬是重要的馴化動物，馬改變人的歷史，人也改變馬的歷史。這個 2020 年的論文報告，青銅時代以前人類養馬沒有偏好特定性別，但是青銅時代後期開始，公馬的比例占多數。

Horse males became over-represented in archaeological assemblages during the Bronze Age

各式狗狗都是同一個物種，遺傳差異極為有限，但是體型差異非常大，可以大到如藏獒，也能小到如吉娃娃。這個 2022 年的論文偵測到一個遺傳變異，會影響狗的體型大小，而且追溯下去發現其誕生年代比狗的馴化更早，已經有些古早的狼配備。

Natural and human-driven selection of a single non-coding body size variant in ancient and modern canids

眾多傳染病當中，肺結核的知名度高，又在世界廣傳，很多真實名人或林黛玉這類虛構角色都有肺結核。這個 2020 年的論文取得 1 個古代肺結核的基因組，來自 17 世紀的北歐。論文認為，肺結核的歷史應該沒有幾萬年，只有幾千年。

A seventeenth-century Mycobacterium tuberculosis genome supports a Neolithic emergence of the Mycobacterium tuberculosis complex

玉米起源於中美洲，美洲居民耗費數千年培育，玉米也成為傳統文化的重要部分，像玉米大神之類的。這個  2020 年的論文報告，玉米從中美洲傳到南美洲以後，某個時刻又回傳中美洲，或許也促進玉米的普及，讓玉米成為馬雅人的重要糧食。

Archaeological Central American maize genomes suggest ancient gene flow from South America

梅毒一度是非常流行的傳染病（真的非常流行！），起源卻是個謎。有個論點認為梅毒源自美洲，被歐洲人帶回歐洲。這個 2020 年的論文卻報告，在歐洲的遺骸中發現梅毒，年代非常可能比哥倫布抵達美洲更早。

Ancient Bacterial Genomes Reveal a High Diversity of Treponema pallidum Strains in Early Modern Europe

拉脫維亞，位於立陶宛的北邊，波羅地海的東側。這個 2021 年的論文報告，在此發現一位距今 5000 多年的男生，曾經感染鼠疫桿菌，是至今已知最早的紀錄。

A 5,000-year-old hunter-gatherer already plagued by Yersinia pestis