遠遠早於黑死病，5000 年前就有人類感染鼠疫桿菌（Yersinia pestis），針對微生物的古代DNA 研究中這方面探討不少。這個 2023 年的論文報告，4000 年前英國有居民感染鼠疫桿菌，可見當時歐洲大陸的細菌，成功跨海前進不列顛。
Yersinia pestis genomes reveal plague in Britain 4000 years ago
調查地點有 2 處，一處是英格蘭南部的 Charterhouse Warren，另一處是北部的 Levens Park 遺址。檢查 34 位古代人的樣本後，順利由 3 人取樣，拼湊出鼠疫桿菌的基因組。
Charterhouse Warren 遺址是一座多人大墓，長眠此處的死人骨頭，留下許多暴力痕跡，原因不明，應該不是正常的死後埋葬。這兒獲得 2 個鼠疫桿菌基因組，覆蓋率為 8.4 和 6.1。 Levens Park 遺址是正常死亡的單人墓葬，獲得 1 個基因組，覆蓋率為 3.3。
3 人與他們感染的鼠疫桿菌，以及其餘墓葬，年代都是距今 4000 年左右，算是青銅時代。
如今已經有許多鼠疫桿菌的古代基因組，將新樣本加入建構演化樹，3 個不列顛樣本彼此最接近，被歸類在青銅時代廣傳於歐亞大陸西部，距今 2800 到 4700 年前那一大群之內。 遺傳上最相似的為捷克 4200 年前的同類。由此推論，不列顛 4000 年前的鼠疫桿菌應該源自中歐。
鼠疫桿菌傳播時，搭跳蚤便車的能力取決於 ymt 基因，不過此前得知 ymt 要等到 3800 年前才首度出現。這回的不列顛樣本，和那個時期的同類一樣，都沒有 ymt 基因。
大約 4400 年前，不列顛明顯出現來自歐洲的移民潮，後來島上的鼠疫桿菌或許也在後續的交流中隨之而來。四千年前這個時候，DNA 十分相似的細菌，同時存在有點距離的英格蘭南北兩側。
鼠疫桿菌大概不會是慢性感染，若是如此，這回的三位得主，都是在去世前不久感染鼠疫桿菌。但是無法判斷他們的症狀有多嚴重，Charterhouse Warren 的兩人，直接死因更可能是遭受暴力。
即使生前感染細菌，去世那麼久以後，也不見得會留下紀錄；因此，無法得知同一墓葬的其他人，是否有感染鼠疫桿菌。
Levens Park 看起來是正常的墓葬，鼠疫桿菌大概沒有在這兒造成大量死亡。Charterhouse Warren 疑似為一次埋葬很多人的大墓，但是死因大概皆為暴力毆打，和鼠疫桿菌沒有直接關係。
新聞稿：
DNA from 4,000-year-old plague discovered—the oldest cases to date in Britain
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