盲眼的尼安德塔石器匠

知名度高的無尾熊、袋鼠以外，澳洲還有不少有袋類動物。這個 2024 年的論文報告「兔耳袋狸」的基因體學研究，以及已經滅團的近親，小兔耳袋狸的古代基因組。認識這些澳洲特產的動物，增進生物學知識以外，還有其他意義，因為兔耳袋狸也是某些原住民族群文化的象徵。

Extant and extinct bilby genomes combined with Indigenous knowledge improve conservation of a unique Australian marsupial

猛獁象曾經是歐亞大陸北方顯眼的大型動物。西伯利亞北部的 Wrangel 這個地方，一萬多年前由於海水上升成為島嶼，島上的猛獁象從此與同類斷絕交流，直到 4000 年前左右滅團。變成孤立小族群，對猛獁象的遺傳基因造成什麼影響？這個 2024 年的論文做惹一系列有趣的分析。

Temporal dynamics of woolly mammoth genome erosion prior to extinction

大地懶（giant sloths）不少人沒有聽過，或是只有模糊的印象。他們主要住在南美洲，3500 萬年來曾經衍生出大批型號，是當地主流動物之一，如今卻幾乎完全滅團 QQ。這個 2025 年的論文，以體型為主軸，探討大地懶的演化史。

The emergence and demise of giant sloths

「猛獁象」感覺是住在北方，適應寒冷的動物。大多數確實如此，但是近來得知，在氣溫不低的墨西哥也曾經住著不少猛獁象，而且和北邊的同類分家許久。這個 2025 年的論文，由古代DNA 尋求線索。

Columbian mammoth mitogenomes from Mexico uncover the species’ complex evolutionary history

紐西蘭曾經住著許多不會飛的大型鳥類，其中一群叫作「恐鳥」，可惜幾百年前全部滅團惹。這個 2024 年的論文報告一款恐鳥的古代基因組。

A nuclear genome assembly of an extinct flightless bird, the little bush moa

這個 2024 年的論文報告一款奇妙的蝴蝶，和近親的 DNA 相似度超過 99%，外貌卻不像；源自另一種蝴蝶的血緣只有 1% 左右，翅膀顏色等特徵卻高度相似，判斷這種蝴蝶是兩種蝴「合體種化」而成。

Hybrid speciation driven by multilocus introgression of ecological traits

藍馬羚（Hippotragus leucophaeus）是一款住在非洲南部的羚羊。如今沒有活人曾經見過活羚羊，因為他們在公元 1800 年完全滅團。 藍馬羚的羊口數量本來就非常少。這個 2024 年的論文，獲得藍馬羚的古代基因組，判斷數量是真的一直都這麼低，維持很長時間，直到英國人前來殖民......

Colonial-driven extinction of the blue antelope despite genomic adaptation to low population size

熊貓是黑白的，不過也有罕見的棕白組合，只在秦嶺的族群出現。有趣的是，已知棕毛熊貓的父母和小孩，都還是黑毛。這個 2024 年的論文，尋獲讓黑毛變淡成棕色的熊貓基因，是體染色體上基因的隱性變異，父母湊出一對，才會形成棕毛熊貓。

Taking a color photo: A homozygous 25-bp deletion in Bace2 may cause brown-and-white coat color in giant pandas

時間長河中許多生物已經滅團。依然留存的生物，和古時候的同類相比，遺傳多樣性常常降低。這個 2024 年的論文，獲得伊比利亞猞猁的古代DNA，比對發現古時候的猞猁（lynx），DNA 變化竟然更少。

Recent increase in species-wide diversity after interspecies introgression in the highly endangered Iberian lynx

棕熊（Ursus arctos）存活到現在，出沒範圍比古時候小很多。這個 2024 年的論文分析古代DNA，認為不同地區棕熊滅團的時候，也一起損失 DNA 多樣性。

The origins and diversification of Holarctic brown bear populations inferred from genomes of past and present populations

紐西蘭的「南秧雞」是一款不會飛的鳥類，身高約 50 公分。一百多年前以為滅團，公元 1948 年又尋獲殘存成員，目前有個復育中的迷你族群。 南秧雞還有個近親物種「moho」真的已經滅團。這個 2023 年的論文，從死鳥骨頭、博物館皮膚樣本、活鳥取得粒線體 DNA，探討遺傳歷史。

Ancient mitochondrial genomes unveil the origins and evolutionary history of New Zealand's enigmatic takahē and moho

許多動物，女生和男生長得不一樣。有趣的是，有時候某些女生的外貌會很像男生，或是男生看起來很女生。這個 2023 年的論文探討豆娘，一些女生長相男性化的遺傳根源。

The genomics and evolution of inter-sexual mimicry and female-limited polymorphisms in damselflies

如今遍佈世界的馴化貓最初源自中東，各地的野貓近親，許多卻面臨生存危機。 這個 2023 年的論文調查蘇格蘭的野貓，發現雙方有上千年接觸機會，但是一直沒什麼情慾交流。直到 70 年前左右才改變狀況，使得如今的蘇格蘭野貓，多少都配備馴化貓的血緣。

Genetic swamping of the critically endangered Scottish wildcat was recent and accelerated by disease

這個 2023 年的論文，探討古代歐洲野貓和馴化貓的情慾交流。判斷古時候不同款貓貓，DNA 流動很少。

Limited historical admixture between European wildcats and domestic cats

「麝牛」是一款住在北極圈的牛牛，相當適應寒冷的環境。冰河時期結束後許多大型動物滅團，麝牛仍屹立不倒；更厲害的是到這個人類時代，依然沒有滅團危機。

Population genomics of the muskox' resilience in the near absence of genetic variation

這個 2023 年的論文報告，首度發現野生的黑猩猩 🦍，存在更年期。這項研究的對象不是人類，看似與人類演化無關，其實很難說。

Demographic and hormonal evidence for menopause in wild chimpanzees

達爾文當年來到加拉巴哥群島，受到鳥鳥、龜龜等生物啟發，因此島上的鳥鳥被後世稱為達爾文雀。目前達爾文雀可以分為 18 個物種，長得大致類似，不過體型、鳥喙的形狀、大小等特徵不一樣。 這個 2023 年的論文探討 Daphne Major 島上的爾文鳥，鎖定 4 個物種。

Community-wide genome sequencing reveals 30 years of Darwin’s finch evolution

生物的生存都有極限，南美洲的安地斯山脈一些地方海拔超過 6000 公尺，常理想來哺乳類動物應該無法生存。這個 2023 年的論文卻報告，在高山上發現多位勞贖木乃伊，很可能來自長期居住的鼠輩。

Genomic insights into the mystery of mouse mummies on the summits of Atacama volcanoes

近代科學發展幾百年來，博物館等地搜集大量的標本。這個 2023 年的論文報告從「果蠅」的標本取得古代 DNA。或是根據樣本性質，可稱為歷史 DNA。

Genomes from historical Drosophila melanogaster specimens illuminate adaptive and demographic changes across more than 200 years of evolution

野生動物的「突變率」是個奧妙的東西，一般都是用演化樹建構關係，再比對序列差異來估計。這個 2023 年的論文卻直接從野生的鯨魚取樣，三十年來多位鯨魚親子的樣本，直接偵測新突變的狀況。

Wild pedigrees inform mutation rates and historic abundance in baleen whales