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承載遺傳訊息的分子 DNA、RNA、蛋白質,其中 RNA 的結構最不穩定,可能從遺骸中取得古代RNA 嗎? 隨著技術進步,確實有少數成功案例。這個 2023 年的論文報告,從「袋狼」的樣本取得 RNA,讓我們對這款已經滅團的動物,增添一分認識。

Historical RNA expression profiles from the extinct Tasmanian tiger

袋狼古代RNA,絕種動物的基因表現

 

這個論文沒講我還沒想過,RNA 有很多種,從古代樣本中最容易取得的 RNA,其實是病毒。像是流感病毒、WARS、登革熱病毒等等,都是 RNA 病毒。

 

袋狼(thylacine,學名 Thylacinus cynocephalus)和袋鼠、袋獾一樣是屬於袋家的動物,但是如今已經滅團。有一些標本保存,之前曾經從中取得基因組。

 

這項研究的樣本來自斯德哥爾摩自然博物館,距今約 130 年。有兩個部位:骨骼肌、皮膚。同一個生物,不同部位的基因組相同,但是基因表現不一樣。

 

兩種組織中的 RNA,數量最多的都是非編碼 RNA,像是 tRNA 和 rRNA。當然也有編碼的 mRNA,可以對應到不同基因;不同組織的基因表現,符合預期的有所不同。論文描述的很詳細,諸君有興趣麻煩自行閱讀流水帳。

 

比較有趣的是 miRNA,這群可以抑制其他基因表現的短短 RNA,總共有 325 個,而且兩種組織明顯有別。皮膚有 143 個,骨骼肌有 120 個,各自被定量分析。

 

不同組織的基因表現不一樣,可以見到 mRNA 的差異;miRNA 本身也算一類有表現的基因,而且作用是抑制不同基因,那麼不同組織的 miRNA,表現哪些和數量自然也不一樣。

 

基因組上看序列,可以預測很多 miRNA 基因存在,卻不見得是真的。這回的古代RNA 分析,證實這些序列是真的會表現的袋狼 miRNA 基因。還確認其中一個「Tcy-Novel-18」,是專屬於有袋類動物的 miRNA。

 

袋狼古代RNA,絕種動物的基因表現

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新聞:

Tasmanian tiger RNA is first to be recovered from an extinct animal

 

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