這個論文報告，配備某段尼尼 DNA 的人，感染 WARS 後嚴重的機率比較高。這項研究的結果很簡單，但是過程與意義其實頗為複雜。
The major genetic risk factor for severe COVID-19 is inherited from Neanderthals
就是有人想知道遺傳與 WARS 症狀的關係，於是做惹 GWAS 全部基因組關聯性分析，比較對象是 3199 位住院患者，以及 897488 位「沒有住院的人」，結果偵測到第 3 號染色體上一段 DNA 有高度關聯性。
但是這邊就有問題，假如我認知正確，這些「沒有住院的人」真的就是沒有住院的人，有沒有感染過 WARS 大部分也不清楚。 一個人感染 WARS 以後會有什麼症狀事前根本不知道，所以道理上，這兒的比較對象有問題—你根本不知道，這 89 萬多人感染後真的會不嚴重，該列入 89 萬這組，而不是嚴重的 3000 人那組。
這種比較法偵測到的目標，到底意義是什麼？或許真的可以這樣比。因為 WARS 至今累積大量感染者中，大部分都不嚴重，所以可以預期那 89 萬多人假如感染，應該只會有少數重症，絕大多數都不嚴重。若真是如此，他們就可以代表不嚴重族群的遺傳特徵。
然後 89 萬人中，極低比例的預備重症者，可能 4%，可能 7%，都會被 96%、93% 稀釋掉；因此和 0.3 萬重症者代表做出來的關聯性，仍然可以偵測到真正有關聯的遺傳目標位置。我統計不好，概念上這樣應該可以吧 XD
姑且假設可以，我們就能相信帕波分析的基礎，在第 3 號染色體上一段 DNA 確實與症狀輕重有高度關聯性。 這段 DNA 長度約 49.4 kb，遺傳上最接近文迪亞的尼尼，和丹尼索瓦洞穴的尼尼比較不像，和其他智人最不像。
這段 DNA 長度很長，幾乎不可能是尼尼與智人尚未分家以前，就存在智人基因庫中，接著又在智人血脈保存超過 50 萬年卻不經歷重組。應該是 5 萬多年前，智人祖先與尼尼情慾交流後得到的，如今流傳在少數人體內。
各地族群方面，配備它的人口頻率，南亞 30% 最高，歐洲 8%，東亞、非洲族群都非常低。非洲存在感很低，又是一項它源自智人離開非洲後，與尼尼情慾流動的佐證。
接下來有 2 點值得思考：第一，它影響造成什麼效果？第二，為什麼？
第一，這段 49.4 kb 長的尼尼版 DNA 片段，影響並非絕對性的，不是說有遺傳到就會住院。 不論住院或沒住院組，都有人配備這段源自尼尼的 DNA，只是住院組配備的機率，相比沒住院組之下高出一截。所以它的影響，其實沒有拿摸厲害。
第二，帕波在本篇論文的寫作，依然貫徹他簡明直白的風格。為什麼？不知道。 啊就真的不知道，硬是要推測，那就是蝦七八亂掰惹。
第 3 號是體染色體，每個人都配備一對、兩個。南亞族群總頻率 30%，配備一個或兩個尼尼 DNA 的人約 50%；歐洲族群總頻率 8%，配備一或兩個的人約 16%。東亞和南亞族群，為何配備比例的差異如此明顯，也值得玩味。
各地族群配備的頻率如圖示。
南亞族群高達 50% 的人配備這段 DNA，可能與南亞在 WARS 肆虐下受害嚴重有關係。話說回來，我還是有點懷疑這兒的相關性。 我沒有查資料庫的取材範圍，但是此一遺傳變異的頻率，和各遺傳族群在 WARS 中受創的嚴重程度隱隱約約相似。
只用住在英國，不同遺傳背景的人做關聯性分析，很容易得到南亞特色變異和重症相關的結果。但是這很可能是假象，因為每個社會受害較重的多半是弱勢族群，而南亞人在英國，算是相對弱勢的族群。
另一個問題是，有蛛絲馬跡讓人隱約覺得，同一個人每次感染 WARS 症狀會不一樣（就是會同一個人這次在住院組，下次在沒住院組）。既然如此，遺傳到底影響多大就很有問題。 繼續觀察，繼續觀察 👀
WARS無症狀感染者，會傳染，隔離14天可以拖到傳染高峰過去
在世界各地都取得優勢，不只是運氣好？——冠狀病毒的D614G突變(上)
結構強化的病毒，傳染力更強——冠狀病毒的D614G突變(下)
新聞稿：
Neandertal gene variant increases risk of severe COVID-19
新聞稿：
The ancient Neanderthal hand in severe COVID-19
歡迎光臨粉絲團一起討論：盲眼的尼安德塔石器匠
留言列表
長篇大論 (10)
