這個 2017 年的論文,報告袋狼(thylacine,學名 Thylacinus cynocephalus)的古代基因組。澳洲、新幾內亞一帶曾住著許多大型動物,如今絕大部分已經滅絕。袋狼滅團的年代很接近現在,歐洲人抵達後遭到大批獵殺而數量大減,1936 年最後一位成員去世後,世界上再也沒有袋狼這種動物惹 QQ
古代DNA 近來成為探討滅絕生物的利器。許多研究必需由化石取得 DNA,所幸袋狼滅絕的時間還不長(又名塔斯馬尼亞虎 Tasmanian tiger 或塔斯馬尼亞狼 Tasmanian wolf)。這個論文從保存在酒精中,距今 108 年的小袋狼標本,順利拼湊出基因組。
親戚關係上,袋狼、袋鼠、塔斯馬尼亞惡魔(袋獾)皆屬於有袋類(Marsupialia,介於綱與目之間),袋鼠系列屬於雙門齒目(Diprotodontia),與另外兩者較早分家,袋狼和袋獾則屬於袋鼬目(Dasyuromorphia)。論文使用重複序列 SINE 判斷親緣關係,發現在袋鼬目旗下,袋狼應該是很早就分家出去的成員。
根據基因組探討遺傳史,估計族群數目的變化,判斷袋狼和袋獾一樣,都在介於距今 7 到 12 萬年前大幅降低(10 萬年前參與情慾交流的有效族群量是 30 萬左右,一萬年內是一萬以下),比人類抵達澳洲更早許多。
然而,袋狼過往不只住在塔斯馬尼亞,其他地方也有同類。假如袋狼因為生殖隔離,形成過許多小族群,而這回取樣的對象只是其中之一,那麼就會影響估計。這方面必需謹慎。
袋狼與狼分家有 1.6 億年之久,可是型態上,特別是頭部非常相似,顯然是趨同演化的結果。這是怎麼發展而成的?
近來發現,有些不同生物的趨同演化,是由於功能類似的基因,在兩者獨立產生改變而成。換句話說:類似的原料,獨立變出一樣的花樣。
袋狼與狼是上述狀況嗎?論文深入分析型態的演化。袋狼屬於袋狼科,與袋鼬科最接近,兩者共同祖先距今大概 2600 萬年,而袋狼的型態至少在 2000 萬年出現,所以袋狼的祖先自立一家以後,到演化出類似狼的型態,大約經歷 600 萬年。
袋狼與澳洲野犬(dingo)。
採取分子演化的分析方法,論文分別偵測成為袋狼,以及成為狼的演化之路上,有哪些基因受到正向選汰,是否與型態有關。最後的結論是,演化為狼,或是演化為袋狼,兩條路上牽涉其中的基因,彼此沒什麼關係。
據此判斷,狼與袋狼之所以長得像,並非由於同樣的基因,發生一樣的改變所致;而是因為兩條路上不同的遺傳改變,各自導致腦袋像狼,在分子演化上的方式不同。論文推論,型態變得像狼,應該與基因調控的關係較大。
新聞:
Tasmanian tiger genome offers clues to its extinction
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