大猩猩分類為 2 個物種,各 2 個亞種。這個 2023 年的論文比對基因組後,判斷部分大猩猩族群,曾經和已經滅團的神秘親戚有過情慾流動。
Ghost admixture in eastern gorillas
大猩猩的兩個物種,各自住在非洲西部和東部。東部的叫 Gorilla beringei,兩個亞種為「東部低地大猩猩(Gorilla beringei graueri)」和「山區大猩猩(Gorilla beringei beringei)」。
西部的叫 Gorilla gorilla,兩個亞種為「西部低地大猩猩(Gorilla gorilla gorilla)」和「克羅斯河大猩猩(Gorilla gorilla diehli)」。
簡稱西低、西河、東低、東山,也許比較好記?
這個論文主要的分析方法叫作 approximate Bayesian computation,簡稱 ABC,還有其他手法。 由此估計,東西兩個物種的分家年代,約為 96.5 萬年前(72.9 到 110.4 萬年前之間)。住在東部的 2 個亞種,約為 1.5 萬年前分家;西部 2 個亞種則是 45.4 萬年。
常理來說,兩個支系在分家以後,會陸續累積 DNA 變異,分家愈久,累積愈多,大致上會平均分佈於基因組的各處。假如基因組上某些地方差異特別多,便有可能是發生遠古情慾流動,更早分家,累積更多變異的親戚,之 DNA 片段進入基因組。
根據 ABC 分析法的估計,有一群和現今大猩猩們,在 340 萬年前有共同祖先的不明大猩猩,在 3.8 萬年前,與東部大猩猩發生情慾交流,貢獻 2.47% 血緣。
採用不同的分析手法,數字略有出入,但是結論都一樣。那就是東部大猩猩的基因組中,有一絲絲能追溯到分家許久的親戚,在不是太久以前情慾流動而來。
遠古情慾流動的日期,應該早於東部大猩猩兩個亞種分家以前,所以兩款大猩猩都能見到。但是兩群配備的比例不同,山區大猩猩似乎更多一些。
得知智人、尼安德塔人,丹尼索瓦人曾經在分家許久後,又發生情慾流動,是古代DNA 過去十年的重大成就。另外我們的近親黑猩猩、巴諾布,也有過類似狀況。
其餘演化支系衍生的 DNA 變異進入基因組後,留下的機率不均等。實際觀察到,東部大猩猩的 X染色體,比例明顯低於體染色體;或許是由於系統不相容,更容易遭到淘汰。
不過和蛋白質基因相關的序列,原本與外來的 DNA 變異,倒是沒有明顯的差異。有可能是真的沒多大影響,還有個可能是,東部大猩猩的族群很小,天擇力量相對不強,使我們見不到淘汰效果。
近來有趣的觀察是,比對分析愈多,也得知愈多遠古情慾流動。現今已經消失的演化支系,古時候在某個時刻,與分家很久的近親遺傳交流。這種事實際上大概更為普遍。
如果這個論文的分析正確,意思是大猩猩那一群之中,分家超過三百萬年,依然可以順利情慾流動。 假如不是透過混血支系間接轉移,而是真的在分家那麼久以後又直接流動,我暫時覺得好難想像。
新聞稿:
Gene flow from an extinct gorilla population to eastern gorillas discovered
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