象是存在感很大的動物，古時候曾有過很多種象，不過如今只剩 3 種，而且都面臨生存危機。已經滅絕的爪爪中，曾有真猛獁象和菱齒象的基因組被定序成功。這個 2018 年的論文獲得更多古象基因組，探討爪爪家的演化史。
A comprehensive genomic history of extinct and living elephants
via 這裡
分析材料列表。
加上新的定序，這個論文的材料有：
〖還活著的爪爪〗
亞洲象，學名 Elephas maximus
普通非洲象（savanna elephant），學名 Loxodonta africana
非洲森林象（forest elephant），學名 Loxodonta cyclotis
〖已經滅絕的爪爪〗
美洲乳齒象（American mastodon），學名 Mammut americanum
歐洲菱齒象（European straight-tusked elephant），學名 Palaeoloxodon antiquus
哥倫比亞猛獁象（Columbian mammoth），學名 Mammuthus columbi
真猛獁象（woolly mammoth），學名 Mammuthus primigenius
兄弟象（X）
古代基因組中，哥倫比亞猛獁只有 1 個樣本，乳齒象、菱齒象各 2 個，真猛獁象 6 個；現代象皆超過此數目。
喔~~喔喔~~喔喔~~喔喔~爪爪
象家這麼多成員之中，乳齒象與其他象分家最早，論文將其作為比較的外群。其餘 6 種象中，非洲森林象、菱齒象、普通非洲象被歸為一群，又以非洲森林象和菱齒象比較接近；亞洲象、哥倫比亞猛獁、真猛獁象被歸為另一群，當然兩種猛獁比較接近。
眾家爪爪的親緣關係樹。
由此看來，之前對菱齒象的結論－「菱齒象的兄弟是非洲森林象，不是亞洲象」相當正確，然而有惹更多 DNA 作比較後，論文發覺，光是樹狀的親戚關係不夠全面，不足以反映各種爪爪間的情慾流動狀況，特別是菱齒象。
菱齒象的演化史，充滿著情慾交流的痕跡。在爪爪當初分成兩大群，一群是猛瑪與亞洲象，另一群是非洲象與菱齒象祖先之後，菱齒象的祖先，首先與另一大群的哥倫比亞猛瑪情慾交流，估計接收惹 8% 的 DNA。
接著牠們又與自己這一群的非洲森林象發生關係；這波情慾流動很大，估計菱齒象高達 36% 的基因組由此而來。這也是為什麼，樹狀關係圖中，菱齒象會最接近非洲森林象的緣故。
根據古代基因組，建構的情慾交流過程。
在已知樣本中，與菱齒象情慾交流的對象，較接近非洲森林象的西非族群（L. cyclotis_F，取自獅子山共和國），而不是中非族群（L. cyclotis_A，取自中非共和國）。
非洲森林象的中非、西非族群，估計在 46 到 61 萬年前之間分家，因此非洲森林象的西非族群，與菱齒象情慾交流的年代，勢必晚於這個時期；而定序的樣本距今 12 萬年，表示不可能少於 12 萬年。
論文推測雙方碰面的地點，應該是在非洲某處；菱齒象是後來才離開非洲，於歐亞大陸生活。論文提醒，根據已知訊息估計的結果，勢必過於簡陋，實際上爪爪演化的全貌，一定更加複雜。
更詳細的分析，共有 3 種方法估計分家年代，以及族群大小。
是否能把眾家爪爪，每一個混血的階段，對應到化石型態？這就有待未來釐清惹。
論文還做惹很多細緻的分析，各位若有興趣請自行閱讀。
新聞稿：
Researchers sequence complete genomes of extinct and living elephants
歡迎光臨粉絲團一起討論：盲眼的尼安德塔石器匠
留言列表
長篇大論 (10)
