目前分類:人類演化 (61)

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世界大型語族中,南島語族是唯一主要位於島嶼的;它分佈的地理範圍極廣,從太平洋到印度洋都有,最西端甚至來到非洲東部外海的馬達加斯加(面積約為大不列顛的3倍大!)。不過,馬達加斯加的南島語族,遺傳上,卻與其他地方非常不同。

Genomic landscape of human diversity across Madagascar

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台灣應該沒多少人聽過「迦南人(Canaanites)」,就算知道,可能也是讀《聖經》時得知。真實歷史中,迦南人是青銅時代,住在黎凡特的一群人,後來演變為知名度更高的「腓尼基人(Phoenicians)」。擅長航行與貿易的腓尼基人,後來又發展出迦太基,就是出過名將漢尼拔,卻還是被羅馬擊敗的那個迦太基。歷史上,腓尼基人率先發明字母,然而諷刺的是,幾乎沒有他們自己的文獻流傳下來,所以外人要從文字認識腓尼基人與迦南人,只能看他們的鄰居如希臘人,或甚至是敵人,如希伯來人的記錄。

Continuity and Admixture in the Last Five Millennia of Levantine History from Ancient Canaanite and Present-Day Lebanese Genome Sequences

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克羅埃西亞的文迪亞洞穴(Vindija Cave),是個重要的尼安德塔人遺址。2010年出版的第一版尼尼基因組,樣本就取自於此。它有好幾個地層,較晚形成的地層,應該與智人有關;尼尼化石,則出土於比較早的地層,問題是,多早?

Direct dating of Neanderthal remains from the site of Vindija Cave and implications for the Middle to Upper Paleolithic transition

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丹尼索瓦人,最初是藉由古代DNA辨識出的新種hominin。我們完全知道丹丹的DNA長得如何,臼齒之外的型態卻又完全未知。之前一共確認過3位丹丹的存在,數目跟NBA球員詹姆斯的冠軍一樣多,這個2017年的論文,報告惹第4位丹丹。

A fourth Denisovan individual

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伊比利半島位於歐洲的最西端,離亞洲最為遙遠。大概9000年前起,一群中東的農夫移民歐洲;5000年前起,又有一群移民來自草原。這兩波移民潮進入歐洲的位置,都與伊比利半島距離很遠,伊比利當地居民的遺傳組成,曾有過哪些變化? 這個2017年的論文,定序惹14個葡萄牙的古代基因組研究此一問題。

The population genomics of archaeological transition in west Iberia: Investigation of ancient substructure using imputation and haplotype-based methods

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一萬多年前的中東居民,開始仰賴馴化植物、動物過日子,進入新石器時代;接著農業向附近傳播,歐洲各地在隨後數千年間,人們開始種田、養家畜,紛紛經歷新石器轉型。這個2017年的論文,研究位於多瑙河下游盆地(Lower Danube Basin)的古代基因組,希望了解此一地區,新石器轉型的狀況。

Paleogenomic Evidence for Multi-generational Mixing between Neolithic Farmers and Mesolithic Hunter-Gatherers in the Lower Danube Basin

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科學家又獲得一個,年代超過一萬年的古代美洲基因組!這個2017年論文的樣本「Shuká Káa(Man Ahead of Us)」,來自阿拉斯加的On Your Knees Cave遺址,距今約10300年;除此之外,還有3個來自北美洲西北角,1750、2498、6075年前的基因組被一起發表,探討此一區域年代先後,遺傳上的關係。

Ancient individuals from the North American Northwest Coast reveal 10,000 years of regional genetic continuity

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世居青藏高原的圖博人/西藏人,一直是研究高海拔環境下,人類適應的重要對象。這個2017年的論文獲得惹3717位,來自理塘(Litang)和色達(Seda)圖博人的基因組,是至今規模最大的調查。

Genetic signatures of high-altitude adaptation in Tibetans

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相較於其他地方,東亞地區的古代基因組研究很少。這個2017年的論文,由位於俄羅斯遠東地區,地理上很靠近中國與朝鮮的Devil' s Gate遺址,獲得惹距今7700年的「古代基因組」

Genome-wide data from two early Neolithic East Asian individuals dating to 7700 years ago

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人類遺傳史,特別是歐洲的了解近來來突飛猛進。目前歐洲族群大致上可以視為3群組成:最早的採集狩獵族群、8000多年前的安那托利亞農夫,還有5000年前來自草原的移民。歐洲在一萬年內,接受過兩次劇烈的情慾流動,這麼大規模的移民事件,當初是如何發生的呢?外來的族群,是只有行動較為方便的男生,或是有女有男,全族一起移動?

Ancient X chromosomes reveal contrasting sex bias in Neolithic and Bronze Age Eurasian migrations

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古代DNA又多了一個來源。一隊考古學家在安那托利亞,挖掘知名的古代城市「特洛伊」時,發現一個拜占庭帝國(東羅馬帝國)晚期,農村的墳墓,定年結果大概是790到860年前,也就是13世紀早期,當然比特洛伊戰爭的時代晚得多。

A molecular portrait of maternal sepsis from Byzantine Troy

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農業傳入歐洲,是人類歷史上的大事件。這兩年古代DNA的研究,讓我們知道歐洲的農業,是被來自中東,特別是安那托利亞的農夫族群給引進,換句話說,農業與DNA,是一起從中東向歐洲傳播的。  然而,這個2017年的論文報告,來自歐洲東部區域的古代基因組,狀況卻跟歐洲西部很不一樣。

The Neolithic Transition in the Baltic Was Not Driven by Admixture with Early European Farmers

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人類在五萬年前已經抵達澳洲,如今的澳洲原住民是最初移民的後裔,但我們對幾萬年來,澳洲的遺傳史了解卻很有限。這個2017年的論文,從取自1920到1970年代,111個由博物館收藏的澳洲原住民頭髮樣本中,獲取粒線體DNA,研究各地澳洲族群的遺傳史。

Aboriginal mitogenomes reveal 50,000 years of regionalism in Australia

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近年來發達的基因體學,讓科學家能夠更加全面地,比較各種人類族群的遺傳差異,尋找天擇與環境變化,對人類適應造成的影響。之前針對格陵蘭伊努特人的研究發現,他們的去飽和酶基因(fatty acid desaturase,簡稱 FADS)受到正向選汰。之前研究偵測的方法,是比較伊努特人、中國的漢人,還有歐洲人族群間的差異。這個2016年的論文則深入調查,各美洲原住民族群中,去飽和酶基因的狀況。

Genetic signature of natural selection in first Americans

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義大利外海的島嶼薩丁尼亞,位於地中海,即使在冰河時期,海平面最低之際,仍是獨立的島嶼,不與大陸相連。島上最早有人的記錄,距今約1.3萬年。這個2017年的論文蒐集惹,大批薩丁尼亞人的粒線體DNA,包括3491位現代,以及21個古代樣本,分析這個島嶼的遺傳史。

Mitogenome Diversity in Sardinians: a Genetic Window onto an Island's Past

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智人是在非洲起源的生物,在何時離開非洲,走哪些路線前往世界各地,是尚無明確答案的問題。最早的智人不會飛,也不會渡海,只能靠腿走路,因此沿路的環境,勢必會影響遷徙的狀況。離開非洲的第一站,是中東的黎凡特與阿拉伯半島,古代智人的腦袋雖然比起一般動物更加高強,但長距離穿越不毛之地應該還是有困難。這個2016年的論文用大把的氣候資料建立模型,重建過去12.5萬年來,這些地區適宜人居,有機會讓人通行的年代,研究人類遷徙的過程。

Late Pleistocene climate drivers of early human migration

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肥沃月灣地區,大約在12000年前進入農業式生活,接著農業向西傳播,進入安那托利亞,隨後又傳入歐洲。最近研究已知農業進入歐洲時,是與農夫一起傳播,這個2016年的論文,分析惹幾個安那托利亞的古代基因組,研究當年農夫從土耳其向歐洲傳播的過程。

The Demographic Development of the First Farmers in Anatolia

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肥沃月灣在12000年前邁入新石器時代,是世界上最早轉型農業社會的地區。它的西部,黎凡特、美索不達米亞、安那托利亞的農夫族群,以穀物和莢果為主;東部伊朗的札格羅斯(Zagros)地區,則是出現或許尚未馴化的二棱大麥(two row barley),以及世界上最早的山羊,與西部差異明顯。

The genetics of an early Neolithic pastoralist from the Zagros, Iran

FF

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全世界最早的農業社會,出現在中東的肥沃月灣。這個2016年的論文,定序惹位於肥沃月灣東部,也就是現在伊朗的札格羅斯,共7個古代基因組,4個來自距今9000年的Wezmeh Cave遺址(品質最佳的叫作WC1),3個來自10000年前的Tepe Abdul Hosein遺址,研究這群農夫與其他族群的遺傳關係。

Early Neolithic genomes from the eastern Fertile Crescent

F1 

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中東地區的人,在12000年前正式步入農業,成為全世界最早的農夫,隨後農業向各方傳播,永遠改變了人類本身與這個世界。這個2016年的論文,定序了中 東地區,從尚未步入農業社會的採集狩獵族群,一直到青銅時代為止,介於3400到14000年前的44個古代基因組,研究世界上最早農夫族群的遷徙與混血,與中東地區的遺傳史。

Genomic insights into the origin of farming in the ancient Near East

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