雲南，地處東南亞北部、東亞南部的交界，生物多樣性複雜。雲南 1.4 萬年前住著馬鹿洞人，型態看來不太智人，有人覺得他們是當地活比較久的古早人類，或是智人與古早人情慾交流的後裔。 這個 2022 年的論文取得古代DNA，發現遺傳上看來，馬鹿洞人就是普通的智人。
A Late Pleistocene human genome from Southwest China
先說名字，馬鹿洞人來自出土地點叫作馬鹿洞（Malu Dong），但是馬鹿洞也叫作紅鹿洞（Red Deer Cave）；另外人也叫作蒙自人（Mengzi Ren），論文都以 MZR 縮寫表達，我都寫成「馬鹿洞人」。
如今出土 30 件馬鹿洞人化石，來自 1.4 萬年的地層。論文嘗試直接定年化石，不過失敗惹，但是蛛絲馬跡推敲，很可能超過一萬年。
古代DNA 大部份來自耳骨、牙齒，馬鹿洞人卻沒有。這項研究從頭蓋骨 MLDG-1704 取樣，取得覆蓋率 0.113 的殘缺基因組，覆蓋率 125 的粒線體，也得知沒有 Y 染色體，所以她是女生。
盡管型態有些所謂的「古早特徵」，遺傳上從各方面看，她完全是一位智人。她的粒線體屬於 M9 單倍群旗下，如今有兩大分支。 已知 M9 旗下的一支是 M9a'b，主要分佈於東亞北邊一點；另一支是 E，與南島遷徙關係密切。1.4 萬年前馬鹿洞人的 M9 衍生型號，和他們都不一樣，後來大概是失傳惹。
細胞核基因組方面，由於品質殘缺，無法取得太肯定的結論，不過也足以推測大概的趨勢。雲南在東南亞附近，但是遺傳上她不屬於東南亞相關的尼格利陀人、澳洲原住民、巴布亞人那一大群，最接近東亞南方的古代、現代族群，又與東亞北方人群差異較大。
已知馬鹿洞人的 DNA 變異有限，無法太詳細分析，大概能推論馬鹿洞人，是移民到東亞的一大群智人，南北分家以後，屬於南方的成員。至少在 1.9 萬年前，東亞南北方的人群就有遺傳分家的跡象，1 萬年內又發生明顯的情慾交流，陸續合體。
有趣的是，馬鹿洞人和美洲原住民有遺傳淵源。美洲原住民的祖先，約有 60% 多的血緣能追溯到「東亞」，30% 源於「北亞」。 進一步分析，1.4 萬年前的馬鹿洞人，以及 1.9 萬年前的黑龍江人，和美洲原住民的相似度類似，所以美洲原住民獲得「東亞」血緣，應該早於東亞的南北分家以前。
人類演化史上，陸續出現不同的遺傳適應。論文特別討論 2 個基因，影響膚色的 OCA2，以及影響箕形門齒、乳腺等特徵的 EDAR。
EDAR 基因的 V370A 衍生型（rs3827760 由 A 變 G），在東亞、美洲原住民普遍存在。何時誕生不確定，已知 1.9 萬年前的黑龍江人最早配備。馬鹿洞人的基因組沒有抓到這個基因，不知道哪一款，不過 1 萬年前廣西的隆林洞人，4 萬年前東亞北方的田園洞人都沒有。
OCA2 基因的 H615R 衍生型（rs1800414 由 T 變 C），有讓膚色變淺的效果，是影響東亞人膚色的基因之一。已知最古早配備此一變異的人，是 7000 多年前的亮島人二號（所以更早的馬鹿洞人沒有）。距今 4000 年內，OCA2 衍生型的存在感逐漸增加，現代東亞族群約 60%。
馬鹿洞人問世以後，型態特別受到注意。假如 1.4 萬年的年代屬實，那時智人以外的已知物種全數滅團，而馬鹿洞人配備一些明顯的古早特徵，莫非是遠古血脈留存至此時嗎？
可惜沒有驚喜，雲南的馬鹿洞人和鄰居，廣西的隆林洞人一樣，型態上都不太智人，可是遺傳上都是不折不扣的東亞智人。無法排除還有其餘古早人血緣的機率，但是即使存在，也非常微量。他們與同類有別的型態，更可能來自較早智人內部更大的多樣性。
馬鹿洞人配備約 1.27% 的尼安德塔人血緣，以及 1.29% 的丹尼索瓦人血緣。論文說和東亞其他人類似......等下哪裡類似惹 XDDD
沒錯，馬鹿洞人的古早血緣沒有特別多，然而東亞人普遍的遠古混血，尼尼是丹丹的很多倍，馬鹿洞人卻是兩者一樣多，這在血緣屬於東亞南方族群的成員中，印象沒有見過。
馬鹿洞人基因組相當殘缺，不過假如估計無誤，馬鹿人的祖先和其餘智人分家以後，應該又與丹丹相關人士有過情慾流動。所以，也許還會有驚喜？！
箕形門齒 X 美洲原住民 X 母乳—這三者源自冰河時期的神秘關係是？
7200多年前蝙蝠小姐，住在東南亞海島，配備比南島更早的東亞DNA
新聞稿：
DNA from ancient population in Southern China suggests Native Americans' East Asian root
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