盲眼的尼安德塔石器匠

2018 年發表於 Science 期刊的 3 篇論文，詳細報告東非的肯亞 Olorgesailie 盆地的一系列考古研究。關鍵意義在於，30 萬年前的人類，已經出現某些前所未見，更加複雜的行為，轉型進入 Middle Stone Age。

Long-distance stone transport and pigment use in the earliest Middle Stone Age

大約 25000 年前起，西北非出現一種新的文化風格，上世紀的考古學家，研判他們與歐洲南部有關係，於是將其命名為「Iberomaurusian 文化」，也就是伊比利（歐洲的伊比利）－茅利塔尼亞（非洲的 Mauritania）。不過新的古代 DNA 研究發現，似乎不是這麼回事兒。

Pleistocene North African genomes link Near Eastern and sub-Saharan African human populations

安達曼人（Andamanese）是印度旁邊的安達曼群島上的原住民，目前人數相當稀少；外形上比其他智人族群矮小，被視為廣義的「Negrito」族群；親緣上，當年智人祖先離開非洲以後，許多學者認為安達曼人是第一批與其他人分開，之後就少有遺傳交流的後裔。

Genomic analysis of Andamanese provides insights into ancient human migration into Asia and adaptation

  via  這裡

人類，擁有發達的大腦（就算是很笨的人，大腦跟章魚比也算很發達惹，大家不要妄自菲薄！）。大腦是裝在腦袋裡的，腦殼形狀會影響大腦的發育。北非距今 30 萬年的智人，臉部特徵和我們差異不大，表示智人的臉至少在那時已經出現；然而，他們腦袋形狀和我們卻不同，我們頭殼圓，他們頭殼長（如圖示，左長、右圓）。

The evolution of modern human brain shape

古代DNA領域發展至今，大家知道人類的古代基因組，已經有多少發表惹嗎？破千！幾年前，發表一個古代基因組，就是一大成就，如今卻顯得沒什麼特別。該如何推陳出新？這個2017年，取材俄羅斯西北方距今 3.4 萬年 Sunghir 遺址的論文，作出很好的示範。

Ancient genomes show social and reproductive behavior of early Upper Paleolithic foragers

這幾年古代DNA研究，讓我們對人類的過去有了前所未有的認識。然而，跟其他地區相較，東亞一帶的古代DNA研究仍非常稀少；這個2017年的論文，獲得4萬年前，田園洞（Tianyuan Cave）人的完整基因組。

40,000-Year-Old Individual from Asia Provides Insight into Early Population Structure in Eurasia

智人在東南亞的史前活動，所知仍很有限。由近來資訊綜合看來，智人至少在 8 萬年前抵達東亞南方；6.5 萬年前渡海前進澳洲。這個 2017 年的論文報告，蘇門答臘發現距今 6.3 到 7.3 萬年前的智人行蹤。

An early modern human presence in Sumatra 73,000–63,000 years ago

克羅埃西亞的文迪亞洞穴（Vindija Cave），是個重要的尼安德塔人遺址。2010 年出版的第一版尼尼基因組，樣本就取自於此。它有好幾個地層，較晚形成的地層，應該與智人有關；尼尼化石，則出土於比較早的地層，問題是，多早？

Direct dating of Neanderthal remains from the site of Vindija Cave and implications for the Middle to Upper Paleolithic transition

丹尼索瓦人，最初是藉由古代DNA辨識出的新種hominin。我們完全知道丹丹的DNA長得如何，臼齒之外的型態卻又完全未知。之前一共確認過3位丹丹的存在，數目跟NBA球員詹姆斯的冠軍一樣多，這個2017年的論文，報告惹第4位丹丹。

A fourth Denisovan individual

人類在五萬年前已經抵達澳洲，如今的澳洲原住民是最初移民的後裔，但我們對幾萬年來，澳洲的遺傳史了解卻很有限。這個 2017 年的論文，從取自公元 1920 到 1970 年代，111 個博物館收藏的澳洲原住民頭髮樣本中，獲取粒線體 DNA，研究各地澳洲族群的遺傳史。

Aboriginal mitogenomes reveal 50,000 years of regionalism in Australia

近年來發達的基因體學，讓科學家能夠更加全面地，比較各種人類族群的遺傳差異，尋找天擇與環境變化，對人類適應造成的影響。之前針對格陵蘭伊努特人的研究發現，他們的去飽和酶基因（fatty acid desaturase，簡稱 FADS）受到正向選汰。之前研究偵測的方法，是比較伊努特人、中國的漢人，還有歐洲人族群間的差異。這個2016年的論文則深入調查，各美洲原住民族群中，去飽和酶基因的狀況。

Genetic signature of natural selection in first Americans

智人是在非洲起源的生物，在何時離開非洲，走哪些路線前往世界各地，是尚無明確答案的問題。最早的智人不會飛，也不會渡海，只能靠腿走路，因此沿路的環境，勢必會影響遷徙的狀況。離開非洲的第一站，是中東的黎凡特與阿拉伯半島，古代智人的腦袋雖然比起一般動物更加高強，但長距離穿越不毛之地應該還是有困難。這個2016年的論文用大把的氣候資料建立模型，重建過去12.5萬年來，這些地區適宜人居，有機會讓人通行的年代，研究人類遷徙的過程。

Late Pleistocene climate drivers of early human migration

尼安德塔人和丹尼索瓦人的基因組被定序成功時，當時分析就指出住在大洋洲的美拉尼西亞人，與兩種古代hominin都明顯有過混血的跡象，之後研究則認為，東亞居民也配備了少少的丹尼索瓦人血脈。這個2016年的論文採用世界各地159個族群，共1937位現代人的基因組，分析各地族群與古代人種的混血狀況，期望了解更多這段謎團重重的歷史。

Excavating Neandertal and Denisovan DNA from the genomes of Melanesian individuals

智人在幾萬年前離開非洲，前進世界時，與路上遇見的尼安德塔人與丹尼索瓦人有過混血，然後他們就死掉了。現在要追蹤這些事件，除了少少的古代DNA樣本之外，只能分析各地現在的族群，尋找線索。這個2016年的論文，比較全世界120個族群，包含20位近大洋洲居民共257個基因組，希望更加了解與丹尼索瓦人的混血狀況。

The Combined Landscape of Denisovan and Neanderthal Ancestry in Present-Day Humans

歐洲幾十萬年來是尼安德塔人的地盤，最早的智人大概 45000 年前進入歐洲，雙方共存幾千年後，尼安德塔人滅亡，剩下智人獨存。之前研究讓我們對一萬年內的歐洲遺傳史，有相對充分的認識，然而從智人最初進入歐洲到一萬年前這段期間，這幾萬年來所謂「採集狩獵」族群的歷史，所知相當有限。這個 2016 年的論文，定序大批這幾萬年間的古代遺骸，最後共分析 51 個古代樣本，建構幾萬年來的歐洲遺傳史。

The genetic history of Ice Age Europe

尼安德塔人的「全套基因組」已經被定序數年，覆蓋率超過 0.1 的個體也有 5 人之多，但這些樣本都來自女生，所以依然欠缺尼安德塔男生 Y染色體的資訊。這個 2016 年的論文從西班牙 El Sidrón 遺址，距今約 49000 年的男生樣本中，定序出尼安德塔人的 Y染色體 DNA。

The Divergence of Neandertal and Modern Human Y Chromosomes

西班牙距今43萬年的胡瑟裂谷（Sima de los Huesos，簡稱SH）遺址，是整個歐洲非智人hominin化石數目最豐富的遺址，至少有28位個體，約6000件樣本。描述這批化石時，充分體現「hominin 」這名詞的精要－因為一直無法定論這批化石到底屬於什麼人種，所以講hominin最保險、最不出錯。這個2016年的論文，試圖從幾個樣本定序DNA，取得更多資訊。

Nuclear DNA sequences from the Middle Pleistocene Sima de los Huesos hominins

智人離開非洲後，大概在45000年前首次進入歐洲，最近研究讓我們對萬年內歐洲人的遺傳史了解突飛猛進，但更早之前了解仍很有限。人類尚未進入農業時代前，都稱作採集狩獵族群。這個2016年的研究，定序了歐洲各地距今7000到35000年前的35個古代粒線體DNA，希望能更全面認識這段時間歐洲居民的遺傳歷史。

Pleistocene Mitochondrial Genomes Suggest a Single Major Dispersal of Non-Africans and a Late Glacial Population Turnover in Europe ／原本論文的圖有點小錯，修正版

     via 這裡

智人演化上最近的親戚，尼安德塔人與丹尼索瓦人，兩者都滅亡了。智人祖先大概在6萬年前，與尼安德塔人疑似在中東混血，導致如今所有非洲以外的族群，都有源自尼安德塔的DNA。這個2016年的論文，採用更多資料與更新發展的方法，分析混血事件。

Ancient gene flow from early modern humans into Eastern Neanderthals

   via 這裡

丹尼索瓦人是一種透過化石DNA發現的人種，非常幸運，丹尼索瓦人的全套高品質基因組，非常完好的保存在西伯利亞南方，阿爾泰山旁的一小塊小指骨（Denisovan 3）中。遺傳上丹尼索瓦人是尼安德塔人的最近親，然而有關他們的形態，除了一顆很大的牙齒（Denisovan 4）外，我們卻幾乎一無所知。2015年這個論文，報告了新發現的牙齒Denisovan 8，也是第3位確認的丹尼索瓦人。

Nuclear and mitochondrial DNA sequences from two Denisovan individuals