盲眼的尼安德塔石器匠

鴞鸚鵡（Kākāpō，學名 Strigops habroptilus）是紐西蘭特有的一款鳥類，一度減少到 51 位成員，最近復甦到 247 位。這種不會飛的鳥有兩種顏色，這個 2024 年的論文尋獲影響毛色的遺傳差異，推測和古時候猛禽的威脅有關？
The genetic basis of the kākāpō structural color polymorphism suggests balancing selection by an extinct apex predator

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北極熊最近的親戚是棕熊，兩者的差異卻十分明顯。這個 2024 年的論文以數萬年前的古早熊為基準，探討北極熊的 DNA 適應。有意思的是，北極熊似乎沒有專屬於自己的新突變！？
Late Pleistocene polar bear genomes reveal the timing of allele fixation in key genes associated with Arctic adaptation

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牛牛是大家都很熟悉的動物，不過馴化牛的祖先「原牛」已經沒有任何活人見過，因為他們在公元 1627 年後就完全消失惹。這個 2024 年的論文透過古代DNA，探討原牛（aurochs，學名 Bos primigenius）的演化歷史。
The genomic natural history of the aurochs

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古代DNA 的研究，也帶動生物學其他領域進展，這個 2024 年的論文，報告在一款滅團蟾蜍：非洲胎生蟾蜍（Kihansi spray toad，學名 Nectophrynoides asperginis）的皮膚上偵測到蛙壺菌感染。為求簡便，本文之後都稱之為「蟾蜍」。
Archival mitogenomes identify invasion by the Batrachochytrium dendrobatidis CAPE lineage caused an African amphibian extinction in the wild

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知名度高的無尾熊、袋鼠以外，澳洲還有不少有袋類動物。這個 2024 年的論文報告「兔耳袋狸」的基因體學研究，以及已經滅團的近親，小兔耳袋狸的古代基因組。認識這些澳洲特產的動物，增進生物學知識以外，還有其他意義，因為兔耳袋狸也是某些原住民族群文化的象徵。
Extant and extinct bilby genomes combined with Indigenous knowledge improve conservation of a unique Australian marsupial

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猛獁象曾經是歐亞大陸北方顯眼的大型動物。西伯利亞北部的 Wrangel 這個地方，一萬多年前由於海水上升成為島嶼，島上的猛獁象從此與同類斷絕交流，直到 4000 年前左右滅團。變成孤立小族群，對猛獁象的遺傳基因造成什麼影響？這個 2024 年的論文做惹一系列有趣的分析。
Temporal dynamics of woolly mammoth genome erosion prior to extinction

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大地懶（giant sloths）不少人沒有聽過，或是只有模糊的印象。他們主要住在南美洲，3500 萬年來曾經衍生出大批型號，是當地主流動物之一，如今卻幾乎完全滅團 QQ。這個 2025 年的論文，以體型為主軸，探討大地懶的演化史。
The emergence and demise of giant sloths

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「猛獁象」感覺是住在北方，適應寒冷的動物。大多數確實如此，但是近來得知，在氣溫不低的墨西哥也曾經住著不少猛獁象，而且和北邊的同類分家許久。這個 2025 年的論文，由古代DNA 尋求線索。
Columbian mammoth mitogenomes from Mexico uncover the species’ complex evolutionary history

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紐西蘭曾經住著許多不會飛的大型鳥類，其中一群叫作「恐鳥」，可惜幾百年前全部滅團惹。這個 2024 年的論文報告一款恐鳥的古代基因組。
A nuclear genome assembly of an extinct flightless bird, the little bush moa

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這個 2024 年的論文報告一款奇妙的蝴蝶，和近親的 DNA 相似度超過 99%，外貌卻不像；源自另一種蝴蝶的血緣只有 1% 左右，翅膀顏色等特徵卻高度相似，判斷這種蝴蝶是兩種蝴「合體種化」而成。
Hybrid speciation driven by multilocus introgression of ecological traits

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