牛牛是大家都很熟悉的動物，不過馴化牛的祖先「原牛」已經沒有任何活人見過，因為他們在公元 1627 年後就完全消失惹。這個 2024 年的論文透過古代DNA，探討原牛（aurochs，學名 Bos primigenius）的演化歷史。
The genomic natural history of the aurochs
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這回新定序 33 個，加上之前發表，總共 38 個原牛的古代基因組，年代介於 4000 年到超過 4.7 萬年。 另外還有中亞出土的馴化牛（Bos taurus）8 個基因組，介於 3800 到 6400 年前。
現有證據看來，牛屬 Bos 應該起源自南亞；而 65 萬年前已經有原牛抵達歐洲。然而，這回分析的原牛們，共同祖先的年代估計沒有超過 10 萬年。
原牛們在遺傳上大致符合地理，分為三大群。比較早分家的是北亞，較近的是歐洲和西南亞；基因組的分家年代，約為 6.3 到 8.9 萬年前。 而後來的馴化牛，也就是家牛，衍生自 1 萬多年前一小群西南亞的原牛。
與原牛同時，南亞還住著另一款牛牛，印度原牛（Bos namadicus）。他們如今也已經滅團，僅存馴化後裔瘤牛（Zebu，學名 Bos indicus）流傳至今。 瘤牛和原牛基因組的共同祖先，能追溯到 16.6 到 30 萬年前。
ROH 可以評估近親繁殖的程度。品質較佳的 25 個野牛基因組，只有 3 個呈現近期近親繁殖的跡象，兩個樣本還是來自島嶼（西西里、日德蘭）。 由此想來，不是馴化的野牛，在有得選擇的大多數狀況下，會找血緣不親的對象生寶寶。
在數萬年前的時候，原牛、印度原牛，可以視為有 4 款血脈共存。 其中「北亞」的原牛分佈範圍很廣，這回 3 個樣本，包括 4.25 萬年前的俄羅斯西部，1.39 萬年前的亞美尼亞，1.22 萬年前的貝加爾湖，血緣都最為相近，而且和同類的其他支系沒有情慾流動的跡象。
始於 2.6 萬年前的末次冰盛期，對「歐洲」的原牛造成明顯影響。這幾千年寒冷的冰河時期，讓原牛只能限縮在歐洲南部討生活，因此被分隔出伊比利、義大利、巴爾幹三個族群。有趣的是，當氣候回暖後，是伊比利的血脈大幅膨脹，成為此後歐洲原牛的主要血緣。
「西南亞」原牛這回的樣本，包括 7600 年前的土耳其，7100 年前的亞美尼亞，另外在 8800 年前北非的摩洛哥也能見到。他們算是 1 萬多年前被馴化的牛牛的近親。
源於原牛的馴化牛，從何而來？從基因組和母系遺傳的粒線體看來，涉及的個體應該不多，野生的原牛粒線體款式相當多元，馴化牛卻大部份是 T 與 Q。論文認為，後世馴化牛牛的主要血脈，應該源自 1.1 萬年前，短時間內控制的少數個體，而不是更長期的緩慢過程。
在此之後，馴化牛和野生的原牛在許多地區共存，存在情慾交流的機會。 之前研究發現，歐洲、中東的古代馴化牛，曾經和野生近親情慾交流。這回也觀察到在中亞，4000 年前的哈薩克，6400 年前的土庫曼，馴化牛都配備北亞原牛的血緣。
不論男生女生，每一號體染色體都各有兩條。X染色體則是女生兩條，男生一條。所以根據混血 DNA 片段中，X 與體染色體的比例，可以估計情慾流動的兩性比例。 由此得知，和馴化牛交流 DNA 的，大部分是野生男牲。
論文短評：
The genetic legacy of the wild ancestors of modern cattle
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