紅豆（adzuki bean，學名 Vigna angularis）是大家都很熟悉的農作物，起源於中國或是日本，過往沒有定論。這個 2025 年的論文報告，馴化紅豆應該發源於日本，而且影響外貌變紅皮的基因，可能受到人擇的年代，要早於便於採收。
A single domestication origin of adzuki bean in Japan and the evolution of domestication genes
野生紅豆：由南亞向東亞向日本傳播
這個論文大致分為兩部份，前面是紅豆的起源及情慾流動史，後面是 3 個關鍵基因變異的遺傳史。
研究基礎來自各地搜集的 693 個品系。地理範圍從東北亞到南亞，性質包括野生、半野生、馴化紅豆。每個種植馴化紅豆的地區，往往當地也有野生同類。
原產於美洲的番薯，是被洋流還是被人帶到太平洋島嶼的？ 原載於泛科學
番薯的親戚們。A，番薯自己 Ipomoea batatas。B，Ipomoea trifida。C，Ipomoea triloba。D，Ipomoea ramosissima。E，Ipomoea cordatotriloba。F，Ipomoea leucantha。圖／取自 ref 1
番薯（sweet potato）原產中南美洲，早已跨越國界成為相當重要的農作物，不過我們仍不太清楚它在太平洋的起源，是由人類帶過去的？還是在人類之前就擴散到太平洋島嶼中呢？這個問題有著考古學上的意義，當歐洲人船隊抵達太平洋時，許多島上已經存在番薯；一些考古、語言學研究據此認為在歐洲人之前，大洋洲的南島語族與南美洲早已有過接觸交流。
不過最近有學者研究蕃薯與其多種親戚的演化史，反駁美洲與大洋洲早有接觸的論點，卻也引起了許多質疑。這篇論文有兩大部分，前半著重在探討番薯的家族關係；而引起爭議的，是討論太平洋番薯來歷的後部。到底番薯從何而來，大家質疑的又是什麼？[1]
番薯／牽牛花的家族史
咖啡因生產線的趨同演化 原載於泛科學
既然咖啡因正是以咖啡為名，2014年這篇中果咖啡（Coffea canephora）基因組定序的論文[1]，標題除了咖啡基因組外，還加上「咖啡因生合成的趨同演化」，似乎是再自然也不過的事。可惜《咖啡為何要合成咖啡因？咖啡的基因體還說了什麼》一文對這篇論文的內容多有誤會，因此特別為文說明。
咖啡因製程的趨同演化
趨同演化的意思是，演化上沒有直接親緣關係的生物，卻擁有類似的特徵（也就是同功演化），例如鯨魚是哺乳類，與魚類不親，但兩者都演化出適應水生生活的身體構造。用鯨魚跟魚的身體構造舉例只是方便，事實上，趨同演化講的是特徵，不限於器官，因此不同種植物各自演化出製造咖啡因的能力，也是趨同演化。
圖一
馬雅人精選-雌雄同體木瓜 原載於泛科學
PTT上有位鄉民mayaman馬雅人[1]，是台灣首席馬雅專家，不過以下這個發表在《基因體研究（Genome Research）》期刊[2]，馬雅人種木瓜的故事，或許連mayaman都不知道。
好吃的雌雄同體木瓜
木瓜的學名叫做Carica papaya，大家對它的印象就是一種可以吃的水果（提醒大家，木瓜不是土裡種出來的，是長在一棵一棵木瓜樹上）。木瓜的性別有3種，雌、雄、雌雄同體（hermaphrodite），雄木瓜只會產花粉但不結果，雌木瓜假如不授粉，長出來的小木瓜沒人 想吃，唯有雌雄同體的木瓜兼有兩性的特徵，可以自體受精，不需要爸爸，也不需要釘子（別被電影《KANO》騙了！），就能產下又大又甜的木瓜。
