瘧疾是常見的傳染病，所幸歐洲、台灣等地隨著公衛成功，目前沒有本土瘧疾。這個 2024 年的論文由世界各地取樣，尋找古代瘧疾的蹤影，有許多有意思的發現。一個樣本和台灣關係密切，來自西班牙人在基隆的和平島建立的殖民地， 17 世紀中期的「諸聖教堂」遺址。
Ancient Plasmodium genomes shed light on the history of human malaria
很久很久以前，到處都有瘧疾
瘧疾的病原體是瘧原蟲，5 個物種會感染人類，間日瘧原蟲（Plasmodium vivax）、惡性瘧原蟲（Plasmodium falciparum）兩種最普遍。這個論文從資料庫搜尋，檢視一萬多個古代DNA 定序樣本。
一個人沒有偵測到瘧原蟲的 DNA，未必沒有感染瘧疾，不過偵測到的話肯定有。總共尋獲 36 位感染者，位於世界各地 16 個國家，最早距今 5500 年。
10 人感染間日瘧原蟲，21 人惡性瘧原蟲，以及 2 位感染較少見的三日瘧原蟲（Plasmodium malariae）。還有 3 位，同時感染兩種不同的瘧原蟲。
間日瘧原蟲方面，3 個樣本的年代超過 5000 年，分別位於德國、西班牙、俄羅斯。感染者的距離超過 5000 公里，可見當時的歐亞大陸北部，瘧疾已經廣傳。
德國、西班牙的感染者，都住在新石器時代的定居農村。俄羅斯西部的 Gundorovka 遺址，那位感染者的生活方式則是採集狩獵，這表示人口有限的採集狩獵族群也有人會感染瘧疾。
比對古代和現代樣本，歐洲的古代間日瘧原蟲們，彼此的遺傳更加接近，可以推測這款血脈在歐洲長期存續，直到近代被消滅為止。
另外值得注意，相比於其他地區，南美洲的間日瘧原蟲，也更接近歐洲的同類。這支持南美洲的間日瘧原蟲，是歐洲人前往殖民後才傳入的觀點。
失傳的古代血脈，曾經存在台灣
惡性瘧原蟲方面，最早的樣本為 2800 年前，出現在一個出乎意料的地方：喜馬拉雅山上，尼泊爾海拔 2800 公尺高處 Chokhopani 遺址的 CHO001。其次為 2300 年前的歐洲中部。
基隆的和平島（Heping Dao），西班牙人 17 世紀中期建立的「諸聖教堂」，是台灣最早的天主教教堂，最近幾年有相當出色的考古研究。長眠於此的成年男紙 HPD007 曾經感染惡性瘧原蟲，不過無法判斷源自哪兒。
via 基隆和平島，諸聖教堂遺址
奇妙的是遺傳上，包括 2800 年前的喜馬拉雅、400 年前的台灣、80 年前的西班牙 Ebro-1944，惡性瘧原蟲品質比較好的古代樣本彼此較為接近，卻和現代同類有明顯差異。
已知的古代惡性瘧原蟲，遺傳上與某些印度樣本最接近，介於巴布亞新幾內亞、印尼，以及南亞、東南亞的同類之間。這款血脈，如今大概已經失傳。
與上述樣本親戚關係更遠的，是現今非洲、南美洲的同儕。這也佐證南美洲的惡性瘧原蟲，是歐洲殖民以後，再從非洲帶到美洲。
美洲原本沒有瘧疾
瘧疾是歷史上威脅很大的小壞壞，也影響不少人的遺傳基因。美洲原住民的基因組卻沒什麼因應瘧疾的變異，這使得一派觀點主張，美洲原本沒有瘧疾，是歐洲殖民以後才從歐亞非洲傳來。
這回的發現支持上述觀點，美洲的惡性瘧原蟲應該源於非洲，而間日瘧原蟲來自歐洲。
垂直入侵高山
最值得一提的美洲古代樣本，來自南美洲的安地斯山區，秘魯的 Laguna de los Cóndores 遺址的 LDC020。這位 15 或 16 世紀的男紙完全為原住民血緣，生活於歐洲人抵達附近不久後。
驚奇的是，他也長眠於海拔 2800 公尺處，和前面提到的喜馬拉雅先生一樣。瘧原蟲由蚊子傳播，照理說那麼高冷的環境蚊子飛不上去。論文認為合理的解釋是，他們曾經去過低海拔，在外地感染瘧疾，人又返回，或來到高海拔地帶後去世。
他們生活的地點，都能見到物慾流動的跡象，瘧疾多半也源於該處。 秘魯先生長眠於安地斯山東部，他體內的間日瘧原蟲，很可能源於亞馬遜。喜馬拉雅先生的惡性瘧原蟲，大概能追溯到印度方向。
新聞稿：
新聞：
Oldest malaria cases reveal how humans spread the disease across the globe
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