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挪威北部的外海,自古以來就是豐饒的漁場,在羅弗敦半島(Lofoten Archipelago)捕獲的大西洋鱈(Atlantic cod,學名  Gadus morhua),被送往北海與波羅的海沿岸,以及更遠的歐洲各地。 歷史文獻與之前的考古學研究顯示,挪威北部與歐洲其他地區的長距離漁業貿易,在中世紀早期,11世紀時就已經存在。2017年的論文報告,這樣的漁業貿易至少在維京時期已經出現。

Ancient DNA reveals the Arctic origin of Viking Age cod from Haithabu, Germany

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狗是人類最早的馴化動物,人與狗建立關係比發明農業更早。然而狗是在何時、何地、如何馴化,至今仍沒有明確的答案。這困難的問題,古代DNA看似能夠解答,去年獲得的第一個古狗基因組,當時的推論是,狗至少在東方與西方,各自被馴化過一次,而東方狗後來取代惹西方狗。 這個 2017 年的論文,又獲得 2 個古狗基因組,分析後得到的結論,卻與去年的研究完全相反:狗只需要被馴化過一次,歐洲的西方狗,也沒有被東方狗取代。

Ancient European dog genomes reveal continuity since the Early Neolithic

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現在全世界的馬,遺傳多樣性非常有限,尤其是父系都能追溯到不久以前的幾位馬爸爸,這當然是人為育種的結果。然而父系遺傳的 Y染色體,由於上頭充斥重複序列,不容易定序,所以各 Y染色體型號間的關係不太清楚。這個 2017 年的論文克服技術困難,大手筆的定序世界各地 21 個品系,共 52 位男馬,並且採用普氏野馬和驢子當外群,研究大家的親戚關係。

Y Chromosome Uncovers the Recent Oriental Origin of Modern Stallions

 

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馬在五千多年前於歐亞草原西部被馴化,此後陸續傳播到各地,大幅影響人類的歷史,亞洲北方的遊牧族群將馬應用的得心應手,例如成吉思汗率領的蒙古馬隊。不過,馴化馬並不是蒙古原生的動物,馬是在何時,又是何種狀況下傳入蒙古草原的呢?

A Bayesian chronology for early domestic horse use in the Eastern Steppe

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古代DNA又多了一個來源。一隊考古學家在安那托利亞,挖掘知名的古代城市「特洛伊」時,發現一個拜占庭帝國(東羅馬帝國)晚期,農村的墳墓,定年結果大概是790到860年前,也就是13世紀早期,當然比特洛伊戰爭的時代晚得多。

A molecular portrait of maternal sepsis from Byzantine Troy

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藉由性行為傳播的疾病,叫作性病。人類乳突病毒(human papillomaviruses,簡稱HPVs)是一群以雙股DNA存在,基因組8 Kb大,可能造成人類性病的病毒。不過感染HPV未必會有症狀,約有80%性生活活躍的成年人,一生中至少感染過一次某個型號的HPV。HPV的演化史可以推論,它們應該與人類共存惹相當一段時間。這個2016年的論文研究惹各型號的HPV16,以及它們古時候和hominin之間的演化關係,特別是分家的年代。

Transmission Between Archaic and Modern Human Ancestors During the Evolution of the Oncogenic Human Papillomavirus 16

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與人類的關係非常密切,是人類尚未進入農業社會,還在採集狩獵的時候,第一種馴化成功的動物。狗是從狼馴化而來,這點 100% 確定,然而狗究竟被馴化多久、在哪裡被馴化、馴化過幾次,都是學界爭論不休的問題,而且神奇的是,許多提出相異論點的不同研究,單獨看起來好像都是對的。

Genomic and archaeological evidence suggest a dual origin of domestic dogs

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赫赫有名的鼠疫桿菌(Yersinia pestis),歷史上至少有3波超級疫情爆發。第一次的查士丁尼瘟疫,約發生在1500年前的東歐拜占庭帝國;第二次就是知名的黑死病,大概出現在600多年前的歐洲;最後一次距今不久,19世紀中起源自中國南方,主要疫情在1894年,後來擴散至全世界,前後延續百餘年。死神般的鼠疫桿菌,是如何起源與演化的?

Early Divergent Strains of Yersinia pestis inEurasia 5,000 Years Ago

鼠疫 via 這裡

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