歐洲中世紀，流行多元麻風病 @ 盲眼的尼安德塔石器匠

麻風（leprosy）也叫作漢生病，是由麻風桿菌（Mycobacterium leprae）引發的傳染病，幾千年前就有文獻記載，至今仍流行於世界各地。這個 2018 年的論文，由歐洲中世紀的遺骸取得 10 個麻瘋桿菌的基因組，了解這種疾病的傳播歷史。

Ancient genomes reveal a high diversity of Mycobacterium leprae in medieval Europe

麻瘋病在歐洲，應該至少存在數千年之久，於 12 到 14 世紀來到高峰，16 世紀以後漸漸減少，後來幾乎完全消失。根據遺傳差異，麻瘋桿菌可以分為數個分支，稱為 branch 0 到 5，其中 branch 0 最早與親戚分家。

之前研究曾經取得零星的古代麻瘋桿菌 DNA，不過考量到麻瘋曾經是歐洲各地普遍的疾病，少數樣本或許不足以反映這種疾病傳播與分佈的全貌。另外非人類動物，像是歐亞紅松鼠（red squirrel）與某些靈長類，也都會感染麻瘋桿菌。

這個論文從歐洲各地的遺骸，偵測其中的麻瘋桿菌，樣本有：

義大利 2 個，前 4 到 7 世紀

英國 1 個，5 到 6 世紀

匈牙利 4 個，7 到 11 世紀

捷克 1 個，9 到 12 世紀

丹麥 87 個，11 到 14 世紀

採取 PCR 初步篩選，加上本戰隊研發，用於偵測古代樣本中微生物的「MEGAN alignment tool（MALT）」，最後共有 10 個高品質的麻瘋桿菌基因組被拼湊成功，覆蓋率介於 7 到 59.8 之間。

年代最古早的，來自英國 Great Chesterford 遺址，年代介於公元 415 到 545 年間（大概算是盎格魯薩克森時期的早期），成為至今已知最古早的古代麻瘋桿菌。有趣的是，這位 5 世紀、另一位 13 世紀的英國，以及 5 位丹麥古人，感染麻瘋的型號都屬於 branch 3，與今日英國的歐亞紅松鼠型號一樣。論文認為，這支持中世紀毛皮貿易，是一種麻瘋傳播方式的論點。

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丹麥的 St. Jørgen 墓地，介於 12 到 14 世紀的遺骸中則是同時有 3 個分支共存：branch 0、2F、3。表示當時感染歐洲人的麻瘋品系已經相當多元。估計不同麻瘋分支共同祖先的年代，論文採取兩種方法，一種結果介於 3403 到 5828 年之間，平均距今 4515 年前；另一種則是 3110 到 5020 年間，平均距今 4031 年前。兩種方法估計麻瘋品系的結果，都早於三千年，很可能比四千年更老。