玉米（Zea mays）是當今世界上最主要的農作物之一，最早大概在9000年前，被中美洲居民馴化、開始種植。等到4000年前，玉米傳往美國西南，卻要再等2000年左右，才普遍在美國西南的高海拔地區出現。圖片雖然很像被啃過的玉米，不過它們來頭不小，不是普通的玉米，是1900年前，第一批於美國西南，高海拔地帶種植的陳年老玉米。
Genomic estimation of complex traits reveals ancient maize adaptation to temperate North America
這個2017年的論文，定序惹來自猶他，海拔1830公尺高的 Turkey Pen Shelter 遺址，當中陳年老玉米的基因組，尋找玉米適應高海拔的線索。
玉米出現在各地的年代。
已經知道不少，玉米基因與性狀之間的關係。比較古代玉米基因組，跟現代玉米品系以後，論文發現猶他山上的古早玉米，遺傳上看起來，特徵是開花較早、較矮、分櫱（tillering，分穗數目）較多。論文推測，這些基因版本的組合，大概跟高海拔環境中，更冷、較短的生長季有關。
把各樣本，拆解成9個遺傳組成。
玉米發源於平地，由大芻草（teosinte）馴化而成，幾千年來，在墨西哥和美國多處，曾經人為培育出多款，能夠種植於高海拔的玉米品系。分析遺傳組成後，論文發現，1900年前的猶他玉米，遺傳上跟美國西南，Puebloan 印地安人培育的品系比較接近，卻很不像墨西哥各地的玉米。因此論文推論，猶他山上的玉米，不是外地傳入，而是當地居民，嘗試數千年育種後，自行研發出的成品。拍拍手～拍拍拍～～～
各玉米支系間的親戚關係，與情慾流動。
論文主要有2點結論，第一，有助於適應高海拔環境，種植玉米的各款基因版本，早就已經存在，但是要等到幾千年後，才被培育為正確的組成（例如開花、身高等性狀，都是由很多基因控制）。第二，猶他老玉米，之所以可以在山上種植，是本地的努力，不是外地引進。
個人覺得，2點都有某些問題，都跟分析方法有關。第一，論文的分析方式，是偵測已經知道，跟某些性狀（如開花）有關的遺傳變異，卻不是直接比較古代，跟其他環境下玉米的基因組，尋找哪些遺傳變異與適應有關。這樣當然只會找到一堆，早就已經知道的基因版本。
用ananassae果蠅，兩性肚子色素差異，研究趨同演化的遺傳機制
第二，適應這回事，可以由引進新的少數有利基因達成，而不影響大部份基因組（這種案例這幾年看得多惹！例如源自丹尼索瓦人的 EPAS1）。所以即使大部份祖源，都跟附近的玉米一致，也無法排除，有利於高海拔適應的遺傳變異，不是先由其他地方引進，再於本地配種的可能性。論文的分析方法，無法分辨有利適應，是外來引入或是本地產生，兩種不同來源的差異。
有待繼續研究。
新聞稿：
Farmers selected maize for agricultural use at high elevations
Nature新聞：
Ancient genomes show how maize adapted to life at high altitudes
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