盲眼的尼安德塔石器匠

真猛獁象（woolly mammoth，學名 Mammuthus primigenius）是一款已經滅團的古代大象，如今從化石中拼湊出幾個古代基因組。這個 2022 年的論文深入探討的議題是：消失的基因！？

Evolutionary consequences of genomic deletions and insertions in the woolly mammoth genome

單純疱疹病毒（herpes simplex virus）是十分常見的人類病原體，可分為第一型、第二型，第一型又可以分為三大群，非洲的型號最早分家。有人因此推測，它能追溯到智人祖宗離開非洲的時期；卻也有人估計，其實歷史只有幾千年而已。這個 2022 年的論文取得古代基因組，判斷共同祖先為 5000 多年。

Ancient herpes simplex 1 genomes reveal recent viral structure in Eurasia

台灣現代的公衛發達，民眾通常沒有寄生蟲的問題。但是古時候世界各地人類的身體裡，普遍存在各種寄生蟲。這個 2022 年的論文深入調查劍橋古代的居民，驚訝地發現，當時生活比較高端的修士，有寄生蟲的比例，竟然明顯比衛生低落的農夫更高。

Intestinal parasite infection in the Augustinian friars and general population of medieval Cambridge, UK

誰在馬丘比丘終老？來自印加帝國各地，還有遙遠的亞馬遜  原載於泛科學

馬丘比丘（Machu Picchu）可謂世界知名的遺跡，觀光客前仆後繼。後世外人神秘的想像下，這兒其實是印加帝國王室冬季渡假的離宮，平時有一批工作人員長住。公元 2023 年發表的論文，透過古代 DNA 分析，證實這群人來自南美洲各地。

越南兩千年古早味咖哩？香料的食慾流動  原載於泛科學

大多數台灣人對東南亞、南亞風格的香料不陌生，甚至有些常見的香料，不特別查詢還不知道起源於東南亞。 一項 2023 年問世的研究，調查將近兩千年前，越南南部的遺址，見到多款香料植物的蹤跡。證實那個時候已經有多款香料，從南亞或東南亞外海的島嶼，傳播到東南亞大陸。

人類的祖先與黑猩猩分家以來，誕生過不少物種。已知年代最早的查德猿人距今 700 萬年左右。 這個 2022 年的論文報告，股骨分析指出查德猿人似乎已經會直立行走，表示雙足直立，或許是人與黑猩猩分家不久後便存在的特徵。

Postcranial evidence of late Miocene hominin bipedalism in Chad

人類一直與各種傳染病為伍，藉由古代DNA，也有機會探討古早人的疾病。這個 2022 年的論文報告，在希臘 4000 年前的米諾斯文明遺址中，尋獲鼠疫桿菌和傷寒的蹤影。

Ancient Yersinia pestis and Salmonella enterica genomes from Bronze Age Crete

這個 2023 年的論文報告西藏／圖博的古代基因組，我覺得結果很奇妙，跟以前許多人的認知不一樣。青藏高原的移民史，不是一群人帶著青稞上山那麼簡單。

Human genetic history on the Tibetan Plateau in the past 5100 years

分類學上，西瓜屬於葫蘆科旗下的西瓜屬（Citrullus）。 西瓜起源於非洲，不過還有好幾款西瓜的親屬。這個 2022 年的論文由非洲東北部，出土的 2 個瓜子取得古瓜基因組，得知它們都不是甜甜的紅肉西瓜 🍉

Genome sequencing of up to 6,000-yr-old Citrullus seeds reveals use of a bitter-fleshed species prior to watermelon domestication

歐洲人抵達美洲時，中美洲的阿茲特克是最威武的強權。儘管史料相當有限，這個 2023 年的論文依然從歷史紀錄拼湊這個「帝國」的財政狀況。 結果發現這兒的貧富差距驚人的大，稱呼其為韭菜帝國毫不為過。歐洲人抵達後，阿茲特克為什麼迅速垮台，也有經濟面的解釋。

Income and inequality in the Aztec Empire on the eve of the Spanish conquest

雲南，地處東南亞北部、東亞南部的交界，生物多樣性複雜。雲南 1.4 萬年前住著馬鹿洞人，型態看來不太智人，有人覺得他們是當地活比較久的古早人類，或是智人與古早人情慾交流的後裔。 這個 2022 年的論文取得古代DNA，發現遺傳上看來，馬鹿洞人就是普通的智人。

A Late Pleistocene human genome from Southwest China

馬雅潘位於猶加敦半島，現在屬於墨西哥境內。在 13 到 15 世紀前半這兒是馬雅世界高高在上的政治中心，接著盛極而衰。歐洲殖民者 16 世紀抵達時，當地人對此只剩下記憶，所幸經歷的時光還不太久，能留下一些紀錄。 這個 2022 年的論文用各種手法調查馬雅潘，最重要的發現是馬雅潘崩潰時，同時面臨內戰與乾旱。

Drought-Induced Civil Conflict Among the Ancient Maya

古生物學家尼爾．蘇賓，以發現 3.75 億年前的提塔利克魚（Tiktaalik roseae），還有科普書《我的身體裡有一條魚》聞名。這個 2022 年的論文，報告一款提塔利克魚的近親，奇妙的是從肢體看來他們的祖先已經初步登陸，可是又回到水裡生活。

A new elpistostegalian from the Late Devonian of the Canadian Arctic