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古代 DNA 研究至今,對歐洲的了解最多,即使如此,仍有許多有待探索的問題。之前已知,歐洲經歷過來源各異的採集狩獵、中東農夫、草原移民潮;這個 2018 年的論文則鎖定歐洲東部與南部,獲得 2500 到 14000 年前 225 個古代基因組;發現一些更具體,不同祖源間直接情慾交流的跡象。

The genomic history of southeastern Europe

 歐洲東南,採集狩獵、農夫、草原祖源,情慾流動的第一現場

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人為頭骨改造(artificial cranial deformation),也就是在寶寶的頭形尚未成熟時,以外力改變頭殼的形狀,達到美觀之類的文化目的,在許多古文化出現過,包括 5 世紀時的歐洲。這個 2018 年的論文,以古代 DNA 的分析方法,研究同一地點,有無頭骨改造的遺骸,彼此間遺傳上是否有差異。

Population genomic analysis of elongated skulls reveals extensive female-biased immigration in Early Medieval Bavaria

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加勒比海地區大約 2500 年前才有人入住,是整個美洲最晚的;之後又經過超過一千年,才有人移民巴哈馬,那時已經是 1400 年前惹。哥倫布抵達美洲時,生活於那一帶-大安地列斯群島(Greater Antilles)、小安地列斯群島(Lesser Antilles)北部、巴哈馬的人,稱作「泰諾人(Taíno)」。

Origins and genetic legacies of the Caribbean Taino

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歐洲大約 4500 到 4750 年前,許多地方出現一種新的陶器風格,稱作 Bell Beaker,許多遺址中都出現此款陶器與一些相關裝備;這波流行文化到 3800 到 4200 年前結束。Bell Beaker 的流行與傳播,和人的遷徙有關嗎?這個 2018 年的論文,由歐洲各地獲得距今到 2800 到 6700 年之間,高達 400 個古代基因組,其中有 226 個樣本與 Bell Beaker 有關。為求方便,之後姑且稱為「BB陶器人」。

The Beaker phenomenon and the genomic transformation of northwest Europe

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非洲有著悠遠綿長的人類演化史,至今研究卻相對稀少。這個 2017 年的論文,獲得 15 個來自東、南非的古代基因組,讓我們更加認識非常繁複、所知卻十分有限的非洲遺傳史。另外也提供惹一些,智人起源的線索。

Reconstructing Prehistoric African Population Structure

東非、南非古代基因組-非洲遺傳史,與全人類的起源

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古遺傳學家最近成功獲取,大批非洲的古代 DNA。由於人類起源自非洲,因此非洲的古代 DNA,能帶給我們許多智人演化的寶貴新知。這個 2017 年的論文,獲得 7 個南非的古代基因組。一大推論是:現代人分家的年代,估計至少距今 26 萬年。

Southern African ancient genomes estimate modern human divergence to 350,000 to 260,000 years ago

南非古代基因組-桑族人有外來混血,現代人分家至少26萬年?

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大約 9000 年前起,住在安那托利亞的農夫全家向歐洲移民,把依賴農業維生,定居的生活方式,以及他們自己的 DNA 一起帶進歐洲。歐洲隨後幾千年,各地都建立新石器式的農村。

Parallel palaeogenomic transects reveal complex genetic history of early European farmers

歐洲新石器時代農夫,分別與附近的採集狩獵族群情慾交流

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古埃及人幾千年來製作過大批木乃伊,成為後人寶貴的研究材料。1907 年時在中埃及 Deir Rifeh 發現的 2 個木乃伊,年代屬於中王國時期的第 12 王朝(公元前 1773 到 1985 年),他們不是法老,不過應該來自權貴之家,去世後被葬在一起,關係似乎是一家人。

The kinship of two 12th Dynasty mummies revealed by ancient DNA sequencing

古埃及貴族「兄弟木乃伊」,血緣是不是兄弟?

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2018 年第一個問世的古代人類基因組,來自阿拉斯加 Upward Sun River(USR)遺址,是一位沒能長大的小女嬰 QQ。在她去世 1.15 萬年以後,古遺傳學家取得她的基因組,覆蓋率高達 17,分析後驚覺她是美洲原住民,卻不屬於任何一個已知的支系。

Terminal Pleistocene Alaskan genome reveals first founding population of Native Americans

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北歐,也就是斯堪地那維亞半島,一聽就是很冷的地方,因為冰河時期太冷,使得此處成為整個歐洲最後才有人類成功移民的地方,那時已經是 11700 年前惹。最早的北歐人,是哪兒來的呢?

Population genomics of Mesolithic Scandinavia: Investigating early postglacial migration routes and high-latitude adaptation

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巴布亞新幾內亞與澳洲的原住民,是非洲以外的人類中,與大家分家最久的。新幾內亞於一萬多年前,獨立發展出自己的農業,是全世界最早的農業起源地之一;另外也以語言千變萬化,難以歸類聞名於世。此一地區,人類獨立發展過數萬年,與其他地方交流相對較少,遺傳史應該很有趣。

A Neolithic expansion, but strong genetic structure, in the independent history of New Guinea

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歐洲在新石器時代晚期,與隨後的青銅時代早期,也就是距今約4到5千年前,社會經歷過明顯的改變。古代遺傳學研究則顯示,當時有大批源自草原的 DNA 融入歐洲族群,不過詳情仍有許多未知。這個 2017 年的論文,分析位於現在德國的巴伐利亞,萊希(Lech)河谷的 7 個遺址中,84 位古人的遺骸,研究當時的社會狀況。

Female exogamy and gene pool diversification at the transition from the Final Neolithic to the Early Bronze Age in central Europe

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復活節島(Easter Island,也叫 Rapa Nui)是個小島,以巨大的摩艾(Moai)石像知名。它位於太平洋上,有些靠近南美洲,有些學者認為在與歐洲人接觸以前,島上居民曾經與南美洲人有過情慾交流。這個 2017 年的論文定序島上 5 個古代基因組,調查此事。

Genetic Ancestry of Rapanui before and after European Contact

古代復活節島居民,沒有與美洲人交流DNA

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南高加索(South Caucasus)在地理上,位於安那托利亞東方,中東北方,黑海與裡海之間的南方。這個地區在歷史上經歷過多次,明顯的文化轉型與外族移民;遺傳學家當然好奇,此地的遺傳史。 這個2017年的論文,由現在的亞美尼亞(Armenia)和阿爾札赫(Artsakh),取得年代介於300到7800年前,共52個古代粒線體DNA,以及現代人的206個,再加上以前其他研究發表過的樣本,研究南高加索族群的母系遺傳史。

Eight Millennia of Matrilineal Genetic Continuity in the South Caucasus

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世界大型語族中,南島語族是唯一主要位於島嶼的;它分佈的地理範圍極廣,從太平洋到印度洋都有,最西端甚至來到非洲東部外海的馬達加斯加(面積約為大不列顛的3倍大!)。不過,馬達加斯加的南島語族,遺傳上,卻與其他地方非常不同。

Genomic landscape of human diversity across Madagascar

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台灣應該沒多少人聽過「迦南人(Canaanites)」,就算知道,可能也是讀《聖經》時得知。真實歷史中,迦南人是青銅時代,住在黎凡特的一群人,後來演變為知名度更高的「腓尼基人(Phoenicians)」。擅長航行與貿易的腓尼基人,後來又發展出迦太基,就是出過名將漢尼拔,卻還是被羅馬擊敗的那個迦太基。歷史上,腓尼基人率先發明字母,然而諷刺的是,幾乎沒有他們自己的文獻流傳下來,所以外人要從文字認識腓尼基人與迦南人,只能看他們的鄰居如希臘人,或甚至是敵人,如希伯來人的記錄。

Continuity and Admixture in the Last Five Millennia of Levantine History from Ancient Canaanite and Present-Day Lebanese Genome Sequences

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伊比利半島位於歐洲的最西端,離亞洲最為遙遠。大概9000年前起,一群中東的農夫移民歐洲;5000年前起,又有一群移民來自草原。這兩波移民潮進入歐洲的位置,都與伊比利半島距離很遠,伊比利當地居民的遺傳組成,曾有過哪些變化? 這個2017年的論文,定序惹14個葡萄牙的古代基因組研究此一問題。

The population genomics of archaeological transition in west Iberia: Investigation of ancient substructure using imputation and haplotype-based methods

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一萬多年前的中東居民,開始仰賴馴化植物、動物過日子,進入新石器時代;接著農業向附近傳播,歐洲各地在隨後數千年間,人們開始種田、養家畜,紛紛經歷新石器轉型。這個2017年的論文,研究位於多瑙河下游盆地(Lower Danube Basin)的古代基因組,希望了解此一地區,新石器轉型的狀況。

Paleogenomic Evidence for Multi-generational Mixing between Neolithic Farmers and Mesolithic Hunter-Gatherers in the Lower Danube Basin

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科學家又獲得一個,年代超過一萬年的古代美洲基因組!這個2017年論文的樣本「Shuká Káa(Man Ahead of Us)」,來自阿拉斯加的On Your Knees Cave遺址,距今約10300年;除此之外,還有3個來自北美洲西北角,1750、2498、6075年前的基因組被一起發表,探討此一區域年代先後,遺傳上的關係。

Ancient individuals from the North American Northwest Coast reveal 10,000 years of regional genetic continuity

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世居青藏高原的圖博人/西藏人,一直是研究高海拔環境下,人類適應的重要對象。這個2017年的論文獲得惹3717位,來自理塘(Litang)和色達(Seda)圖博人的基因組,是至今規模最大的調查。

Genetic signatures of high-altitude adaptation in Tibetans

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