義大利外海的島嶼薩丁尼亞,位於地中海,即使在冰河時期,海平面最低之際,仍是獨立的島嶼,不與大陸相連。島上最早有人的記錄,距今約1.3萬年。這個2017年的論文蒐集惹,大批薩丁尼亞人的粒線體DNA,包括3491位現代,以及21個古代樣本,分析這個島嶼的遺傳史。
Mitogenome Diversity in Sardinians: a Genetic Window onto an Island's Past
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義大利外海的島嶼薩丁尼亞,位於地中海,即使在冰河時期,海平面最低之際,仍是獨立的島嶼,不與大陸相連。島上最早有人的記錄,距今約1.3萬年。這個2017年的論文蒐集惹,大批薩丁尼亞人的粒線體DNA,包括3491位現代,以及21個古代樣本,分析這個島嶼的遺傳史。
Mitogenome Diversity in Sardinians: a Genetic Window onto an Island's Past
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肥沃月灣地區,大約在12000年前進入農業式生活,接著農業向西傳播,進入安那托利亞,隨後又傳入歐洲。最近研究已知農業進入歐洲時,是與農夫一起傳播,這個2016年的論文,分析惹幾個安那托利亞的古代基因組,研究當年農夫從土耳其向歐洲傳播的過程。
The Demographic Development of the First Farmers in Anatolia
肥沃月灣在12000年前邁入新石器時代,是世界上最早轉型農業社會的地區。它的西部,黎凡特、美索不達米亞、安那托利亞的農夫族群,以穀物和莢果為主;東部伊朗的札格羅斯(Zagros)地區,則是出現或許尚未馴化的二棱大麥(two row barley),以及世界上最早的山羊,與西部差異明顯。
The genetics of an early Neolithic pastoralist from the Zagros, Iran
全世界最早的農業社會,出現在中東的肥沃月灣。這個2016年的論文,定序惹位於肥沃月灣東部,也就是現在伊朗的札格羅斯,共7個古代基因組,4個來自距今9000年的Wezmeh Cave遺址(品質最佳的叫作WC1),3個來自10000年前的Tepe Abdul Hosein遺址,研究這群農夫與其他族群的遺傳關係。
Early Neolithic genomes from the eastern Fertile Crescent
中東地區的人,在12000年前正式步入農業,成為全世界最早的農夫,隨後農業向各方傳播,永遠改變了人類本身與這個世界。這個2016年的論文,定序了中 東地區,從尚未步入農業社會的採集狩獵族群,一直到青銅時代為止,介於3400到14000年前的44個古代基因組,研究世界上最早農夫族群的遷徙與混血,與中東地區的遺傳史。
Genomic insights into the origin of farming in the ancient Near East
海拔很高的青藏高原是個寒冷、乾燥的地方,這個 2016 年的論文從尼泊爾的Annapurna Conservation Area(安納布爾納保留區),取得 8 個數千年前的古代基因組,研究古代喜馬拉雅族群的遺傳組成。
最早的農業在中東起源,考古記錄顯示,8000多年前,農業開始由安那托利亞傳入歐洲,也就是現在愛琴海兩側的土耳其與希臘。之前研究已經知道,農業進入歐洲時是人與技術一起移動,生產方式伴隨著移民潮,不過對於農夫進入歐洲的第一站愛琴地區,還沒有詳細研究。這個2016年的論文,從取自希臘與安那托利亞的7個樣本定序古代DNA,包括5個基因組,研究最早的農夫移民與其他族群間的關係。
Early farmers from across Europe directly descended from Neolithic Aegeans
不列顛在歷史上歷經過數波移民,約兩千年前的鐵器時代結束後,羅馬帝國勢力進入,控制部分不列顛領土,直到 4 世紀,也就是約 1600 年前結束。這段羅馬帝國對不列顛的殖民統治,給不列顛人帶來多少遺傳上的影響?
Genomic signals of migration and continuity in Britain before the Anglo-Saxons
現在的英國人,是歷史上各波移民的後代,這些移民來自不同的時間與地點,組成現在的英國族群。如今英國各地的居民,遺傳上有多少差異?這個2015年的論文,大規模搜集2039位英國各地居民的基因組資料,比較各地居民遺傳上的不同。
The fine-scale genetic structure of the British population
從數萬年前智人離開非洲,到一萬多年前農業在中東發明,並陸續傳播到各地的這段期間,人類生活的形態就是採集狩獵。這些各時各地的「採集狩獵族群」,遺傳上可能很不一樣,不過目前了解仍很有限。這個 2015 年的論文,定序 2 個喬治亞西方的高加索地區,以及 1 個瑞士的樣本。
Upper Palaeolithic genomes reveal deep roots of modern Eurasians
愛爾蘭距今約5750年前出現農業,接著在4300年前進入金屬器時代。近來幾個古代DNA的研究,讓我們大致知曉歐洲幾千年前的遺傳歷史。愛爾蘭島位於歐洲邊緣,居民也跟其他歐洲地區一樣,是源於採集狩獵、早期農夫、東歐大草原的遺傳組成嗎?
Neolithic and Bronze Age migration to Ireland and establishment of the insular Atlantic genome
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「冰人奧茨」生活在 5300 年前,新石器時代的義大利阿爾卑斯山區,40 歲時在海拔3 000 公尺高的雪地去世,死後天然木乃伊化,是目前已知幾千年前,保存最完好的古代人。由於環境得天獨厚,冰人的 DNA 是最早被定序成功的古代人之一(幾個以前寫過的論文,都有這位老班底在裡面)。
至今不少古代基因組被定序成功,大大增進我們對人類遺傳史的知識,然而,由於非洲氣候不利DNA保存,一直都無法取得古代DNA的一手資訊,也就無法追溯這個遺傳多樣性世界最高,人類起源地的遺傳史。這個2015年的論文,從
原本論文:Ancient Ethiopian genome reveals extensive Eurasian admixture throughout the African continent
最初的農業起源於一萬多年前的中東,有了農業以後,人類邁入新石器時代,接著8000多年前位於現在土耳其,安那托利亞地區的農夫,又把農業向西傳入歐洲。這個2016年的論文,定序了來自安那托利亞西北方Kumtepe遺址的樣本「Kum6」,研究安那托利亞與歐洲早期農夫間的遺傳關係。
Genomic Evidence Establishes Anatolia as the Source of the European Neolithic Gene Pool
近來古代DNA 研究,讓我們對美洲族群的遺傳史了解增進不少。如今多數美洲原住民的祖先,是當初冰河時期時從西伯利亞跨越白令陸橋,再南下美洲,然而作為遷徙的關鍵通道,目前我們對一萬多年前白令地區的居民,遺傳上卻沒多少了解。這個 2015 年的論文定序來自阿拉斯加(東白令),Upward Sun River(USR)遺址的 2 個粒線體 DNA。
Two contemporaneous mitogenomes from terminal Pleistocene burials in eastern Beringia
古代DNA技術的進步,讓科學家能以前所未有的方式,加入研究歷史的行列。這個2015年的論文,在之前的基礎上再接再厲,一共大手筆分析從8000到2000多年前,歐亞大陸西邊230位古代人的基因組,研究這幾千年來各地人群的組成變化、遷徙,以及適應環境的遺傳史。
Genome-wide patterns of selection in 230 ancient Eurasians
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美洲在幾百年前歐洲人到來之前,曾有過不少人口與發達的文化,但隨著殖民者的剝削、奴役與疾病,相當多原住民陸續死去,加上大批外來人口移入,使得現在的美洲人族群,與歐洲人尚未到來前的遺傳組成相當不同。這個 2015 年的論文,獲得 500 年前一位秘魯木乃伊的粒線體DNA,讓我們對當時的了解更增一分。
The complete mitogenome of a 500-year-old Inca child mummy
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農業起源於1萬多年前的肥沃月灣,後來傳入歐洲,約7500年前開始進入歐洲最西端的伊比利半島。農業的生活形態,取代全歐洲各地本來的採集狩獵。2015年這個論文定序了在西班牙Atapuerca的El Portalón遺址找到,8個年代介於3500到5500年之間的古代基因組DNA,他們都過著農業生活。
Ancient genomes link early farmers from Atapuerca in Spain to modern-day Basques
之前所有遺傳學研究都指出,如今美洲原住民的祖先,當初都是來自西伯利亞的單一族群,沒有其他地方的人牽涉其中。這個 2015 年的論文大規模調查各個美洲原住民族群,檢查有沒有西伯利亞與美洲之外的遺傳來源,結果有意料之外的發現。
Genetic evidence for two founding populations of the Americas
美洲是人類最後才踏上的大陸,最近幾個研究一致認為,美洲原住民當初是從西伯利亞跨越白令陸橋而來,不過更詳細的細節,像是進入美洲的時間,進入過幾次,有沒有西伯利亞之外的其他族群牽涉其中等等問題,仍有待研究。2015年這個大規模的族群遺傳學研究,新定序了31位現代人,以及23個年代介於200到6000年前的古代美洲人基因組,希望回答更多問題。
Genomic evidence for the Pleistocene and recent population history of Native Americans