不列顛在歷史上歷經過數波移民,約兩千年前的鐵器時代結束後,羅馬帝國勢力進入,控制部分不列顛領土,直到 4 世紀,也就是約 1600 年前結束。這段羅馬帝國對不列顛的殖民統治,給不列顛人帶來多少遺傳上的影響?
Genomic signals of migration and continuity in Britain before the Anglo-Saxons
不列顛在歷史上歷經過數波移民,約兩千年前的鐵器時代結束後,羅馬帝國勢力進入,控制部分不列顛領土,直到 4 世紀,也就是約 1600 年前結束。這段羅馬帝國對不列顛的殖民統治,給不列顛人帶來多少遺傳上的影響?
Genomic signals of migration and continuity in Britain before the Anglo-Saxons
現在的英國人,是歷史上各波移民的後代,這些移民來自不同的時間與地點,組成現在的英國族群。如今英國各地的居民,遺傳上有多少差異?這個2015年的論文,大規模搜集2039位英國各地居民的基因組資料,比較各地居民遺傳上的不同。
The fine-scale genetic structure of the British population
從數萬年前智人離開非洲,到一萬多年前農業在中東發明,並陸續傳播到各地的這段期間,人類生活的形態就是採集狩獵。這些各時各地的「採集狩獵族群」,遺傳上可能很不一樣,不過目前了解仍很有限。這個 2015 年的論文,定序 2 個喬治亞西方的高加索地區,以及 1 個瑞士的樣本。
Upper Palaeolithic genomes reveal deep roots of modern Eurasians
愛爾蘭距今約5750年前出現農業,接著在4300年前進入金屬器時代。近來幾個古代DNA的研究,讓我們大致知曉歐洲幾千年前的遺傳歷史。愛爾蘭島位於歐洲邊緣,居民也跟其他歐洲地區一樣,是源於採集狩獵、早期農夫、東歐大草原的遺傳組成嗎?
Neolithic and Bronze Age migration to Ireland and establishment of the insular Atlantic genome
via 這裡
「冰人奧茨」生活在 5300 年前,新石器時代的義大利阿爾卑斯山區,40 歲時在海拔3 000 公尺高的雪地去世,死後天然木乃伊化,是目前已知幾千年前,保存最完好的古代人。由於環境得天獨厚,冰人的 DNA 是最早被定序成功的古代人之一(幾個以前寫過的論文,都有這位老班底在裡面)。
至今不少古代基因組被定序成功,大大增進我們對人類遺傳史的知識,然而,由於非洲氣候不利DNA保存,一直都無法取得古代DNA的一手資訊,也就無法追溯這個遺傳多樣性世界最高,人類起源地的遺傳史。這個2015年的論文,從衣索比亞高原的洞穴中,獲得4500年前採集狩獵族群「Mota」樣本,他的基因組定序後(來自耳骨,petrous bones),coverage高達12.5。
Ancient Ethiopian genome reveals extensive Eurasian admixture in Eastern Africa
原本論文:Ancient Ethiopian genome reveals extensive Eurasian admixture throughout the African continent
最初的農業起源於一萬多年前的中東,有了農業以後,人類邁入新石器時代,接著8000多年前位於現在土耳其,安那托利亞地區的農夫,又把農業向西傳入歐洲。這個2016年的論文,定序了來自安那托利亞西北方Kumtepe遺址的樣本「Kum6」,研究安那托利亞與歐洲早期農夫間的遺傳關係。
Genomic Evidence Establishes Anatolia as the Source of the European Neolithic Gene Pool
近來古代DNA 研究,讓我們對美洲族群的遺傳史了解增進不少。如今多數美洲原住民的祖先,是當初冰河時期時從西伯利亞跨越白令陸橋,再南下美洲,然而作為遷徙的關鍵通道,目前我們對一萬多年前白令地區的居民,遺傳上卻沒多少了解。這個 2015 年的論文定序來自阿拉斯加(東白令),Upward Sun River(USR)遺址的 2 個粒線體 DNA。
Two contemporaneous mitogenomes from terminal Pleistocene burials in eastern Beringia
古代DNA技術的進步,讓科學家能以前所未有的方式,加入研究歷史的行列。這個2015年的論文,在之前的基礎上再接再厲,一共大手筆分析從8000到2000多年前,歐亞大陸西邊230位古代人的基因組,研究這幾千年來各地人群的組成變化、遷徙,以及適應環境的遺傳史。
Genome-wide patterns of selection in 230 ancient Eurasians
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美洲在幾百年前歐洲人到來之前,曾有過不少人口與發達的文化,但隨著殖民者的剝削、奴役與疾病,相當多原住民陸續死去,加上大批外來人口移入,使得現在的美洲人族群,與歐洲人尚未到來前的遺傳組成相當不同。這個 2015 年的論文,獲得 500 年前一位秘魯木乃伊的粒線體DNA,讓我們對當時的了解更增一分。
The complete mitogenome of a 500-year-old Inca child mummy
via 這裡
農業起源於1萬多年前的肥沃月灣,後來傳入歐洲,約7500年前開始進入歐洲最西端的伊比利半島。農業的生活形態,取代全歐洲各地本來的採集狩獵。2015年這個論文定序了在西班牙Atapuerca的El Portalón遺址找到,8個年代介於3500到5500年之間的古代基因組DNA,他們都過著農業生活。
Ancient genomes link early farmers from Atapuerca in Spain to modern-day Basques
之前所有遺傳學研究都指出,如今美洲原住民的祖先,當初都是來自西伯利亞的單一族群,沒有其他地方的人牽涉其中。這個 2015 年的論文大規模調查各個美洲原住民族群,檢查有沒有西伯利亞與美洲之外的遺傳來源,結果有意料之外的發現。
Genetic evidence for two founding populations of the Americas
美洲是人類最後才踏上的大陸,最近幾個研究一致認為,美洲原住民當初是從西伯利亞跨越白令陸橋而來,不過更詳細的細節,像是進入美洲的時間,進入過幾次,有沒有西伯利亞之外的其他族群牽涉其中等等問題,仍有待研究。2015年這個大規模的族群遺傳學研究,新定序了31位現代人,以及23個年代介於200到6000年前的古代美洲人基因組,希望回答更多問題。
Genomic evidence for the Pleistocene and recent population history of Native Americans
人類與黑猩猩的共同祖先大約在700萬年前的非洲分家,直到200萬年前左右才走出非洲,進入歐亞大陸,散佈到整個舊世界。然而不管是直立人、海德堡人、尼安德塔人,都沒有成功進入新世界的證據,要一直等到近2萬年,智人才跨越白令海峽,進入美洲新大陸。
The genome of a Late Pleistocene human from a Clovis burial site in western Montana
1到2萬年前的冰河時期時,有群人從西伯利亞出發,行經那時被冰封的白令海峽,來到阿拉斯加,之後一路向南遷徙,在新大陸四散,他們就是如今美洲原住民的祖先。然而近萬年前早期美洲移民的化石,形態卻常與今日的美洲原住民不同,導致如今的美洲原住民,究竟是全部源於同一個古代大族群的遷徙,或是來自更多次不同族群的移動,一直存在爭議。
Late Pleistocene Human Skeleton and mtDNA Link Paleoamericans and Modern Native Americans
各大洲中,美洲是人類最後踏上的大陸,包含北阿拉斯加、加拿大、格陵蘭的「北美北極區(North American Arctic)」是整個美洲最後被人類定居的地區。約 6000 年前愛斯基摩人從西伯利亞跨越白令海峽,移民此地後,這塊地方留下了連續又豐富的考古記錄。
The genetic prehistory of the New World Arctic
言語如風,語言在出口的瞬間即逝,無法保存,但講話者的DNA可能仍然留存著。印歐語系是世界上一大主要語系,旗下共有400多種語言,它的起源為何已經爭論了200年,一個假說是它起源自8000多年前的小亞細亞,另一派認為是5000多年前的東歐草原。如今這個2015年古代DNA的研究,強烈支持草原假說。
Massive migration from the steppe was a source for Indo-European languages in Europe
歐亞大陸在新石器時代之後,於3000到5000年前這段時間進入青銅時代,經歷劇烈的文化轉變,然而這些改變是因為人群遷徙,或來自概念交流不得而知。想了解人類族群遷徙的歷史,古代DNA定序是威力強大的武器,2015年這個大規模的族群基因體學研究,大手筆定序了年代跨越數千年的101個古代人類基因組,希望能回答這個問題。
Population genomics of Bronze Age Eurasia
「肯納威克人(Kennewick Man)」是位約8500年前的男生,1996年時在美帝西北角的華盛頓州,屬於美帝陸軍工兵隊(US Army Corps of Engineers)的土地上被發現。這具骨骸雖然沒有什麼神奇魔力,卻引發眾人爭奪,幾個美國原住民部落引用「美國原住民族墓穴保護及歸返法案(Native American Graves Protection and Repatriation Act,縮寫NAGPRA)」,要求擁有這件死人骨頭。
The ancestry and affiliations of Kennewick Man