盲眼的尼安德塔石器匠

公衛調查，必需知道某種傳染病是否存在，但是檢驗不一定容易。2023 年孟加拉、尼泊爾的隊伍，嘗試用一種簡單又便宜的手法尋找傷寒，那就是檢驗會感染傷寒的噬菌體。

Viruses in sewage help to pinpoint typhoid hotspots

華勒斯的演化論與生物地理學，源自亞馬遜的燦爛之火  原載於泛科學

公元 1823 年華勒斯在英國誕生，於 1913 年以 90 歲高壽去世，今年 2023 年是他誕生 200 年。我們懷念他是因為，他曾經和達爾文聯名發表演化觀點，以及提出解釋東南亞海島間生物分佈差異的「華勒斯線」。

這個 2023 年的論文有許多台灣人的貢獻，不過角色是擔任實驗動物 QQ。使用英國、韓國、台灣、加拿大的資料探討肺癌，最關鍵的新知是：即使不增加致癌突變，空氣汙染導致的發炎，也會增加罹患肺癌的機率。

Lung adenocarcinoma promotion by air pollutants

考古、古生物、古人類學研究，膠原蛋白漸漸成為一種重要的材料。不同動物的膠原蛋白略有不同，即使形貌無存，也有機會用膠原蛋白判斷所屬。這個 2021 年的論文報告，丹尼索瓦洞穴的調查。 🐂 🐑 🦊 🐘 🦏 🐆 🐎 🐻

Zooarchaeology through the lens of collagen fingerprinting at Denisova Cave

這個 2021 年的論文，由高加索地區，喬治亞 Satsurblia 洞穴的沉積層泥土取樣，獲得距今約 2.5 萬年的人、狼、牛的古代DNA。

Genome-scale sequencing and analysis of human, wolf, and bison DNA from 25,000-year-old sediment

16 世紀開始，中國製造的瓷器大量進入歐洲，造成流行風潮，不過更早之前已經有少量中國瓷器傳入歐洲。這個 2021 年的論文報告，歐洲最西端的西班牙，9 到 11 世紀的時候，已經存在少量源自中國的瓷器，或許是中國瓷器在西歐最古早的紀錄。

The earliest Chinese ceramics in Europe?

符號，是象徵思維的展現，心靈的載體。智人以外，西班牙的尼安德塔人也有過刻畫符號的紀錄。這個 2021 年的論文報告，超過 5 萬年前的德國，尼尼疑似在一件鹿骨上刻下線條痕跡。

A 51,000-year-old engraved bone reveals Neanderthals’ capacity for symbolic behaviour

體型較大的動物移民島嶼後，由於島上資源不足，體型可能會縮小，稱作「島嶼侏儒化」。本來很大隻的犀牛、爪爪會變小隻。這個 2021 年的論文報告，歐洲大陸的大象，來到情義西西里島後，變成迷你爪爪的過程。

Estimating the dwarfing rate of an extinct Sicilian elephant

伊朗的札格羅斯山區，算是肥沃月灣的最東部，也是一萬多年前，人類轉型為新石器時代的地區之一。這個 2021 年的論文報告，最古早馴化山羊的古代DNA 🐑 

Herded and hunted goat genomes from the dawn of domestication in the Zagros Mountains

這個 2022 年的論文報告兩款狒狒間的情慾交流。他們被歸類為不同物種，但是依然可以正常生寶寶。比對 DNA 卻察覺異種 DNA 傳承時，某些特定位置留下的機率比較低，天擇似乎悄悄地在排斥異己。此一狀況可能類似智人祖先，碰上尼安德塔人、丹尼索瓦人的情形。

Selection against admixture and gene regulatory divergence in a long-term primate field study

環境DNA猛獁象現蹤，化石消失幾千年後才真正滅團？  原載於泛科學

一萬多年前冰河時期結束後，許多地方的生態系明顯改變，例如歐亞大陸和美洲的猛獁象都滅絕了，僅有少少倖存者，殘存於北冰洋的小島一直到 4000 年前。上述認知來自對化石遺骸的判斷，可是最近由環境沉積物中取樣古代 DNA 分析，卻指出猛獁象等幾種生物，在亞洲和美洲大陸其實又延續了好幾千年。這些證據可靠嗎，猛獁象到底什麼時候滅絕？

青藏高原是高海拔的缺氧環境，長居此處的圖博／吐蕃／西藏人，除惹農牧和生活方式的轉變，也有些遺傳適應，最出名的是 EPAS1 基因。圖博族群的 EPAS1 來自丹尼索瓦人，可是基因組其他地方卻沒有更多丹丹成分。這個 2021 年的論文，探討它的遺傳來歷。

The history and evolution of the Denisovan-EPAS1 haplotype in Tibetans

從古代 DNA 摸索身體裡的人類大歷史  本書推薦文

公元二○二二年的諾貝爾生理或醫學獎頒發給帕波（Svante Pääbo），表揚他將尼安德塔人 DNA 重現於世的貢獻。尼安德塔人去世已久，僅存遺骸；從這類樣本中取得的 DNA，稱作古代 DNA。相關研究起步於一九八○年代，尼安德塔人基因組可謂集大成之作。帕波當年為了克服難關，組建龐大的團隊，《我們源自何方？》（Who we are and how we got here）的作者賴克（David Reich）正是其中的主要成員。