如今地球上各地,物種的分佈狀況如何,哪些地方的遺傳多樣性比較高?這個2016年的論文蒐集大筆資料,定量分析全球尺度下,陸生與兩棲動物,在各個區域的物種與種內的遺傳多樣性。
An Anthropocene map of genetic diversity
如今地球上各地,物種的分佈狀況如何,哪些地方的遺傳多樣性比較高?這個2016年的論文蒐集大筆資料,定量分析全球尺度下,陸生與兩棲動物,在各個區域的物種與種內的遺傳多樣性。
An Anthropocene map of genetic diversity
當初研究人類基因組,投入大筆資源,發展DNA定序技術的一大理由是,增進對遺傳與疾病間關係的了解。時至今日,已經有不少基因組被定序成功,科學家也得知許多遺傳變異和疾病間的潛在關係,這使得遺傳診斷,來到前所未有的境界。然而,所知畢竟仍很有限。這個2016年的論文報告深具野心的大計劃「Exome Aggregation Consortium(ExAC)」,這計劃至今已經整合惹60706個exome,還讓《Nature》期刊以社論特別介紹。
Analysis of protein-coding genetic variation in 60,706 humans
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夏威夷烏鴉(Hawaiian crow,學名Corvus hawaiiensis),又叫作聽起來很可愛的「‘alalā」 ,目前在野外已經絕跡,全族只剩下人為養殖的109位個體。有科學家觀察到,夏威夷烏鴉會使用樹枝作為工具(主要是戳進樹洞或縫縫裡,可見牠們也是戳樂黨,見影片),這是鳥類中相當罕見的高段行為。
Discovery of species-wide tool use in the Hawaiian crow
航向太平洋的DNA之旅:南島語族與拉匹達關係解密 原載於泛科學
當歐洲人抵達由大大小小島嶼,以及浩瀚無界汪洋組成的大洋洲時,除了澳洲與部分的新幾內亞之外,幾乎整個太平洋都是南島語族(Austronesian-speaking peoples)的天下。
琉球群島位於台灣與日本之間的海域,即使在冰河時期仍也是島嶼,其中最有名的是沖繩島,早在 36000 年前就已有人居。目前已知最早的智人渡海記錄,是從東南亞的巽他陸棚,前往莎湖陸棚(現在的澳洲與新幾內亞)這段過程距今有 5 萬年以上。近 4 萬年前前往琉球群島,超過 100 公里的航程,是古代的另一次渡海壯舉,相比之下就不是那麼知名。
近來大批古代DNA 的研究,讓我們對智人與已經滅亡的尼安德塔人、丹尼索瓦人,之間的情慾交流有了基本的認識。現存於世人類最接近的親戚,是黑猩猩((Pan troglodytes)與巴諾布(Pan paniscus),但有關他們的遺傳史了解仍很有限。至今仍沒有任何黑猩猩或巴諾布的古代DNA,要研究只能從現存的成員下手。這個 2016 年的論文,大手筆搜集非洲各地 65 位黑猩猩,以及 10 位巴諾布的基因組,希望深入探討他們間的親戚關係,和潛在的情慾交流史。
Chimpanzee genomic diversity reveals ancient admixture with bonobos
古人類學家 1974 年時在東非,衣索比亞的 Hadar 找到 318 萬年前的阿法南猿露西(Lucy),至今都還是最知名的 hominin 化石之一,她的遺骸大概有 40% 保存下來,是數百萬年前化石中難得一見的記錄。通常百萬年以上的遺骸身體都只剩下幾塊骨頭,不太可能探究死因,但露西因為保存比較完整,讓這個 2016 年的論文靠著斷層掃描(computed tomography ,簡稱 CT),能夠詳細分析露西遺骸的損傷狀況,研究後論文下的判斷是:露西是摔死的!
Perimortem fractures in Lucy suggest mortality from fall out of tall tree
翼龍(pterosaur)是會飛的爬蟲類動物,生存年代與恐龍同進退,也在白堊紀結束後徹底滅絕。本來的觀點認為,白堊紀晚期時,翼龍演化為體型相當巨大的飛行生物,最大的翼龍翼展超過10公尺,最小的種類也有2.5到3公尺,比一樣在天空飛行的鳥類大得多。這個2016年的論文在加拿大的不列顛哥倫比亞,宏比島(Hornby)上的Campanian Northumberland Formation (Nanaimo Group),卻發現體格非常小的翼龍化石。
A small azhdarchoid pterosaur from the latest Cretaceous, the age of flying giants
藉由性行為傳播的疾病,叫作性病。人類乳突病毒(human papillomaviruses,簡稱HPVs)是一群以雙股DNA存在,基因組8 Kb大,可能造成人類性病的病毒。不過感染HPV未必會有症狀,約有80%性生活活躍的成年人,一生中至少感染過一次某個型號的HPV。由HPV的演化史可以推論,它們應該與人類共存惹相當一段時間。這個2016年的論文研究惹各型號的HPV16,以及它們古時候和hominin之間的演化關係,特別是分家的年代。
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智人在 4 萬多年前進入歐洲,與尼安德塔人共存惹數千年。這段期間中尼安德塔人出現 Châtelperronian 文化,法國的 Grotte du Renne 遺址是這個文化最重要的代表,考古學家在此發現一些看起來比其他尼尼遺址更「進步」的相關產品,例如個人裝飾物,似乎展現出尼安德塔人更高段的認知能力。
尼安德塔人長居歐洲,卻在大約4萬年前消失,也就是智人進入歐洲的幾千年後。許多考古學家非常好奇,當年雙方的生存能力有何異同,為什麼歐洲的尼安德塔人消失惹,智人卻生存下來。考古學家辛苦研究後發現,尼安德塔人與智人的衣著應該不太一樣。寒冷的冰河時期,有衣服穿想必會是很有利的優勢,不只是不會冷死,還能增加工作能力。
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日本在距今約2000多到16000年前,被稱作繩文時代,直到來自亞洲大陸,配備稻米與金屬的彌生人陸續抵達為止。儘管日本地區在這一萬多年,都被歸類為連續的繩文時期,但各地的繩文文化之間,仍存在一些差異,並非鐵板一塊
Hunting dogs as environmental adaptations in Jomon Japan