丹尼索瓦人(下):翻轉人類演化學的古人種 原載於泛科學
尼安德塔與丹尼索瓦,兩種古人類基因組發表 5 年多以來,藉由交叉比較古今人類的 DNA,我們對人類演化的認知達到全新的境界,而且仍持續突破。
丹尼索瓦人(下):翻轉人類演化學的古人種 原載於泛科學
尼安德塔與丹尼索瓦,兩種古人類基因組發表 5 年多以來,藉由交叉比較古今人類的 DNA,我們對人類演化的認知達到全新的境界,而且仍持續突破。
丹尼索瓦人(中):他們仍活在我們體內 原載於泛科學
為人所知還沒幾年,資訊仍相當有限的丹尼索瓦人,最大特色就是「專業起爭議」,幾乎所有相關發現都帶來顛覆性的概念,混血這部分當然也不例外——台灣有翻轉教學,丹尼索瓦人專門翻轉人類演化學。
丹尼索瓦人(上):尼安德塔人的神秘近親 原載於泛科學
古代 DNA 這個研究領域,在 2010 年時來到前所未有的高峰(想先了解古代 DNA 可先看〈想重現侏儸紀公園?先征服古代 DNA 的種種難題!〉)。經過多年奮鬥後,帕波戰隊終於拼湊出較為完整的尼安德塔基因組,能夠全面比較我們與尼安德塔人在遺傳上的差異,回答雙方有無混血這類的問題。
鳴管(syrinx)是鳥類特有的聲音器官,基本上是由軟骨環、結締組織與肌肉組成的軟組織,缺乏堅硬的部分,因此不容易形成化石保存下來。這個2016年的論文報告,在一件距今6600到6900萬年前,也就是中生代的白堊紀末期的化石中,找到鳴管的蹤跡。
Fossil evidence of the avian vocal organ from the Mesozoic
如今地球上各地,物種的分佈狀況如何,哪些地方的遺傳多樣性比較高?這個2016年的論文蒐集大筆資料,定量分析全球尺度下,陸生與兩棲動物,在各個區域的物種與種內的遺傳多樣性。
An Anthropocene map of genetic diversity
當初研究人類基因組,投入大筆資源,發展DNA定序技術的一大理由是,增進對遺傳與疾病間關係的了解。時至今日,已經有不少基因組被定序成功,科學家也得知許多遺傳變異和疾病間的潛在關係,這使得遺傳診斷,來到前所未有的境界。然而,所知畢竟仍很有限。這個2016年的論文報告深具野心的大計劃「Exome Aggregation Consortium(ExAC)」,這計劃至今已經整合惹60706個exome,還讓《Nature》期刊以社論特別介紹。
Analysis of protein-coding genetic variation in 60,706 humans
via 這裡
夏威夷烏鴉(Hawaiian crow,學名Corvus hawaiiensis),又叫作聽起來很可愛的「‘alalā」 ,目前在野外已經絕跡,全族只剩下人為養殖的109位個體。有科學家觀察到,夏威夷烏鴉會使用樹枝作為工具(主要是戳進樹洞或縫縫裡,可見牠們也是戳樂黨,見影片),這是鳥類中相當罕見的高段行為。
Discovery of species-wide tool use in the Hawaiian crow
航向太平洋的DNA之旅:南島語族與拉匹達關係解密 原載於泛科學
當歐洲人抵達由大大小小島嶼,以及浩瀚無界汪洋組成的大洋洲時,除了澳洲與部分的新幾內亞之外,幾乎整個太平洋都是南島語族(Austronesian-speaking peoples)的天下。
琉球群島位於台灣與日本之間的海域,即使在冰河時期仍也是島嶼,其中最有名的是沖繩島,早在 36000 年前就已有人居。目前已知最早的智人渡海記錄,是從東南亞的巽他陸棚,前往莎湖陸棚(現在的澳洲與新幾內亞)這段過程距今有 5 萬年以上。近 4 萬年前前往琉球群島,超過 100 公里的航程,是古代的另一次渡海壯舉,相比之下就不是那麼知名。
近來大批古代DNA 的研究,讓我們對智人與已經滅亡的尼安德塔人、丹尼索瓦人,之間的情慾交流有了基本的認識。現存於世人類最接近的親戚,是黑猩猩((Pan troglodytes)與巴諾布(Pan paniscus),但有關他們的遺傳史了解仍很有限。至今仍沒有任何黑猩猩或巴諾布的古代DNA,要研究只能從現存的成員下手。這個 2016 年的論文,大手筆搜集非洲各地 65 位黑猩猩,以及 10 位巴諾布的基因組,希望深入探討他們間的親戚關係,和潛在的情慾交流史。
Chimpanzee genomic diversity reveals ancient admixture with bonobos
古人類學家 1974 年時在東非,衣索比亞的 Hadar 找到 318 萬年前的阿法南猿露西(Lucy),至今都還是最知名的 hominin 化石之一,她的遺骸大概有 40% 保存下來,是數百萬年前化石中難得一見的記錄。通常百萬年以上的遺骸身體都只剩下幾塊骨頭,不太可能探究死因,但露西因為保存比較完整,讓這個 2016 年的論文靠著斷層掃描(computed tomography ,簡稱 CT),能夠詳細分析露西遺骸的損傷狀況,研究後論文下的判斷是:露西是摔死的!
Perimortem fractures in Lucy suggest mortality from fall out of tall tree
翼龍(pterosaur)是會飛的爬蟲類動物,生存年代與恐龍同進退,也在白堊紀結束後徹底滅絕。本來的觀點認為,白堊紀晚期時,翼龍演化為體型相當巨大的飛行生物,最大的翼龍翼展超過10公尺,最小的種類也有2.5到3公尺,比一樣在天空飛行的鳥類大得多。這個2016年的論文在加拿大的不列顛哥倫比亞,宏比島(Hornby)上的Campanian Northumberland Formation (Nanaimo Group),卻發現體格非常小的翼龍化石。
A small azhdarchoid pterosaur from the latest Cretaceous, the age of flying giants