盲眼的尼安德塔石器匠

歐亞大陸在新石器時代之後，於3000到5000年前這段時間進入青銅時代，經歷劇烈的文化轉變，然而這些改變是因為人群遷徙，或來自概念交流不得而知。想了解人類族群遷徙的歷史，古代DNA定序是威力強大的武器，2015年這個大規模的族群基因體學研究，大手筆定序了年代跨越數千年的101個古代人類基因組，希望能回答這個問題。

Population genomics of Bronze Age Eurasia

「肯納威克人（Kennewick Man）」是位約8500年前的男生，1996年時在美帝西北角的華盛頓州，屬於美帝陸軍工兵隊（US Army Corps of Engineers）的土地上被發現。這具骨骸雖然沒有什麼神奇魔力，卻引發眾人爭奪，幾個美國原住民部落引用「美國原住民族墓穴保護及歸返法案（Native American Graves Protection and Repatriation Act，縮寫NAGPRA）」，要求擁有這件死人骨頭。

The ancestry and affiliations of Kennewick Man

傳統上，化石形態比較分析是人類考古演化很重要的研究方法，近年來科技進步，從業人員比從前有更多協助分析的工具，例如 computed tomography（斷層掃描）和 3D imaging（三維成像）。有些老化石在新方法分析下，有了全新的發現，這個2015年針對180萬年前的 Homo habilis（巧人）化石重新分析正是如此。

Reconstructed Homo habilis type OH 7 suggests deep-rooted species diversity in early Homo

作者／汞燈、編修／寒波

Aphrodisias，這座位於今日土耳其西部，離地中海不遠的古城，發現了數百件古代塗鴉，年代距今超過1500年。這些塗鴉提供了我們當時（約西元350～500年左右）這座古城人們的生活樣貌。

咖啡因生產線的趨同演化  原載於泛科學

既然咖啡因正是以咖啡為名，2014年這篇中果咖啡（Coffea canephora）基因組定序的論文[1]，標題除了咖啡基因組外，還加上「咖啡因生合成的趨同演化」，似乎是再自然也不過的事。可惜《咖啡為何要合成咖啡因？咖啡的基因體還說了什麼》一文對這篇論文的內容多有誤會，因此特別為文說明。

幾百萬年來，Homo（人屬）曾經有好幾個物種，至今只剩下我們智人（Homo sapiens）這個約20萬年前誕生的種存在。人屬很可能在200到300萬前這段時間，由某些南猿，例如生存於300到390萬年前東非的 Australopithecus afarensis（阿法南猿）演化而來，不過本來找到最早的人屬化石，年代大約是240萬年，離阿法南猿有段距離。

Early Homo at 2.8 Ma from Ledi-Geraru, Afar, Ethiopia

不少動物會使用工具，例如黑猩猩能把石頭當工具用（use stones as tools），然而把石頭製造成工具，也就是「石器（stone tools）」，需要更發達的認知能力，所有人屬（Homo）物種都有製造石器的能力。2015年這個論文在肯亞找到330萬年前的石器，那時卻沒有任何已知的Homo存在。

3.3-million-year-old stone tools from Lomekwi 3, West Turkana, Kenya

（原作於 2013 年 8 月 18 日）這篇文章要介紹的是一個五年前還很冷門的東西，它這幾年來名氣逐漸成長，做微生物學的多半都聽過，今年突然大暴紅，成為尖端生物科技的結晶代表，各個生物領域多半都有耳聞－它就是CRISPR。

人類與黑猩猩的祖先大約700萬年前在非洲分家，到智人出現前這段期間，有相當多類似人類的物種（hominin）演化出來，至今無一尚存。幾百萬年前的資訊不夠充分，使我們很難判斷當初非洲有多少類人物種存在過，彼此間的親緣關係如何，以及可能最重要的問題：誰才是正牌人類祖先？

New species from Ethiopia further expands Middle Pliocene hominin diversity

研究古代人類演化，除了科學家一向辛勤的工作外，近年來幾個科技進展，像是古代DNA定序、更準確的同位素定年、更先進的化石形態比較法（high-resolution computed tomography/digital methods）都幫忙很大。從這篇2015年的《Science》論文中，可以看出以上新技術合體的強大威力。

The makers of the Protoaurignacian and implications for Neandertal extinction

網路上能看到的中文"ortholog"解釋沒一個真的把概念解釋清楚，比方說這一篇：

homolog, ortholog, and paralog

看完我保證你還是不懂"ortholog"是什麼東西。（下面那些喊"好清楚" "好清楚"的，一定是理解力大師！）那個附圖也不要看，看了只會更混淆。

至今仍沒有確鑿的證據，能讓我們推論出尼安德塔人的滅亡原因，要知道它們為什麼滅亡，至少要先知道尼安德塔人消失的年代，因此精確的定年技術相當重要。最為人熟知的同位素定年法是碳定年法，它的極限是5萬多年，然而之前的碳定年法卻會低估樣本的年代。

The timing and spatiotemporal patterning of Neanderthal disappearance

馬雅人精選-雌雄同體木瓜  原載於泛科學

PTT上有位鄉民mayaman馬雅人[1]，是台灣首席馬雅專家，不過以下這個發表在《基因體研究（Genome Research）》期刊[2]，馬雅人種木瓜的故事，或許連mayaman都不知道。