這個 2024 年的論文著重調查,英格蘭南部的劍橋及其附近 11 到 18世紀的古代基因組。一項比較特別的發現是,之前研究認為 14 世紀中期的黑死病之際,某些基因受到強烈的天擇,這個論文卻沒有偵測到。
Genetic history of Cambridgeshire before and after the Black Death
公元 1849 年的劍橋。畫中人的祖先,應該都是黑死病的生還者。 via 這裡
劍橋,就是劍橋大學那個劍橋,中世紀結束的前後數百年間,這兒是個中型城鎮,大學師生以外也住著許多一般居民。
這個論文從多處墓葬,取樣年代介於公元 1000 到 1550 年的 250 位古人,以及 1550 到 1855 年 25 位。總共有 190 位的古代基因組,覆蓋率超過 0.01,再加上一些以前發表的樣本,一起用於後續分析。
這項研究的取樣涵蓋古代多種群體。黑死病的影響以外,更重要的意義是從 DNA 認識劍橋古早人的各方面。
中世紀前後數百年的劍橋居民,大部分人遺傳上看來,就是類似的英格蘭南部人;少數比較特別,鍶穩定同位素判斷,有幾位小時候在外地長大。
各處墓葬中,總共有幾十對血緣上的近親。只有一種墓地完全沒有,那就是醫院。 論文認為這符合中世紀當地醫院的角色:作為社會安全網,接住缺乏家庭支持的社會邊緣人,最終給他們一個位置長眠。RIP~
Pathways to the medieval hospital: collective osteobiographies of poverty and charity
有意思的是發現少數人,父母為三度以內的近親。這件事有趣是因為,英國國教禁止四度內的血親結婚。看來仍然有些人由於某些理由,避開禁令限制。 論文推測有個可能是,父母雙方分屬不同教會,各自登記,沒有整合紀錄,所以沒有被發現。
秦始皇直呼外行~
黑死病是怎麼回事呢?我只講大概。首先,疾病可能會影響免疫相關的基因,所以論文檢查 HLA 基因們,結果發現黑死病前後的樣本,沒有明顯的差異。
再來,之前有一項研究找到可能受到影響的 25 處基因,另一個研究則是 4 個。然而這回的分析中,劍橋人群的這些基因都缺乏天擇的鐵證,此前抓到的 ERAP2 也不例外。 這項研究也試著分析之前的樣本,這樣那樣以後,判斷沒有。
不過這不見得意謂,之前的觀點錯誤。反正判斷特定 DNA 位置的天擇這件事,很謎。
新聞:
Did the Black Death shape the human genome? Study challenges bold claim
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