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發生在14世紀的黑死病,是鼠疫桿菌造成,極為恐怖的疫情,導致當時歐洲超過3分之1的人口喪生。隨後到18世紀這段期間,還陸續發生過數次大暴走,不過目前對於鼠疫桿菌在這段疾病期間的歷史,還不是非常清楚。歐洲這波鼠疫桿菌的疫情,比較大規模的爆發,最後一次發生在18世紀的馬賽,這個2016年的論文從1722年的5個遺骸,取得當時鼠疫桿菌的樣本,研究當年馬賽大瘟疫的菌株,究竟是何來歷。

Eighteenth century Yersinia pestis genomes reveal the long-term persistence of an historical plague focus

KMT sucks

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人類移民世界的過程中,南美洲是最後進入的一塊大陸,更早之前所有hominin都不曾到過美洲,只有智人在2萬年內移民成功。人類在相對封閉的南美洲,一路上族群發展狀況如何?這個2016年的論文蒐集了整個南美洲共1147個考古遺址,以及5464個定年樣本,分析此地在2000到14000年前間的族群密度(因為是南美洲,所以應該沒有包括中美洲的馬雅)。

Post-invasion demography of prehistoric humans in South America

KMT228  

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「絲路」是古代東方與西方間交流的要道。這個2016年的論文報告,在圖博(西藏)西部的阿里地區(Ngari ,也叫Ali),這個海拔高達4300公尺的地方,發現距今1800年的茶葉。

Earliest tea as evidence for one branch of the Silk Road across the Tibetan Plateau

KMT sucks

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要研究古代遺傳學的問題,最關鍵的前提是,要先獲得能夠分析的古代DNA,許多時候,古代DNA品質的高下,直接決定了研究的成敗。眾多科學從業人員為了獲得更多、更好的DNA,試過一種又一種材料,這個2016年的論文報告惹一種新的古代人類DNA來源-牙結石。

Successful enrichment and recovery of whole mitochondrial genomes from ancient human dental calculus

64  via 這裡

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愛爾蘭是歐洲最西邊的島,本來最早有人居住的年代,考古學家認為是一萬年前,位於Mount Sandel遺址。不過這次的新研究,把人類在愛爾蘭活動的時間,提前了2500年左右。

First evidence of a Late Upper Palaeolithic human presence in Ireland

bear-knee-bone  

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史前時代,農業尚未被發明以前,過著採集狩獵生活的人類就發明惹陶器。日本最早的陶器,大概在16000年前就已經出現,不過要等到11500年前左右,才變得普及。當時的人拿陶器做什麼用?一萬多年前,地球結束惹冰河時期,氣溫回暖。有個假說認為,陶器之所以使用大增,是因為氣候回暖後大地欣欣向榮,資源更豐富,所以陶器被用來儲存這些多餘資源。

Ancient lipids document continuity in the use of early hunter–gatherer pottery through 9,000 years of Japanese prehistory

 JomonPottery   via 這裡

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這個 2016 年的論文報告,瑞典南方靠波羅的海側,距今 9200 年的一處遺址中,發現 20 萬個魚骨頭樣本。

Something rotten in Scandinavia: The world's earliest evidence of fermentation

短篇 北歐風味,9200年前世界最早的發酵魚 

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考古學家早就知道,尼安德塔人已知用火,然而尼安德塔人怎麼用火,仍然不太清楚。這個2016年的論文,研究法國的Pech-de-l' Azé I遺址,距今約5萬1000前的一層,這層的考古特徵屬於莫斯特文化(本部落格的顯示圖就是個莫斯特石器,尼安德塔人當年最潮的高科技),幾千年後智人才會進入歐洲,因此是個標準的尼安德塔人之家。

Selection and Use of Manganese Dioxide by Neanderthals

KMT 228  

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眾多古代hominin之中,只有丹尼索瓦人是由DNA鑑定發現的新人種,唯一已知的丹尼索瓦人化石,位於遙遠的北方阿爾泰山附近,形態上我們只知道他的臼齒很大顆,其餘通通不知道。非常驚奇的是,只在北方發現過的丹尼索瓦人,卻與現在的澳洲原住民有十分明顯的混血跡象,兩地在歐亞大陸東方一南一北,差了超級遠

Did the Denisovans Cross Wallace's Line?

Denisovan  

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距今7萬5千年前,印尼蘇門答臘的多峇火山,發生了200多萬年內,最劇烈的火山爆發。之前遺傳學研究發現,大概在多峇火山大暴走的同一時間,人類的人口數目降到非常低,只剩下幾千人,目前全世界所有人類族群,都是當時少少人的後裔。有人因此提出「多峇巨災假說」,也就是超強的火山爆發,火山灰遮蔽天空,導致全球氣候經歷了劇烈改變,使當時的人類大量死亡,包括非洲的智人瀕臨全滅。

Ash from the Toba supereruption in Lake Malawi shows no volcanic winter in East Africa at 75 ka

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法國考古遺址夏維洞穴(Chauvet cave),裡頭最出名的是一系列幾萬年前的史前壁畫,即使在今天看來,仍算是出色的藝術品。這個2016年的論文報告,在夏維洞穴中發現距今36000年之久的壁畫,這幅畫的主題十分特殊:火山爆發。

A 36,000-Year-Old Volcanic Eruption Depicted in the Chauvet-Pont d’Arc Cave (Ardèche, France)?

F1  

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尼安德塔人是我們智人在演化上最接近的親戚(先不管不知其人,只知其DNA的丹尼索瓦人),問題是,兩者是何時分家的?換句話說,智人與尼安德塔人的共同祖先,生存在什麼年代?智人與尼安德塔人的共同祖先,長的應該會兼具兩者的形態性徵。這個2015年的論文以直立人作外群,比較尼安德塔人與智人的臉部形態,用3D幾何形態與maximum likelihood法,重建兩者的共同祖先。

Virtual ancestor reconstruction: Revealing the ancestor of modern humans and Neandertals

3dfaces  via 這裡

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女生與男生是由什麼基因決定的?直到25年前我們才知道答案,比台灣解嚴還遲。男生跟女生遺傳上最明顯的差異,就是男生有Y染色體,女生沒有,有人猜測,這個「性別決定基因」應該是在Y染色體上。1980年代,科學家把目標的範圍,縮小到Y染色體的上一小段片段,但因為Y染色體塞滿了重複序列,所以很難區分出一個單獨的基因。

In retrospect: Twenty-five years of thesex-determining gene

SRY 

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不列顛地區現在是好幾個島,與歐洲大陸隔海分開,但冰河時期海平面較低時,不列顛時常與歐洲大陸相連,使得缺乏渡海能力的古代人種,能直接從歐洲走過去,狀況與台灣類似。這個2014年英國的自然史博物館舉辦的展覽:「Britain: one million years of the human story」,展出不列顛地區從1萬2000年到近100萬年前,這百萬年來的hominin活動記錄。

Exhibition of early human history at the Natural History Museum

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美洲是人類最後移民的大陸不算企鵝王國南極洲的話,但人類在何時進入美洲,一直都是高度爭議性的問題。早期學界認為,13000年前北美的克洛維斯文化,是最早的美洲居民,不過近年來不少更早的遺址被發現,其中最關鍵的就是Monte Verde遺址,它位於南美洲最南端的智利,距今14000多年。

New Archaeological Evidence for an Early Human Presence at Monte Verde

Monte Verde

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尼安德塔人的長相,跟我們一看就不太一樣,尼安德塔人的臉明顯比智人更突出。臉看起來不同,是因為臉部骨頭的形狀不一樣。這個2015年的論文比較了智人、尼安德塔人,以及分類上算是早期尼安德塔人的胡瑟裂谷化石,彼此上頜骨(maxilla)發育模式的差異。

Ontogeny of the maxilla in Neanderthals and their ancestors

Face_poster   via 這裡 

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智人起源自非洲,所以一定要離開非洲,才能前進世界,目前非洲之外大多數人的祖先,應該都是7萬年內,6萬年前左右離開的,但到底是走哪條路離開,仍有爭議。

Africacaca  

原地圖取自:這裡

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生存與繁衍是生物最重要的兩件事大部分脊椎動物的模式是生存到可以繁衍後代的年紀生下小寶寶之後過了生育年齡死掉只有少少的例外例如殺人鯨以及人類人類的親戚們也就是靈長類跟其他脊椎動物沒什麼不一樣為什麼人類會這麼特殊

Human-specific derived alleles of CD33 and other genes protect against postreproductive cognitive decline

Up 

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人類在何時、如何踏上美洲,一直都是爭論不休的問題,1920年代Clovis文化最先在北美的新墨西哥州發現後來又找到好幾個遺址學界長久認為這些人就是最早的美洲居民

Ancient migration: Coming to America

泛舟哥  

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2015年的第五屆歐洲人類演化學會的年會,有一些有趣又有學術價值的研究被報告。其中一個「用膠原蛋白鑑定化石物種」,想起來似乎沒有很難,可是能先想到的人好厲害,而且應該會相當實用。

5th ANNUAL MEETING OF THE European Society for the study of Human Evolution(摘要在第62頁)

collagen   via 這裡

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