盲眼的尼安德塔石器匠

一百多年前公元 1918 年 1 月開始，流感廣傳世界各地，殺傷力相當嚴重，可能消滅數千萬智人，史稱「西班牙流感」。但是照現在政治正確的說法，要稱之為「1918年新型流感」。這個 2022 年的論文取得幾個當時的病毒樣本，探討這場疫情中病毒的變化與適應。

Archival influenza virus genomes from Europe reveal genomic variability during the 1918 pandemic

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流感病毒很簡單，就是不同款式 H 和 N 的組合，HxNy 的組合效果卻很複雜，1918 年流感的病毒為 H1N1。

樣本來自歐洲的德國、奧地利，當年去世倒霉鬼用福馬林保存一百年的肺部標本。流感病毒是 RNA 病毒，但是如果樣本長存在福馬林中，遺傳訊息依然有機會生還。

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測試的 13 個樣本中，有 3 個成功取得流感病毒的遺傳序列。拼湊出一個完整的基因組，來自 1918 年的慕尼黑；以及兩個部分基因組，來自 1918 年 6 月的柏林。

除此之外，還有少少疫情之前與期間的樣本，這回一起比較。H1 的 HA 蛋白質，總共 21 個北美與歐洲的樣本。完整病毒基因組，目前有 3 個樣本，其餘 2 個來自 1918 年 9 月的紐約、1918 年 11 月的阿拉斯加。

經歷與 WARS 的互動，如今大家都很清楚病毒會持續突變，有些突變對傳染有利，有的會影響殺傷力。

和 1918 年以前比較，HA 的兩處位置：16G、283L 變成 D16、P283，用現在大家習慣的寫法為：G16D、L283P。根據我們對流感的知識，鍵盤比劃，這兩處變異或許能增加病毒的抵抗力，躲過先天免疫系統的攻擊。目前看來至少在 1918 年初期，H1N1 病毒已經配備此一遺傳優勢。

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H1N1 流感病毒 1918 年廣傳世界各地，遺傳上是否有所區別？取自 1918 年 11 月阿拉斯加的樣本，和慕尼黑的病毒之間，聚合酶（polymerase）遺傳有別，而且影響酵素功能。

體外測試指出，阿拉斯加病毒的聚合酶，複製能力是慕尼黑的 2 倍；如果將阿拉斯加病毒的聚合酶換成慕尼黑版本，酵素活性會降低 1.7 倍。 雖然這類體外測試的差異，未必等於實際傳染的狀況，不過還是可以佐證，由歐洲傳播到美國的流感病毒，有升級的跡象。

目前缺乏這場瘟疫之後一段時間的 H1N1 樣本，所以無法判斷疫情結束後發生哪些變化。不過 H1N1 持續存在至今，像是 2009 年又導致比較嚴重的大流行。

論文分析指出，最近的 H1N1 病毒們，似乎都能追溯到一百年前的款式。而病毒基因組上的不同部位，受到的演化壓力不一致，有些部分改變較快，有些變化不大。

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論文短評：

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