這個 2021 年的論文，報告努比亞（Nubia）的古代DNA 研究。大概多數台灣人沒有聽過，這個地名指的是尼羅河較為上游，從第一大瀑布（附近大城 Aswan 亞斯文）到第六大瀑布（附近大城 Khartoum 卡土穆）周圍的區域。國家疆域，算是現在的埃及南部、蘇丹北部。
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取樣地點位於蘇丹北部的 Kulubnarti，這兒在第二大瀑布南方一點，離埃及比較近，歷史上屢屢受到埃及方向的影響。
古埃及帝國在強盛時期曾經統治努比亞，後來比較顯眼的外來文化，還有公元 542 開始的基督教時代，以及 7 世紀先從埃及開始的阿拉伯征服。
Kulubnarti 在公元 650 到 1000 年，算是基督教時期。這回論文分析的 66 個古代基因組處於這段期間，可以視為尚未被阿拉伯統治以前，基督教時期的居民。
古代基因組來自 2 處墓葬，距離 1 公里。儘管都是基督教風格，不過一邊的 R 墓葬比較貴氣，另一邊的 S 墓葬比較寒酸。之前有考古學家懷疑，兩邊是否各為地主、勞工的長眠之所，或是分別為本地人、外來勞工或難民。
66 個古代基因組樣本，R 墓葬 27 個、S 墓葬 39 個，平均覆蓋率 0.28。比較發現其中有 33 人，和墓葬中其他某人是遺傳上的近親，包括 7 對各自埋在 R、S 兩邊。 由此看來，有不少同一家族的人分別葬在兩邊。埋在哪邊的原因，並非取決於本地人、外來人。
當地總人口應該不多，不過 DNA 品質足以分析的 9 人之中，只有 1 位的父母是近親，可見當時的人有意識避免近親繁殖。
和其他地區的人比較，Kulubnarti 居民在遺傳上可以視為兩款祖源的組合：東非、歐亞大陸西部。這樣講只是為惹方便，實際上情慾交流應該十分複雜，例如古埃及人就配備「歐亞大陸西部」血緣，可以想像早在幾千年前，源自歐亞大陸的 DNA 已經存在非洲。
誰跟誰情慾交流，具體上不清楚，比對後論文認為，可以用努比亞南方，東非的 Dinka 族代表東非祖源，論文也稱之為「尼羅相關祖源（Nilotic-related）」；努比亞北方的埃及的東北方，黎凡特在青銅時代、鐵器時代的古人代表歐亞大陸西部祖源。
大部分樣本的東非祖源，介於 35.6 到 49%，6 位更高或更低，不過仍為兩款的合體。R 墓葬平均為 43.2%，S 墓葬 42.3%，沒有差異，兩邊顯然源自同樣的遺傳族群。
兩款祖源是什麼時候合體的？估計平均在 22 代以前，也就是公元 810 年的 620 年前，2 世紀前後，距今 1800 年前左右。但是那只是平均，不同人的遺傳史不一樣，情慾交流應該是持續至少幾百年的過程，反正不可能是短期大移民所致。
依常理推想，努比亞地區所謂的「東非祖源（尼羅祖源）」，是當地較早的血緣，而「歐亞大陸西部祖源」大部分能直接追溯到北方的埃及，以及更早的中東。有人會直接定義作本地、外來血緣，我用語謹慎一點，抖.jpg
有趣的是歐亞大陸西部祖源中，女生貢獻較多，估計約 68%。相對地，則是男生貢獻較多東非 DNA。由此推想，歷史上應該是率續有外來女生進入努比亞。而粒線體、Y染色體看起來也類似。
怎麼分辨不同祖源，女生，男生的貢獻差異？簡單說是女生性染色體 XX、男生 XY，所以 X 對體染色體的比例不一樣，可以靠這部分差異去估計。
這回 Kulubnarti 的樣本，可以視為努比亞在基督教時期的居民，距離現在超過一千年。論文分析幾個現代的努比亞族群，大致上看來，從 7 世紀的阿拉伯征服開始以後，也發生更明顯的情慾交流，但是所有現代族群，似乎都不是這群 Kulubnarti 居民的直系後裔，一千多年來，有更多 DNA 成分融入。
木乃伊的DNA (上)：用遺傳學破解神秘古埃及 曾經輝煌的古埃及文明
這項研究經歷的漫長過程，從考古到古代DNA，從去世老先生到末代弟子的傳承，有點意思，有興趣的可以看這個新聞稿：
First genome-wide ancient human DNA from Sudan shines new light on Nile Valley past
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