山羊（goat）是一萬多年前，被人類由野山羊（bezoar）馴化而來，直到今日仍是重要的馴化動物之一。山羊起源自中東，不過中東很大，馴化山羊是只有一個起源，或是過程更為複雜？這個 2018 年的論文，由肥沃月灣各處，取得 51 個山羊的古代基因組，以及 83 個粒線體，以了解馴化山羊的起源。
Ancient goat genomes reveal mosaic domestication in the Fertile Crescent
古代樣本的年代，介於舊石器時代到中世紀；主要來自 3 個地區：肥沃月灣東部的伊朗、西南部的梨凡特、西部的安那托利亞。
由粒線體看來，舊石器時代（山羊尚未馴化）和轉型為新石器時代不久時（山羊馴化不久後），3 個地方的古早山羊，粒線體型號大部分都不一樣，表示 3 地應該是獨自馴化自己的山羊，至少是女生山羊那方。
等到新石器時代結束以後，各地山羊族群粒線體型號的同質性卻大幅提高，可以追溯到安那托利亞。也就是說，來自肥沃月灣西部的山羊，在新石器時代結束以後，也成為南部、東部的新寵，南部與東部本來的山羊卻不再流行。
基因組觀察到的模式，與粒線體一致。肥沃月灣西、南、東的山羊族群遺傳上有著明顯的差異，分家年代比新石器時代更早，也許達到數萬年之久，表示新石器時代的農夫們一開始馴化的山羊，都源自本地更早的族群。
值得一提的是，新石器時代早期肥沃月灣兩邊的族群，遺傳上差異明顯這回事兒，除惹山羊以外，也見於人類族群。
進一步分析發現，各地山羊有過數次明顯的情慾流動。由目前樣本看來，新石器時代的東部（伊朗）山羊自成一群；西部（安那托利亞）大概有 48% 繼承自本地野山羊，其餘 52% 來自伊朗的情慾流動。南部（黎凡特）則是有 71% 與安那托利亞野山羊一致，29% 源於伊朗族群。
山羊在中東起源後，又向不同方向傳播。比較各地現代山羊族群可知，歐洲族群較為接近新石器時代的西部山羊，遠東族群接近東部山羊，非洲族群則接近南部山羊。由此看來，現代歐洲、遠東、非洲的山羊，遺傳上，都接近地理上比較靠近自己的中東族群。
被人類馴化的動物，往往有些基因受到人擇。分析山羊的基因組發現，新石器時代各地山羊中，與色素有關的基因 KIT 有共享的變異；有意思的是，東、西兩邊的馴化山羊族群，這同一個基因並非先在一地產生，再透過情慾流動傳向另一邊，卻是在兩地獨立演化而成的結果。
除此之外，三地山羊各有不同的基因，有受到人擇影響的跡象。西部山羊是 SIRT1（體型，會變小）、東部山羊是 EPGN（產犢間距，增加生育頻率）與 STAT1（乳腺，促進產乳）。另一個東部山羊受到馴化影響的基因是 CYP2C19，功能可能與解毒（感染穀物的真菌）有關。
劃重點：肥沃月灣的馴化山羊，新石器時代是多地起源，各有與毛色、體型、生育、產乳、飲食解毒有關的基因受到影響。
新聞稿：
Ancient genome analyses reveal mosaic pattern of goat domestication thousands of years ago
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