非洲有著悠遠綿長的人類演化史，至今研究卻相對稀少。這個 2017 年的論文，獲得 15 個來自東、南非的古代基因組，讓我們更加認識非常繁複、所知卻十分有限的非洲遺傳史。另外也提供惹一些，智人起源的線索。
Reconstructing Prehistoric African Population Structure
樣本位置。
15 個樣本都位於東非或南非，最老的距今 8100 年，最年輕的 400 年，是貨真價實的「古代」基因組，覆蓋率普遍很糟，不過仍足以後續分析。從南往北，南非共 3 個，2 個距今約 2000 年、另一個 1300 年；馬拉威 7 個，介於 2500 到 8100 年；坦尚尼亞 4 個，距今 600 到 3100 年；肯亞 1 個，距今 400 年。另外就是之前發表，衣索比亞 4500 年前的 Mota。
樣本資訊。
和現代族群的關係方面，古代南非人，與現代的南非人很像，古代東非人，卻比較接近現代的西非族群；地理介於其間的馬拉威，遺傳上也介於其間。古今東非人之所以遺傳差異明顯，主要應該是因為，距今 3000 年以後，有大批可以追溯到中東的 DNA 流入，影響現代東非族群的遺傳組成。
樣本 PCA。
在人類遺傳學研究中，常常能見到南非的「桑族（Sans）」代表。非洲和世界上許多地方一樣，數千年前也經歷農夫族群的大遷徙（例如班圖語族），大尺度的情慾流動，劇烈影響惹遺傳組成。
桑族被認為與這些情慾交流沒有多少關係，是所有人類族群中，與其他人分家最久的一群人。然而，與古代南非人相較，現代的桑族人基因組中，卻仍有 9% 左右的外來 DNA。
各樣本的祖源關係。
南非東北方的馬拉威，是這回最大的驚喜。距今 2500 到 8100 年前的 7 位古人，彼此間遺傳上差異不大，代表當地族群有著相當的延續性，持續至少五千年之久。古代馬拉威人遺傳上，可以粗略視為與其同時期，更北方的東非、加上較少的南非、以及少少的西非祖源，三者共同組成。
驚喜點在於，現代的馬拉威人幾乎完全沒有配備，與桑族代表南非祖源相似的 DNA；也就是說我們所知的「南非祖源」，其實一度曾經分佈到更為東北的區域，只是後來都消失惹。
左：南非 2000 年前古人，與各地族群的遺傳關係。右：衣索比亞 4500 年前古人 Mota，與各地族群的遺傳關係。
左：西非代表 Mende 族群，與各地族群的遺傳關係。右：坦尚尼亞 3100 年前古人，與各地族群的遺傳關係。
還有很多分析，先略過，直接跳到族群遷徙史。智人，第一：是先起源於東非，再移民到西非、南非、非洲以外；或是第二：欠缺一個較為明確的起源地，反而是各地長期情慾交流的結果？
智人起源假說 1 號：起源於東非，再移民到西非、南非、非洲以外。
智人起源假說 2 號：欠缺較為明確的單一起源地，而是各地長期持續情慾交流的結果。
依目前資訊，兩個假說都有機會（別再打架惹......疑，你們怎麼繼續打啊！）。起源自東非，再移民各地，這個劇本很容易想像。另一可能性，多地長期持續情慾交流，假如為真的話，根據模型估計，會有「一群人」與其他人分家的年代還在桑族更早之前。桑族約莫是 20 萬年前離開的，也就是說這群人分家非常非常早，超過 20 萬年前。他們能否算是智人，是否有對應的化石呢？這需要 DNA 與其他領域，共創未來才能回答。
馬拉威的死人骨頭，是如何取得的呢？來看看古人類學家的田野記錄：
Bonding over bones, stones and beads
北非15000 年前摩洛哥Iberomaurusian 人，遺傳與歐洲毫無關係
Shum Laka 遺址首度獲得西非古代基因組，非常不像現代西非族群
新聞稿：
Ancient human DNA in sub-Saharan Africa lifts veil on prehistory
Science 之前的新聞：
歡迎光臨粉絲團一起討論：盲眼的尼安德塔石器匠
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