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獅子是最知名的大型動物之一,古時候有好幾種獅子住在非洲、歐亞大陸、美洲各地,現在卻只剩非洲和印度有一小群,還有台灣統一獅、韓國三星獅、日本西武獅,其他都滅團惹。這個 2020 年的論文取得穴獅和現代獅的基因組,探討獅子的遺傳史。

The evolutionary history of extinct and living lions

獅子與穴獅的遺傳史

via 這裡

 

現代獅(Panthera leo leo)以外,幾萬年前存在過的獅子還有住在歐亞大陸、阿拉斯加、育空的穴獅(cave lion,學名 Panthera leo spelaea);以及住在北美洲的美洲擬獅(學名 Panthera leo atrox,不是現在那個「美洲獅」)。

 

這個論文取得 20 個基因組,2 個樣本為距今 3 萬年前的穴獅,分別來自西伯利亞(覆蓋率 5.3)和阿拉斯加南方的育空(覆蓋率 0.6)。

 

獅子與穴獅的遺傳史

 

6 個現代獅的樣本,2 個取自現在的印度,4 個取自非洲東部與南部。另外 12 個樣本介於 15 世紀到 1959 年,覆蓋率介於 0.16 到 16.2,地理上位於西亞、北非、南非的開普省,都是幾百年前有過獅子,現在沒有的地區 QQ

 

由遺傳差異估計,穴獅和現代獅大約在 50 萬年前分家。假如穴獅和某群現代獅有過情慾交流,那麼那群獅子的後裔遺傳上就會更接近穴獅。 比較發現,所有現代獅和西伯利亞的穴獅的差異都一樣;但是育空的穴獅和南非獅子更接近,論文進一步分析後認為或許是誤判。最後下的結論是:穴獅和現代獅之間,沒有已知的情慾交流。

 

獅子與穴獅的遺傳史

 

而現代獅在遺傳上,可以分為兩大群,大約在 7 萬年前分家。兩群大致上按照地理區分,一群位於東非、南非,論文稱為「南部獅」,另一群撒哈拉以北的「北部獅」位於北非、亞洲,而中非、西非介於兩者之間。

 

在 2 支血脈分家以後,北部獅的估計族群量劇烈減少,由此推論,北部獅是從南部獅之中分出去的。 中非、西非的樣本,也配備北部獅的 DNA 變異,表示南北分家以後,牠們的祖先又和北部獅有過情慾交流。

 

獅子與穴獅的遺傳史

 

有趣的是,亞洲獅和北非獅同屬北部獅,亞洲獅遺傳上卻更接近南部獅。論文推論,可能是亞洲與東非的族群間出現過情慾流動,但是北非族群沒有參與。另一個可能是,北非族群曾經接受過未知獅的 DNA,稀釋原本的血脈,才使得牠們和亞洲獅比較不像。目前資訊不足以分辨哪個推論正確。

 

歷史上智人的移民與開發,應該對獅子造成過不少壓力,近代則更加嚴重。2 個印度獅樣本在遺傳上差異極為有限,顯示遺傳多樣性的喪失;牠們的基因組上比同類偵測到更多有害突變,反映出活生生的遺傳負荷(genetic load)。

 

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