這個 2026 年的論文又報告一處丹尼索瓦人。這回不是新化石，而是河北的老朋友許家窯人，根據古代蛋白質分析證實為丹丹。
The proteome of Middle Pleistocene Xujiayao and common Denisovan morphology
圖片主題應該是德國的 Schöningen 長矛狩獵場景，但是我找不到圖片最初來源。
許家窯遺址（Xujiayao）位於東亞北方的泥河灣盆地，保存相當漫長的人類演化紀錄，超過一百萬年。所謂「許家窯人」指得是，幾十萬年前的 20 件死人骨頭。
這群人生活的年代有不同見解。一派主張是 26 到 37 萬年，不過這回新研究採用比較晚的年代，13.8 到 19.9 萬年前。
取得尼安德塔人 DNA 而得到諾貝爾獎的帕波，最初其實是對古埃及有興趣，才投入這方面研究。可惜直到現在，古埃及的古代DNA 研究依然很有限。 這個 2025 年的論文報告埃及 4800 年前的古代基因組。雖然只有一個樣本，在這個時刻，仍然能帶來寶貴的線索......與大量的疑惑！
Whole-genome ancestry of an Old Kingdom Egyptian
古埃及文明草創期
樣本只有一個「NUE001」，來自開羅南方 265 公里 Beni Hasan 村的 Nuwayrat 遺址，裝在陶甕裡的死人骨頭。公元 1902 年，英國殖民統治埃及的時候，這件樣本被帶回英國。
從骨頭估計，這是一位身高 159 公分左右的男生，超過 44 歲後去世。那個時空下，這款墓葬方式表示他的地位比普通人高，卻不到最高。
土耳其的安那多利亞地區，加泰土丘（Çatalhöyük）是被考古學家探索最透徹的遺址之一。這個 2025 年的論文，報告大量古代DNA 樣本，探討此處可能的社會組成。
Female lineages and changing kinship patterns in Neolithic Çatalhöyük
早在 8000 年前的新石器時代，加泰土丘就長期居住著數千人。這兒的建築形式十分特別，房屋一棟連著一棟，之間幾乎沒有空隙，居住區內似乎也沒有廣場之類的公共空間。 許多墓葬就位於房屋裡頭，所以活人日常生活的家屋，和死人的墓葬共用空間。
這個論文總共嘗試 395 人，有 133 位取得古代基因組，131 位來自西丘（West Mound），介於距今 7900 到 9100 年；2 位東丘（East Mound），距今約 7800 年。
西丘又可以分為三個時期，早期是 8700 到 9100 年前，中期 8500 到 8700 年前，晚期 7900 到 8500 年前。分析對象中，有 75% 是青少年。後續研究發現，不同時期的墓葬對象，略有差別。
這個 2025 年的論文報告，印尼的大島蘇拉威西發現 7 件石器，出土的地層似乎早於 100 萬年。這是華勒斯線以東的海島上，又一次非常古早的人類紀錄。
Hominins on Sulawesi during the Early Pleistocene
蘇拉威西是個形狀特別，面積很大的島，這回的挖掘地點是島上南部的 Calio 遺址，Beru Member Sub-Unit B 這組地層。 主要發現是，這兒地下埋藏 7 件燧石製作的石器。
石塊有著人造的鋒利邊緣，算是手藝簡陋的工具。 材料大概來自附近的河床，目前最近的河流約為 2.3 公里，古時候也許不一樣，不過應該存在河流。
乍看之下，這些應該相當古老，但是具體有多早呢？論文使用不同的材料與手法定年，包括地磁反轉、US-ESR 定年法（Uranium-series and Electron Spin Resonance）、鈾釷定年法（U-series）。 可以肯定，石器埋藏的地層早於 77 萬年前的地質反轉事件。
南美洲西部的安地斯地區，包含現今秘魯、玻利維亞、智利等國家，歷史上最出名的政權莫過於「印加帝國」。然而，如同任何時空中的大帝國，印加內部並非鐵板一塊。這個 2026 年的論文，探討印加建立之前的地理政經格局。
Defensive networks provide basis for late pre-Hispanic Andean polities
安地斯是個海拔落差很大，地形複雜的地區，地方勢力盤根錯節。
6 到 10 世紀，這兒興起兩個強盛的政權，位於的的喀喀湖（Titicaca）附近，高高在上的蒂亞瓦納科（Tiwanaku），以及疆域更廣袤的瓦里（Wari）。
這個 2025 年的論文報告，從非洲東部的東非裂谷一帶，肯亞的圖爾卡納（Turkana）地區的多處地點取得古代蛋白質。包括不同年代：150 萬、700 萬、1600 萬，以及最古早的 1800 萬。
Eighteen million years of diverse enamel proteomes from the East African Rift
Thomas Baines 繪製的東非黑犀牛形象畫面，雖然不是古早犀牛，外行人看起來也是 87% 像。
能夠從非洲的熱熱熱環境獲得 1800 萬年之久的古代蛋白質，是難以想像的重大成就。 然而，Science 的新聞中有專家質疑真假。這方面我不會判斷，有興趣的捧油請自行挖掘。
Record-setting recovery of ancient protein used to identify extinct rhino relative
稻米是東亞、東南亞主要的農作物，在南島族群初期的發展中也有一席之地，但是大洋洲的小島不適合種稻。 奇妙的是，關島卻是例外。這個 2025 年的論文報告，關島最早的稻米歷史超過 3000 年，顯然是最早的移民一起帶過去的。後來在水土不合的小島上，稻米的角色，由糧食變成儀式象徵之物。
某些日本人看到這個研究，應該會超興奮？世界上還有別的民族傳統，如此看重稻米在食用以外的象徵意義！！
這個 2025 年的論文，深入分析南非超過 200 萬年前的古人類，粗壯傍人（Paranthropus robustus）牙齒中的「鍶」，推敲他們的出沒範圍、生態棲位。
Geochemical chronologies in Paranthropus robustus teeth inform habitat and life histories
河馬(X)嚕嚕米 via 這裡
鍶的兩種穩定同位素「鍶87」和「鍶86」，在不同地點，比例可能不一樣。 鍶會隨著飲食進入人體，成為新長出牙齒的一部分。所以把牙齒很細微的切片分析，便能得知那部分牙齒成長時，當時在哪兒活動。
例如象牙，便能如此分析。如猛獁象這類大象，象牙一直向前生長。因此象牙最前端會留下年紀最小的紀錄，愈靠近身體則愈年長，直到生命終結。
最早取得古代DNA 的人類之一，是住在阿爾卑斯山上的「冰人奧茨」。之前研究判斷，他所屬的血脈似乎相對孤立，在阿爾卑斯山區延續發展。 這個論文取得附近一帶的更多樣本，發現冰人的狀況，其實是更大地區的普遍現象。當地數千年來，多數居民的遺傳組成差不多，少有外來的情慾流動。
特倫提諾－上阿迪傑山區風光：via 這裡
這個論文分析的對象，都位於義大利北部的阿爾卑斯山區，特倫提諾－上阿迪傑（ Trentino-Alto Adige）這個地方。 17 處遺址，取得 47 個古代基因組，年代介於8200 到 3300 年前，包括中石器、新石器、銅器、青銅時代。
最古老約 8200 年的樣本「MAD01」，處於沒有農業的中石器時代晚期，算是採集狩獵族群。 遺傳上，他和更晚的人都不一樣。大致等同於 WHG 西方採集狩獵族群，不過也有 16.4% 接近 EHG 東方採集狩獵族群，估計合體於 1 到 1.5 萬年前之間。
世界各地有許多特化的工作狗狗。格陵蘭的雪橇犬 Qimmit 特殊之處在於，這是當今世上少有混血，而且持續擔任雪橇犬的品系。這個 2025 年的論文，報告他們的遺傳線索。
Origins and diversity of Greenland’s Qimmit revealed with genomes of ancient and modern sled dogs
不是哈士奇！via 這裡
世上曾經有過多款雪橇犬，隨著時代演變，許多精心培育的工作狗都變成寵物狗，或是與其他狗狗發生情慾交流。伊努特人祖傳的 Qimmit，也就是格陵蘭雪橇犬（Greenland sled dog），也紀錄著人類的歷史。
伊努特人的祖先源自亞洲東北部，後來向東遷徙，大約 800 年前抵達北美洲東部的格陵蘭。假如雪橇犬的來歷與人相似，那麼 Qimmit 的歷史其實沒有太久遠。
牛，是最重要的馴化動物之一，歐亞非洲不同文明的基礎。牛首先在西亞馴化，後來如何傳向東方？這個 2025 年的論文透過古代DNA 探索牛牛的歷史。
Ancient genomes illuminate the origins and dynamic history of East Asian cattle
via 這裡
「牛」有許多款式，這邊講的牛是黃牛，英文為 cattle，學名為 Bos taurus。祖先是野生的原牛（aurochs，學名 Bos primigenius）。
另外一款馴化牛，是源自南亞的瘤牛（Zebu，學名 Bos indicus），祖先為印度原牛（Bos namadicus）。
這個 2025 年的論文報告，從年代非常非常古早，超過 2000 萬年的犀牛化石，取得古代蛋白質。
Phylogenetically informative proteins from an Early Miocene rhinocerotid
巨犀有好幾個物種，圖片可以映襯智人的渺小。via 這裡
樣本來自加拿大北方的努納福特（Nunavut），曾經出土不少化石的霍頓隕石坑（Haughton Crater）。地處北緯 75 度，蛋白質有更高機率保存於冰天雪地。 用於分析的犀牛化石「CMNFV59632」，地層年代介於 2100 到 2400 萬年。根據形態特徵，被歸類為早已滅絕的巨犀屬（Epiaceratherium）。
論文花費不少篇幅在討論分析技術，有興趣的讀者請自行觀摩。總之，根據論文的說法，犀牛化石的琺瑯質中至少殘存 251 個胺基酸，可以對應到 7 個蛋白質。
