古代DNA技術的進步，讓科學家能以前所未有的方式，加入研究歷史的行列。這個2015年的論文，在之前的基礎上再接再厲，一共大手筆分析從8000到2000多年前，歐亞大陸西邊230位古代人的基因組，研究這幾千年來各地人群的組成變化、遷徙，以及適應環境的遺傳史。
Genome-wide patterns of selection in 230 ancient Eurasians
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之前的研究：
起源自非洲的智人，大約在45000年前起進入歐洲，生活形態一直都是採集狩獵；一萬多年前農業在中東出現，後來中東的農夫約8000多年前起，帶著農業進入歐洲，永遠改變了歐洲的人群組成與生活方式。
這個論文古代DNA的取樣對象，所屬的文化與年代。
這個論文一大突破是，首度獲得中東地區的古代基因組。繼之前其他團隊得到4500年前的非洲，古代衣索比亞人Mota的基因組之後，這個論文取得了26個距今約8300年，位於安那托利亞地區（現在的土耳其）的古代基因組，跟來自非洲的Mota一樣，DNA都取自耳骨（petrous bone）。
這個論文古代基因組的取樣地點（第一次見到黑底地圖）。
這些8300年前的安那托利亞農夫，遺傳上更接近現在的歐洲人，以及7000年前位於德國、匈牙利的歐洲早期農夫，反而不像現在的中東人。不過歐洲早期農夫跟採集狩獵族群，也就是當地更早的居民之間有混血的跡象，占了歐洲早期農夫的基因組7到11%。
繼安那托利亞農夫之後，歐洲的下一波大移民潮來自東歐大草原，如今幾乎歐洲所有族群，都有源自Yamnaya文化的人的相關血脈。這個論文採用薩馬拉地區（Samara），37個介於3500到7600年前的古代基因組，研究歐亞草原地區的遺傳史。
Yamna culture - Wikipedia, the free encyclopedia
用PCA分析各個時間與地點族群間的關係。
薩馬拉地區一開始的人，是7600年前的「東方採集狩獵族群」；接著6000到7200年前「銅石並用（eneolithic，從新石器過渡到青銅）時期」 的人，與中東的亞美尼亞人有混血的跡象；隨後5000年前左右，薩馬拉與卡爾梅克（kalmykia）的Yamnaya文化，阿爾泰地區的 Afanasievo文化，以及4200到4900年前薩馬拉Poltavka文化的人，彼此的遺傳組成相當類似，在PCA中自成一群，Y染色體主要單倍型是「R1b」，源自亞美尼亞人與東方採集狩獵族群的DNA，大概各占一半。
Chalcolithic（Eneolithic） - Wikipedia, the free encyclopedia
Afanasevo culture - Wikipedia, the free encyclopedia
Poltavka culture - Wikipedia, the free encyclopedia
左邊的圖是與薩馬拉地區有關的族群，基因組來自中東的亞美尼亞，與當地更早的東方採集狩獵族群的比例。右邊的圖是歐洲與亞洲各地族群，基因組來自安那多利亞農夫、歐洲的採集狩獵族群，與薩馬拉Yamnata文化的人的比例。
薩馬拉地區來到距今3600多年前的Srubnaya文化時，比起之前的Poltavka文化，多出了源自歐洲早期農夫（或是中東的安那托利亞農夫，無法區分）的組成。之前論文認為，5000年前Yamnaya文化進入歐洲後，與當地人形成的中歐繩紋器文化（Corded Ware），和千年後中亞烏拉山區附近的Sintashta與Andronovo文化，兩地人在遺傳上相當類似，因此兩地間可能發生過長距離遷徙。不過這回分析的Srubnaya文化，考量到地點，似乎更有可能才是往東遷徙到中亞的族群。
Corded Ware culture - Wikipedia, the free encyclopedia
Srubna culture - Wikipedia, the free encyclopedia
族群遺傳史之外，這個論文也比較了各個年代與地點的族群，尋找受到正向選汰的基因，一共有12個SNP被偵測到，反映了歐洲人幾千年來對環境的適應。
12個受到正向選汰的SNP。
現在多數歐洲成年人都可以消化乳糖，然而這個關鍵的基因變異，最早只是在4400年前的中歐出現，而且所有歐洲早期農夫都沒有，要到青銅時代結束後，3000年內才變得普遍。另外也有幾個與飲食相關的基因受到正向選汰，有意思的是，有2個遺傳變異卻與乳糜瀉（coeliac disease）有關，這似乎是農業飲食的副作用（利大於弊的弊）。
5個受到正向選汰的SNP，在古代與現代各地族群中的頻率。
歐洲人另一明顯的特色是淺色皮膚，與2個基因 SLC45A2 和 SLC24A5 有關。其中 SLC45A2 受到顯著的正向選汰，SLC24A5 則沒有，但 SLC24A5 已經普遍出現在安那托利亞農夫族群中，換句話說，9000年前的歐洲人還是深膚色，現在的白皮膚與9000年來的人群遷徙有關。不過北歐的採集狩獵族群例外，7500到7900年前的6個樣本中，都已經有了 SLC45A2 和 SLC24A5 兩個變異，應該是為了適應高緯度環境所致。
身高上，目前歐洲的趨勢是，北方的人比較高，南方的比較矮。這個論文也分析了與身高有關的SNP，發現身高明顯受到兩個方向的天擇影響，天擇導致4000到7000年前的伊比利農夫身高更矮，也讓3000到5000年前的草原族群身高變高。目前歐洲南北的身高趨勢，應該同時受到兩者影響。
伊比利族群在新石器時代的身高，2017年的論文提出相反的結果：
歐洲族群身高9000年來受到的影響與演變。
整體而言，這個論文第一次獲得中東的古代基因組，也建構出比之前更完善的歐亞族群史，還找到多個幾千年來有助歐洲人適應環境的基因變異。這個論文也發現，儘管4000年前與現代的歐洲人，在遺傳上已經相當接近，卻仍有許多重要的遺傳特徵不同，是在這4000年間才演化而來。
哈佛大學新聞稿：
Ancient genomes reveal natural selection in action
《Science》比較早的新聞：
How Europeans evolved white skin
《Science》新聞：
How farming changed the European genome
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