馴化豬和人類關係密切，在歐亞大陸的西方、東方，各自被馴化過。這個 2025 年的論文，鎖定歐洲北部的荷蘭，最早期的馴化豬，由古代DNA 的角度深入探討。
荷蘭最近引進的「野豬」。via 這裡
新取得的樣本不算多，總共 11 個古代基因組，覆蓋率介於 0.03 到 6.16，9 女 2 男。來自荷蘭 5 處、英國 1 處遺址。英國的樣本距今約 4500 年，出土地點 Durrington Walls 算是「巨石陣」相關遺址之一。
荷蘭的遺址都更早，分為三個時期：
中石器時代的 Hardinxveld，農牧業尚未開始的 7100 到 7400 年前。
新石器時代早期的 Swifterbant，混合採集狩獵與農業的 6000 到 6300 年前。
新石器時代晚期的 Schipluiden，農業更發達的 5600 年前。
這個論文的英文用字，野生與馴化豬很容易分辨，野豬是 wild boar，馴化豬是 pig。我想就是方便描述的稱呼，不要太計較。
歐亞大陸西部的狀況是，一萬年前左右的中東，出現最早的馴化豬，後來又引進歐洲。奇妙的是，之前研究得知，此後歐洲本土血緣大幅上升，幾乎徹底取代中東血脈。
我們也能想像，農牧業由歐洲的東南方進入，要再前進到北邊的荷蘭一帶，還需要一些時間。
荷蘭 Hardinxveld 在中石器時代的 4 個樣本，遺傳上完全缺乏中東成分。他們更親近歐洲的「野豬」，以及瑞士、義大利、西班牙等地的古早野豬。
值得注意的是，現在的荷蘭也有野豬，血緣卻與同一地區的前輩明顯有別。可能是由於 19 世紀的時候，荷蘭的野豬被人類壓迫而徹底消滅，後來都是新來的豬。
Swifterbant 是荷蘭濕地地帶，新石器時代最早的遺址。這時人們開始飼養牛、豬這類動物，也仍然依賴野生資源。這兒出土的哺乳動物骨頭，高達 60% 是豬，比牛還多。型態看起來，豬骨變化很大。考古學家有個推測是，同時混雜大隻的野豬，小隻的馴化豬，以及兩者情慾交流的合體。
數百年後的 Schipluiden，似乎已經能由豬骨型態分辨馴化或野生。不過此時牛牛的存在感，成為難波萬。
遺傳方面，新石器早期的荷蘭豬，首度出現能追溯到中東（西南亞）的血緣，可是比例很低，3 個樣本分別為 7.5、5.4、3.3%。新石器晚期的荷蘭豬，以及更晚一些的英國豬，都超過 10%。晚於新石器時代的歐洲樣本，目前數量很少，比例都和新石器晚期豬豬類似。
新石器早期的 Sw2 樣本，氮的穩定同位素相對高，看起來是與人類同居所致。體型比較小隻，或許可以認同為馴化款式。論文推測，這個時空中的人豬關係是「片利共生（commensalism）」，野豬被人類吸引，來到人類附近生活，不過行動相對自由。幾百年後的新石器時代晚期，人對豬的控制則明顯加強。
另一方面，最近有多款分析近親繁殖、血親關係的手法問世。不只人類，也能用於動物。這個論文由 ROH 切入。 ROH 意思是一對染色體之間，DNA 片段有多長沒有差異。例如很極端的狀況，雙胞胎男女生下的後代，兩條染色體會極為相似。
簡單說，ROH 愈高，表示父母的血緣關係愈近。假如父母血緣關係很近，會觀察到很長一段。
然而，另一種可能是，父母其實沒那麼近，可是兩者都源自同一個 DNA 總體變化很有限的小人群，怎麼配都只能那樣。若是如此，會觀察到一段沒那麼長，但是總共很多段。 兩個人可能 ROH 總值一樣，原因卻不同。
論文挑選品質較佳的 11 個古代，62 個現代樣本，進行 ROH 分析。 土耳其的古早野豬 ROH 程度很低，意謂野豬族群的豬口不少，有充裕的配對機會，保持 DNA 多樣性。由此推敲，豬在中東最初被馴化時，應該只源於少數個體，遺傳花樣有限。
新石器時代早期，法國、德國的豬 ROH 普遍比較高。論文判斷最合理的解釋是，近期的近親配對。這些豬豬的情慾交流，大概已經被人類深深介入。不過現今的歐洲野豬 ROH 也不低。應該是由於近期人類威壓，豬口有限，怎麼配也只有那樣導致。
是說論文在這塊的解釋，我覺得有些不容易自圓其說，甚至是矛盾。不過目前樣本太有限，就不深入討論惹。
複習，歐洲北部的荷蘭， 6000 多年前開始農業和畜牧，建立傾向片利共生的人豬關係，吸引一些野豬來投。此後人類對豬豬的控制加強。
疑問，最初源自中東的情慾流動，比例那麼低，歐洲的馴化豬，不能算是懂得養豬之道的人類，在歐洲又一次新的馴化嗎？
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