古代DNA 是從去世生物的遺骸或衍生物取得 DNA。相比之下,古代RNA 也可以研究,只是機會少得多。這個 2025 年的論文取得一批猛獁象肌肉組織的 RNA,最早約 5 萬年。來源和大家想的一樣,西伯利亞的凍土。
Ancient RNA expression profiles from the extinct woolly mammoth

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化學性質上,RNA 比 DNA 更容易分解。取得古代DNA 的技術成熟後,很少人還會嘗試古代RNA。所以有保存 RNA 的樣本,實際上或許沒有那麼少,只是沒人在意。
關注這個圈子的話,還是可以見到零星研究,宣稱取得古代RNA。可是有些研究似乎有點可疑,至少我這種歪果仁,檯面上找不到權威人士,在媒體上公開的認真討論。
這個論文大概更可靠。材料被冷凍保存,只有一部分得到結果。研究人猿屬於知名實驗室,論文發表於 Cell 期刊......反正要是不對,去找這些「權威」負責!

可惜與材料困難相比,研究結果本身偏向乏善可陳。10 件猛獁象樣本來自俄羅斯研究機構,送給歐洲的研究機構。每一件都比夜市賣的骰子牛更小。
骰子象肉原本都保存在西伯利亞的凍土,數萬年之久。一番敲打後,其中 3 件很可能保有古代RNA。 總共能對應到 300 個蛋白質基因,以及 60 個 microRNA。基因表現的類型,看起來符合骨骼肌相關細胞的預期。
年代最早的樣本超過 5 萬年,根據 DNA 變異估計可能為 5.2 萬年,是目前比較可靠的古代RNA 研究中最早的紀錄。
只有一件 3.9 萬年的樣本「Yuka」保有較多 RNA。他出土於西伯利亞東北部的 Oyogos Yar,現今政治上算是薩哈共和國的疆域。 原本判斷是女生,這回根據遺傳訊息得知,其實是配備 Y染色體的男生。

大家聽到 RNA,大概會聯想到是基因表現的產物,DNA 轉錄為 RNA,RNA 再轉譯為蛋白質。其實認真看一顆細胞內的 RNA,大部分都不會再轉譯成蛋白質。
有些 RNA,會以本身 RNA 的形式,調控其他基因的表現,microRNA 就是一類。即使是為惹最終轉錄而表現的 mRNA,也有不少非編碼的序列,分佈於頭、尾、中間。
不過數量最多的 RNA,其實是基因表現過程中的固定編隊,主要是 tRNA、rRNA、snRNA、snoRNA。另外還有些 RNA,可能來自其他生物:RNA 病毒。

所以樣本中的古代DNA,保存夠多的話,應該也能見到不同種類(這可以視為一道檢查標準)。 這也是 Yuka 的狀況。值得一提的是,他的 snRNA 比例相對較高,意謂他在去世時,骨骼肌正在認真工作,大量表現基因,卻戛然而止,急凍維持原本的狀態至今。
再怎麼頹廢的人,身體裡,都還是有天文數字的工作細胞在負重前行。
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論文短評:
新聞:
Mammoth mummies up to 50,000 years old yield oldest RNA yet found
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