這個 2025 年的論文報告，從年代非常非常古早，超過 2000 萬年的犀牛化石，取得古代蛋白質。
Phylogenetically informative proteins from an Early Miocene rhinocerotid
巨犀有好幾個物種，圖片可以映襯智人的渺小。via 這裡
樣本來自加拿大北方的努納福特（Nunavut），曾經出土不少化石的霍頓隕石坑（Haughton Crater）。地處北緯 75 度，蛋白質有更高機率保存於冰天雪地。 用於分析的犀牛化石「CMNFV59632」，地層年代介於 2100 到 2400 萬年。根據形態特徵，被歸類為早已滅絕的巨犀屬（Epiaceratherium）。
論文花費不少篇幅在討論分析技術，有興趣的讀者請自行觀摩。總之，根據論文的說法，犀牛化石的琺瑯質中至少殘存 251 個胺基酸，可以對應到 7 個蛋白質。
七個蛋白質為 AHSG、ALB,、AMBN、AMELX、AMTN、ENAM、MMP20，都是琺瑯質中會出現的成分。其中像是 AMELX，這邊的讀者想必都很熟悉。
沒有偵測到 AMELY，所以這位犀牛是女生？論文沒有討論這點。也有可能是保存數量很有限，剛好沒有留下來。 不過抓到的 7 種蛋白質中，AMELX 的胺基酸數目是最多的，依然沒有 AMELY。姑且先假設她是女孩紙。
科學上，這是一大大大突破！DNA、胺基酸都是有訊息意義的結構，不是單純的化學分子。這批蛋白質序列超過 2100 萬年，是目前最古早，有意義的生物訊息材料。
這不是第一次獲得犀牛的古代蛋白質。亞洲西南部的喬治亞，德馬尼西（Dmanisi）之前也得到過 Stephanorhinus 犀牛的胺基酸。177 萬年的年代已經非常遠古，和這回相比，卻無比年輕。
有 DNA 或胺基酸序列，便可以根據變異建構演化樹。這回的新材料沒有帶來全新的創見，卻足以強化支持一件已經知道的事。
現在全世界只剩下 5 個犀牛物種，很久很久以前，卻有過非常多種犀牛。犀牛們能粗略分為兩大群，現存物種都屬於犀亞科（Rhinocerotinae），另一群則是板齒犀亞科（Elasmotheriinae）。
板齒犀亞科的物種，長期與犀亞科共存。最後一員叫作「板齒犀牛（Siberian unicorn，西伯利亞獨角獸，學名 Elasmotherium sibiricum），一萬多年前才滅團。 之前取得過板齒犀牛的古代DNA，估計兩大群的共同祖先，能追溯到 3600 萬年前。但是也有研究認為，兩群更早分家。
這回的巨犀屬樣本加入一起考慮，發現犀牛家族三者中，巨犀屬最早分家，隨後才是板齒犀亞科和犀亞科。 巨犀屬分家的年代，估計介於 2200 到 3400 萬年。不論板齒犀亞科和犀亞科何時分家，都還要更晚。
綜合看來，板齒犀亞科、犀亞科的共同祖先頂多是 3000 多萬年，也就是漸新世（Oligocene）開始後，或是早一點，在始新世（Eocene）的晚期。應該不至於更早太多。 而巨犀屬，不是板齒犀亞科，也不屬於犀亞科，是自己獨立一群，還更早分家。
值得一提的是，美洲北端的霍頓隕石坑出土的某些動物，和歐亞大陸同時期接近，包括這回的巨犀，以及海豹科旗下的海幼獸（Puijila darwini）、雁鴨科旗下的天鵝。 論文認為，這支持北美洲的巨犀，祖先是在始新世晚期到漸新世早期，從歐亞大陸遷徙過去。
177萬年前，喬治亞的Stephanorhinus犀牛蛋白質
新聞稿：
Ancient rhino tooth protein recovery illuminates family tree
新聞：
Ancient proteins rewrite the rhino family tree — are dinosaurs next?
新聞：
Record-setting recovery of ancient protein used to identify extinct rhino relativeScientists
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