現在全世界的馬，遺傳多樣性非常有限，尤其是父系都能追溯到不久以前的幾位馬爸爸，這當然是人為育種的結果。然而父系遺傳的 Y染色體，由於上頭充斥重複序列，不容易定序，所以各 Y染色體型號間的關係不太清楚。這個 2017 年的論文克服技術困難，大手筆的定序世界各地 21 個品系，共 52 位男馬，並且採用普氏野馬和驢子當外群，研究大家的親戚關係。
Y Chromosome Uncovers the Recent Oriental Origin of Modern Stallions
比較發現，各品系馬的 Y染色體，之間的遺傳差異確實非常非常低。根據 Y染色體上特定位置的 DNA 變異，論文定義出多個單倍群。建構的親緣關係樹顯示，與其他馴化馬最不一樣的是昔德蘭矮種馬（shetland pony）和挪威峽灣馬（Norwegian fjords），兩者自成一個分枝，型號定義作 N。其餘品系中，最先與其他馬分開的是冰島馬（icelandic horse），型號定義作 I。
用各品系馬的Y染色體，建構的親緣關係樹。
馴化馬中，除惹以上 3 種以外，都可以歸屬於 2 大群：一群是源自阿拉伯半島的阿拉伯馬（Arabian horse），另一群是來自中亞草原的土庫曼馬（Turkoman horse）；如今世上絕大部分的馬，都屬於源於東方亞洲（Oriental ）的這兩大群，型號定義作 A、L、S、T。
各Y染色體單倍群分家的年代。
然而，估計牠們分家的年代，卻只是區區 650 年前，算算年代，那時是歐洲的中世紀末期。土庫曼馬、阿拉伯馬、冰島馬的共同祖先也只能追溯到約 1000 年前（維京人起家的年代！）；牠們和昔德蘭矮種馬、挪威峽灣馬分家的年代，也不過是更早 300 年的 1300 年前而已。
這個研究確認，當今世上的馴化馬 Y染色體的遺傳多樣性極低，而且大部分品系的共同祖先，都來自發源於亞洲的土庫曼馬與阿拉伯馬，大概距今 700 年不到。
馬系列：
新聞稿：
Most modern horses are descendants of recently imported oriental stallions
Science新聞：
Most modern horses came from just two ancient lineages
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