最近十分火熱的茲卡病毒，其實早在1947年，就已經在非洲發現，只是由於沒什麼特別，所以一直以來也沒什麼研究，直到最近疑似與小頭症扯上關係，一舉成名天下知。茲卡病毒從何而來，又歷經哪些改變，才演化為現在的樣子？這個2016年的論文搜集惹41個樣本，30個來自人類，10個取自蚊子，剩下1個則是吱吱，希望能了解茲卡病毒近期的演化史。
From Mosquitos to Humans: Genetic Evolution of Zika Virus
這些樣本中，可以大致分為「非洲型」與「亞洲型」兩大群，茲卡病毒發源於非洲，所以亞洲分支，應該是從非洲演化而來。所有取自人類的病毒，只有1968年奈吉利亞的樣本，屬於非洲分支，剩下的人類樣本全部被歸在亞洲分支。亞洲分支中只有1個來自蚊子，也就是1966年在馬來西亞採集的樣本，親緣上這株病毒，最先跟其他感染現在各地人類的病毒分家。論文根據現有資訊推斷，亞 洲型茲卡病毒的共同祖先，應該是離開非洲後，先在馬來西亞一帶建立據點，再散佈到別的地方，只是隨後漫長的50年間，對人類影響都微乎其微。
茲卡病毒在南美洲大爆炸前，稍早已經在2007年的密克羅尼西亞，以及2013年的法屬玻里尼西亞出現過。親緣分析顯示，這2個遠渡大洋洲的病毒都屬於亞洲型，跟1966年的馬來西亞蚊子病毒來歷相同，所以應該不是直接再從非洲而出。大洋洲的2波小爆炸，卻又可以再分為2個分支，而現在南美洲取得的病毒株，都跟法屬玻里尼西亞歸在同一群。顯而易見，最近的疫情大爆炸，與法屬玻里尼西亞的病毒株較為有關（但這不等於病毒傳播路線是，直接從法屬玻里尼西亞跑到巴西）。
為什麼以前跟現在，茲卡病毒的表現差這麼多？可能是病毒產生某些遺傳變異，使得致病威力大增。比較非洲與亞洲型病毒株的序列發現，兩者差異最大的是一個叫作prM（pre-membrane precursor）的蛋白質，某幾個氨基酸突變，應該會導致prM蛋白質的結構改變，也許與致病有關。
以上推論只是初步研究的結果，目前我們對茲卡病毒的各方面，了解仍很侷限。
新聞稿：
The genetic evolution of Zika virus
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