古埃及與古代DNA（下）──法老與子民 也刊登於古埃及練習曲
作者／寒波、編修／練習人
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續前篇：古埃及與古代DNA（中）──圖坦卡門身世之謎真的解開了嗎？
圖坦卡門家族的論文在2010年發表後，由Zahi Hawass率領，幾乎原班人馬組成的團隊，在2012年又發表了一篇論文，用類似的策略研究另一位知名法老，新王國時期第二十王朝，距今約3100年的拉美西斯三世（可參考「新王國（1540-1070 B.C.）」）。
Mummy Murder Mystery: King Ramesses III Throat Slashed
父與子
這篇論文確認，拉美西斯三世的喉嚨有道很深的創傷，支持他死於謀殺的說法。古代DNA在其中的貢獻是，發現他與另一具身分不明的木乃伊 「Unknown man E」，有著一模一樣的Y染色體遺傳特徵，因此兩者極有可能是父子關係。誰是這位「不知名E先生」？考古學家推斷，他很可能正是參與政變陰謀，後來被處決的王子Pentawere。
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弒父的伊底帕斯，面對形象來自埃及的人面獅身「Sphinx」
這個親子鑑定可不可靠？比起圖坦卡門的研究，這篇論文的方法沒變，一樣沒有粒線體DNA的相關資訊，只能信者恆信，但至少有兩點進步：
1. 作者們終於秀出了Y染色體的結果
2. 公佈了Y染色體的單倍型（haplotype）
古埃及人不知何許人也
隨著遷徙，散居各地，人類形成各個不同的遺傳族群，累積彼此間的差異，每組特定的遺傳差異，可以被視為不同的「單倍型」，用來追蹤人類的演化史，以及各個人群間的血緣關係。最常用的系統，是父系遺傳的Y染色體，還有母系遺傳的粒線體上以特定突變定義出的一系列單倍型。用單倍型分類時，僅有遺傳的意義，與血緣有關，與文化認同無關。
拉美西斯三世Y染色體的單倍型是「E1b1a」，這個型號大概能確定，發源自撒哈拉以南（Sub-Saharan Africa）的非洲，也是當地族群現今的主要型號之一。用不太科學的講法，這是個屬於「黑人」的遺傳特徵，而現今多數的埃及人，當然不是黑人。
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拉美西斯三世的木乃伊，現藏開羅博物館。
古埃及人屬於什麼種族，一直都是懸而未決的問題。無疑，這是十分敏感的族群問題，偏偏這是古代DNA研究不可避免需要面對的。古埃及人都是黑人嗎？假如這個結果不是汙染所致，那麼意思是：古埃及人是來自非洲南方的黑人，黑人曾經主宰整個非洲，包括埃及，甚至勢力還一度延伸到西亞，只是後來失勢，又退回撒哈拉以南？
Why King Tut's DNA is fueling race wars
且慢，別驟下結論。先不提遺傳上「黑人」的意義可能跟你理解的不太一樣，單獨一個單倍型不過是人類龐大基因組中的一小部分，僅能提供十分片面的資訊；更何況隔年的論文報告了史上第一個古埃及粒線體DNA的單倍型，它不是來自非洲南部，而是源於西亞的「I2」。
First insights into the metagenome of Egyptian mummies using next-generation sequencing
木乃伊DNA也會有春天？
2013年，在也參與過圖坦卡門與拉美西斯三世研究的Carsten Pusch領導下，第一次採用NGS（次世代基因定序）定序古埃及木乃伊DNA。終於，我們有了第一個古埃及人的粒線體DNA資料。
Egyptian mummies yield genetic secrets
比起前兩篇論文金光閃閃，瑞氣千條的王室木乃伊，這次研究對象是一條狗，以及5個年代介於距今約1900到2800年（第三中間期到羅馬時代）的無名氏。作者講得很明白，這個論文的目標不是獲得完整的基因組，只是想測試使用NGS定序，能獲得多少資訊。
先來點正能量，這個研究證實運用NGS，的確可以拿到木乃伊的DNA片段，所以擺了幾千年的木乃伊裡頭，的確仍有DNA存在，之前用PCR做出來的結果，不見得是汙染。如前所述，他也成功獲得粒線體DNA。
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發現好幾種植物的DNA，包括蓮花，推論蓮花也曾被用於木乃伊製程中。
由於NGS這種技術，會把樣本內所有的DNA片段一網打盡，不管是細菌、病毒、動物、植物，或是人類的，只要是DNA都會被定序出來，因此取自木乃伊頭部的樣本中，也有數種來自植物的DNA被發現，像是蓖麻、楊屬，也許反映的是當初製作木乃伊時用到的植物材料。也有些致病微生物的遺傳物質被找到，不過，這好像不是新聞了。
DNA不怕熱？
3個保存在氣溫遠小於15度以下的其他樣本：4000年前的古愛斯基摩人、5300年前的「冰人奧茨」（Iceman Oetzi）、數萬年前已滅絕的丹尼索瓦人（他不是智人，發現於西伯利亞），被拿來跟木乃伊比較。木乃伊幾千年來所處環境都超過15度，論文聲稱木乃伊中人類DNA的比例跟3個來自冰天雪地的樣本一樣高，可見氣溫不太影響DNA的保存。
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愛斯基摩人的冰屋。冰天雪地的環境，成功保存古代DNA的機會更大。
做出這種結論相當勇敢，畢竟，木乃伊中的DNA有是有，但總量實在是非常非常不起眼，這個狀況下，比例恐怕不是很要緊。另外，不同論文的取樣部位根本不一樣，處理過程也不同，這番推論的脈絡，有種「拉美西斯二世奴役猶太人蓋金字塔」的味道（練習人來插花：跟張飛打岳飛是一樣的意思，參考「電影《出埃及記：天地王者》的幾分真假」說明）。
小結
即使目前的進展仍很有限，古埃及的古代DNA研究總算是踏出一大步，古代DNA研究，在埃及的春天終於降臨了嗎？小苗已經萌發是肯定的，但要重建古埃及遺傳史這棵大樹，所需的樹枝恐怕連一根都還沒長完。
未完，待續…
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