盲眼的尼安德塔石器匠

這個 2021 年的論文，重建距今 1.71 萬年，一位猛獁象 28 年的生命史。他這輩子走啊走啊，累積可觀的里程，快要可以繞地球兩圈，可謂爪爪界的猛獁可波羅。

Lifetime mobility of an Arctic woolly mammoth

這個 2022 年的論文報告格陵蘭距今 200 萬年的古代DNA，突破紀錄，也意外得知當時有乳齒象出沒。古代DNA 並非來自化石，而是環境沉積物，這類樣本讓我們有機會一窺當時的生態系，以及思考 DNA 保存的問題。

A 2-million-year-old ecosystem in Greenland uncovered by environmental DNA

恐狼（dire wolf）是古時候的美洲狼，冰河時期結束後滅團。他們體格和現在的灰狼非常像，不過體型更大一號，想像形象類似《冰與火之歌》的冰原狼。這個 2020 年的論文卻指出恐狼和現存的狼，親戚關係其實非常遙遠，分家超過 500 萬年。

Dire wolves were the last of an ancient New World canid lineage

歷史上，美洲存在過多款大型動物，但是冰河時期結束後，馬、象等都滅團惹。這個 2021 年的論文調查白令東部過去 3 萬年的沉積層，由其中的 DNA 評估生態變化，發現美洲馬、猛獁象似乎一直生存到距今 5700 年前，比已知最晚的化石紀錄，還要更晚數千年。

Collapse of the mammoth-steppe in central Yukon as revealed by ancient environmental DNA

很很很少數的癌症會傳染。研究比較多的，一種在狗狗間流傳；2 種的宿主是袋獾，而且嚴重到有滅團危機。這個 2020 年的論文分析袋獾癌症的傳染狀況，發現似乎已經趨緩？

A transmissible cancer shifts from emergence to endemism in Tasmanian devils

有些人印象中，企鵝是住在冰天雪地的鳥。不過企鵝分佈其實很廣，從嚴寒的南極，到溫暖的加拉巴哥都能居住。這個 2020 年的論文取得 18 種企鵝，22 個基因組，探討企鵝的演化史。

Genome-wide analyses reveal drivers of penguin diversification

穴熊跟 La New 熊一樣，都是已經滅團的動物。穴熊冬天時會躲在山洞內冬眠，有時候就此長眠不醒，也因此留下不少化石 QQ。距今 2.5 萬年前過後，世界上就沒有穴熊惹，只能透過化石和古代DNA，來認識這種史前動物。這個 2021 年的論文獲得一位穴熊的基因組，分析發現穴熊的粒線體和基因組，遺傳史好像不太一致？

Middle Pleistocene genome calibrates a revised evolutionary history of extinct cave bears

同一物種的分家、新物種形成是重要的演化議題。這個 2020 年的論文，調查兩種有接觸機會的蘭花蜂（orchid bees），發現它們之所以不太會情慾交流，與費洛蒙有關。

The evolution of sexual signaling is linked to odorant receptor tuning in perfume-collecting orchid bees   

劍齒虎，是種冰河時期結束時不幸滅團的大貓貓。英文雖然叫作劍齒貓 scimitar-toothed cat，不過中文都稱為「虎」（聽起來比較厲害？）。這個 2020 年的論文首度報告，劍齒虎的完整基因組。

Genomic Adaptations and Evolutionary History of the Extinct Scimitar-Toothed Cat, Homotherium latidens

人類會使用各種工具，達到不同目的，像是拿麥克風唬爛、用漱口杯漱口。各種不同動物也一樣，最知名的是吱吱和象；鳥類也會，不過所知比較少。這個 2019 年的論文報告，距離遙遠的兩處：冰島和威爾斯，都觀察到北極海鸚使用工具。  

Evidence of tool use in a seabird

大家都知道菟絲子是寄生植物。菟絲子寄生到其他植物時，會出口一批短短 RNA（small RNA）到宿主體內，影響宿主正常的運作，協助其寄生的目的。沒有植物喜歡被寄生，宿主為什麼反抗無效？ 這個 2019 年的論文分析 4 種菟絲子，以及它們與宿主之間 RNA 的關係。

Compensatory sequence variation between trans-species small RNAs and their target sites

公元 1533 年葡萄牙的遠航貿易船，耶穌好棒棒號（Bom Jesus）在航向印度的途中不幸沉船，隨著 40 噸貨物長眠海底。這個 2020 年的論文報告，從船上的大批象牙取得 DNA，他們都是非洲森林象，但是生前都不住在森林。

Sourcing Elephant Ivory from a Sixteenth-Century Portuguese Shipwreck

獅子是最知名的大型動物之一，古時候有好幾種獅子住在非洲、歐亞大陸、美洲各地，現在卻只剩非洲和印度有一小群，還有台灣統一獅、韓國三星獅、日本西武獅，其他都滅團惹。這個 2020 年的論文取得穴獅和現代獅的基因組，探討獅子的遺傳史。

The evolutionary history of extinct and living lions

披毛犀牛是一種住在歐亞大陸北部的犀牛，不幸於 1.45 萬年前滅團，和義大犀牛一樣。這兒寫到披毛犀牛，多半是作為尼尼獵物的角色，不過今天他們是主角。這個 2020 年的論文報告披毛犀牛的古代DNA，發現牠們直到消失前幾千年，族群數量還很穩定。

Pre-extinction Demographic Stability and Genomic Signatures of Adaptation in the Woolly Rhinoceros

古代DNA 研究持續進展，之前年代最早的記錄於 2013 年發表，是距今將近 80 萬年的馬。2021 年新發表的 3 位爪爪樣本，2 位超過一百萬年，創下新記錄。

Million-year-old DNA sheds light on the genomic history of mammoths

這個 2021 年的論文，由墨西哥遺址的泥土中，獲得兩種古熊的細胞核 DNA，一種是一萬多年前滅團的大短面熊（giant short-faced bear，學名 Arctodus simus），另一種是如今仍然活著的美洲黑熊（Ursus americanus）。

Environmental genomics of Late Pleistocene black bears and giant short-faced bears

狼的演化史中，西伯利亞東北部是關鍵地區，最近也有研究認為馴化狗源自此處。這個 2021 年的論文取得 4 個古狼基因組，探討狼的演化史。

Genomes of Pleistocene Siberian Wolves Uncover Multiple Extinct Wolf Lineages

南美洲的捲尾猴，會利用石頭為工具敲打果果。這個 2019 年的論文報告這項行為至少存在 2400 年，可能有 3000 年之久，而且不同時期的吱吱，使用石頭的重量不太一樣。

Three thousand years of wild capuchin stone tool use

魚類有好幾種決定性別的方式，有些魚和智人一樣，也是有 Y染色體的是男生，沒有的是女生。大西洋鯡（Atlantic herring）乍看之下沒有性染色體，不過這個 2020 年的論文發現其實有，只是非常非常非常小，只牽涉 3 個基因！

Reconstruction of the birth of a male sex chromosome present in Atlantic herring

尼安德塔人等古早人類消失以後，黑猩猩與巴諾布成為人類的最近親，他們在分家至少 100 萬年以後，仍有過情慾流動。這個 2019 年的論文又發現，巴諾布疑似還跟神秘親戚交流過 DNA，黑猩猩卻沒有。

Ancient admixture from an extinct ape lineage into bonobos