目前分類:人類演化 (76)

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丹尼索瓦人,最初是藉由古代DNA辨識出的新種hominin。我們完全知道丹丹的DNA長得如何,臼齒之外的型態卻又完全未知。之前一共確認過3位丹丹的存在,數目跟NBA球員詹姆斯的冠軍一樣多,這個2017年的論文,報告惹第4位丹丹。

A fourth Denisovan individual

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人類在五萬年前已經抵達澳洲,如今的澳洲原住民是最初移民的後裔,但我們對幾萬年來,澳洲的遺傳史了解卻很有限。這個 2017 年的論文,從取自公元 1920 到 1970 年代,111 個博物館收藏的澳洲原住民頭髮樣本中,獲取粒線體 DNA,研究各地澳洲族群的遺傳史。

Aboriginal mitogenomes reveal 50,000 years of regionalism in Australia

由博物館頭髮 重建澳洲族群史

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近年來發達的基因體學,讓科學家能夠更加全面地,比較各種人類族群的遺傳差異,尋找天擇與環境變化,對人類適應造成的影響。之前針對格陵蘭伊努特人的研究發現,他們的去飽和酶基因(fatty acid desaturase,簡稱 FADS)受到正向選汰。之前研究偵測的方法,是比較伊努特人、中國的漢人,還有歐洲人族群間的差異。這個2016年的論文則深入調查,各美洲原住民族群中,去飽和酶基因的狀況。

Genetic signature of natural selection in first Americans

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智人是在非洲起源的生物,在何時離開非洲,走哪些路線前往世界各地,是尚無明確答案的問題。最早的智人不會飛,也不會渡海,只能靠腿走路,因此沿路的環境,勢必會影響遷徙的狀況。離開非洲的第一站,是中東的黎凡特與阿拉伯半島,古代智人的腦袋雖然比起一般動物更加高強,但長距離穿越不毛之地應該還是有困難。這個2016年的論文用大把的氣候資料建立模型,重建過去12.5萬年來,這些地區適宜人居,有機會讓人通行的年代,研究人類遷徙的過程。

Late Pleistocene climate drivers of early human migration

F1 

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尼安德塔人和丹尼索瓦人的基因組被定序成功時,當時分析就指出住在大洋洲的美拉尼西亞人,與兩種古代hominin都明顯有過混血的跡象,之後研究則認為,東亞居民也配備了少少的丹尼索瓦人血脈。這個2016年的論文採用世界各地159個族群,共1937位現代人的基因組,分析各地族群與古代人種的混血狀況,期望了解更多這段謎團重重的歷史。

Excavating Neandertal and Denisovan DNA from the genomes of Melanesian individuals

F1

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智人在幾萬年前離開非洲,前進世界時,與路上遇見的尼安德塔人與丹尼索瓦人有過混血,然後他們就死掉了。現在要追蹤這些事件,除了少少的古代DNA樣本之外,只能分析各地現在的族群,尋找線索。這個2016年的論文,比較全世界120個族群,包含20位近大洋洲居民共257個基因組,希望更加了解與丹尼索瓦人的混血狀況。

The Combined Landscape of Denisovan and Neanderthal Ancestry in Present-Day Humans

NDH 

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歐洲幾十萬年來是尼安德塔人的地盤,最早的智人大概 45000 年前進入歐洲,雙方共存幾千年後,尼安德塔人滅亡,剩下智人獨存。之前研究讓我們對一萬年內的歐洲遺傳史,有相對充分的認識,然而從智人最初進入歐洲到一萬年前這段期間,這幾萬年來所謂「採集狩獵」族群的歷史,所知相當有限。這個 2016 年的論文,定序大批這幾萬年間的古代遺骸,最後共分析 51 個古代樣本,建構幾萬年來的歐洲遺傳史。

The genetic history of Ice Age Europe

數萬年前冰河時期,智人在歐洲的遺傳史

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尼安德塔人的「全套基因組」已經被定序數年,覆蓋率超過 0.1 的個體也有 5 人之多,但這些樣本都來自女生,所以依然欠缺尼安德塔男生 Y染色體的資訊。這個 2016 年的論文從西班牙 El Sidrón 遺址,距今約 49000 年的男生樣本中,定序出尼安德塔人的 Y染色體 DNA。

The Divergence of Neandertal and Modern Human Y Chromosomes

F1

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西班牙距今43萬年的胡瑟裂谷(Sima de los Huesos,簡稱SH)遺址,是整個歐洲非智人hominin化石數目最豐富的遺址,至少有28位個體,約6000件樣本。描述這批化石時,充分體現「hominin 」這名詞的精要-因為一直無法定論這批化石到底屬於什麼人種,所以講hominin最保險、最不出錯。這個2016年的論文,試圖從幾個樣本定序DNA,取得更多資訊。

Nuclear DNA sequences from the Middle Pleistocene Sima de los Huesos hominins

NDH 

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智人離開非洲後,大概在45000年前首次進入歐洲,最近研究讓我們對萬年內歐洲人的遺傳史了解突飛猛進,但更早之前了解仍很有限。人類尚未進入農業時代前,都稱作採集狩獵族群。這個2016年的研究,定序了歐洲各地距今7000到35000年前的35個古代粒線體DNA,希望能更全面認識這段時間歐洲居民的遺傳歷史。

Pleistocene Mitochondrial Genomes Suggest a Single Major Dispersal of Non-Africans and a Late Glacial Population Turnover in Europe 原本論文的圖有點小錯,修正版

  Ice-Age   via 這裡

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智人演化上最近的親戚,尼安德塔人與丹尼索瓦人,兩者都滅亡了。智人祖先大概在6萬年前,與尼安德塔人疑似在中東混血,導致如今所有非洲以外的族群,都有源自尼安德塔的DNA。這個2016年的論文,採用更多資料與更新發展的方法,分析混血事件。

Ancient gene flow from early modern humans into Eastern Neanderthals

KMT sucks    via 這裡

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丹尼索瓦人是一種透過化石DNA發現的人種,非常幸運,丹尼索瓦人的全套高品質基因組,非常完好的保存在西伯利亞南方,阿爾泰山旁的一小塊小指骨(Denisovan 3)中。遺傳上丹尼索瓦人是尼安德塔人的最近親,然而有關他們的形態,除了一顆很大的牙齒(Denisovan 4)外,我們卻幾乎一無所知。2015年這個論文,報告了新發現的牙齒Denisovan 8,也是第3位確認的丹尼索瓦人。

Nuclear and mitochondrial DNA sequences from two Denisovan individuals

NDH  

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這個 2015 年的論文發現至少 8 萬年前,智人已經出現在東亞南方。

The earliest unequivocally modern humans in southern China

螢幕快照 2015-10-25 23.56.54 

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尼安德塔人的基因組被完整定序後,我們確認非洲以外的現代人,全都有著不到4%源於尼安德塔人的DNA,可見兩者曾經混血,可能發生在5到6萬年前的中東。大部分尼安德塔人都住在歐洲,45000年前左右智人開始進入歐洲,到尼安德塔人距今約40000年前消失的這段時間,雙方有再度混血嗎?假如有,為什麼如今歐洲人沒有更高比例來自尼安德塔人的DNA?

An early modern human from Romania with a recent Neanderthal ancestor

KMTsuck  

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研究古代人類演化,除了科學家一向辛勤的工作外,近年來幾個科技進展,像是古代DNA定序、更準確的同位素定年、更先進的化石形態比較法(high-resolution computed tomography/digital methods)都幫忙很大。從這篇2015年的《Science》論文中,可以看出以上新技術合體的強大威力。

The makers of the Protoaurignacian and implications for Neandertal extinction

Geographical distribution of the Protoaurignacian 

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至今仍沒有確鑿的證據,能讓我們推論出尼安德塔人的滅亡原因,要知道它們為什麼滅亡,至少要先知道尼安德塔人消失的年代,因此精確的定年技術相當重要。最為人熟知的同位素定年法是碳定年法,它的極限是5萬多年,然而之前的碳定年法卻會低估樣本的年代。

The timing and spatiotemporal patterning of Neanderthal disappearance

Location of the 40 sites  

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