目前日期文章:201609 (13)

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每個人都有腸,腸內除了我們的細胞以外,還有許多細菌居住,也就是近年來熱門的研究主題之一-腸道菌。這個2016年的論文比較人類(更精確地說是美國人),與其現存於世最親近的2種親戚,黑猩猩和巴諾布猿(bonobos,也叫倭黑猩猩),還有更外面一點的大猩猩,這4種在演化上的大猿近親,各自腸道菌間的演化關係。(4者關係如圖的右上)

Cospeciation of gut microbiota with hominids

KMT228  

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大家都知道住在非洲,以脖子很長聞名的長頸鹿。本人沒見過長頸鹿的林奈,在1758年時根據骨骼標本,將長頸鹿命名為Giraffa camelopardalis 這一個物種。後來有些學者,又將長頸鹿再細分為好幾個亞種,在這個2016年的論文發表前,一個說法是,共有分佈在非洲各地區,9個亞種。

Multi-locus Analyses Reveal Four Giraffe Species Instead of One

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北韓所屬的朝鮮半島,地理上位於東亞大陸的東北方,跟西伯利亞、蒙古、中國北部(還可以算上日本),共同屬於古北界(Palearctic ecozone)東方,也就是東亞北方的生物帶。在比發現北京人的周口店遺址,更東方的北韓,也有出土過一些hominin化石,至少有 Yokpo Daehyundong、Dokchon Soongnisan、Ryonggok 這3個遺址。這些古北韓人是何方高人呢?

FF  via 這裡

 

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肥沃月灣在12000年前邁入新石器時代,是世界上最早轉型農業社會的地區。它的西部,黎凡特、美索不達米亞、安那托利亞的農夫族群,以穀物和莢果為主;東部伊朗的札格羅斯(Zagros)地區,則是出現或許尚未馴化的二棱大麥(two row barley),以及世界上最早的山羊,與西部差異明顯。

The genetics of an early Neolithic pastoralist from the Zagros, Iran

FF

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人吃人(真的吃,不是形容詞)是人類歷史上各地常常發生的現象,也有許多學者討論過食人的各種意義。考古學家則在一些遺址中發現,有些尼安德塔人,也把其他尼安德塔人當作食物過。這個2016年的論文重新整理在比利時的Goyet,更精確地說是Troisième caverne遺址中,出土的99個尼安德塔人樣本,發現這些尼安德塔人生存在距今約40500到45500年前,很接近尼安德塔人最終消失不見的年代。

Neandertal cannibalism and Neandertal bones used as tools in Northern Europe

life_of_pi__struggle_by_biffno  via 這裡

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全世界最早的農業社會,出現在中東的肥沃月灣。這個2016年的論文,定序惹位於肥沃月灣東部,也就是現在伊朗的札格羅斯,共7個古代基因組,4個來自距今9000年的Wezmeh Cave遺址(品質最佳的叫作WC1),3個來自10000年前的Tepe Abdul Hosein遺址,研究這群農夫與其他族群的遺傳關係。

Early Neolithic genomes from the eastern Fertile Crescent

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跨越太平洋與印度洋,範圍非常廣大的南島語族,分佈的最西邊是馬達加斯加,這個位於東非外海的島嶼。然而考古學上,南島語族究竟是在何時抵達馬達加斯加,之前卻沒有十分明確的證據。住在眾多島嶼上的南島語族,除了以航海聞名於世,另一鮮明的特色是「農業」,南島語族在移民時,往往會攜帶習慣的農作物與動物一起移動,因此研究南島相關的農作物,也可以間接追溯人群遷徙的歷史。

Ancient crops provide first archaeological signature of the westward Austronesian expansion

crop  

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使用加工後的石器,是hominin才具備的特色,但用石頭作為工具就不是惹。住在巴西的卷尾猴(capuchin monkey,學名Sapajus libidinosus),會挑選前端平滑、相對牠們體型還不小的石塊,作為榔頭敲打之用(影片有各種敲打動作)。用石頭當工具,即使是在跟一般動物相比,更聰明的吱吱界也不常見,事實上,是相當罕見。卷尾猴是何時、如何學會這項技能的?

Pre-Columbian monkey tools

KMT  

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男鄉民的30公分哪夠看!二裂果蠅5.8公分等級的超大型精子  原載於泛科學

有頭有尾巴,長得像蝌蚪,大概是大家對精子的印象,不過某些精子的形象或許有點驚人。比方說有些果蠅(Drosophila)的精子尾巴非常長,有種學名叫作 Drosophila bifurca 的果蠅,擁有記錄上最長的精子,尺寸大到要以公分計算,一隻精子從頭到尾可以長達「5.8 公分」[1],屌打所有動物!

圖一  

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在南非發現的納萊迪人,是去年人類演化領域的重大新聞。由於化石眾多,目前學者們對納萊迪人本身的型態知之甚詳,但出於升星洞穴的狀態,至今仍無法成功定年,得知納萊迪人究竟生長在什麼年代。另外型態獨一無二的納萊迪人,在演化上該擺在什麼位置,與其他hominin 間的關係,至今也眾說紛紜。

The evolutionary relationships and age of Homo naledi: An assessment using dated Bayesian phylogenetic methods

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考古證據顯示,智人最早在5萬年前已經渡海抵達澳洲,他們的血脈數萬年後一直延續至今嗎?最近十分熱門的古代DNA研究,其實早在十幾年前就有人在做。 2001年時一個論文, 研究取自「Willandra湖」與「Kow Swamp」兩處遺址,共5位古代澳洲人的樣本,發現當中2位粒線體DNA的單倍群,落在現代智人族群的範圍之外。研究古代DNA時,汙染是最嚴重的問題,這個研究可靠嗎?這個2016年的論文,採用全新的技術重新定序幾個樣本。

Ancient mtDNA sequences from the First Australians revisited

MMM 

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大麥(barley,學名Hordeum vulgare)是人類主要的糧食作物之一,在一萬多年前於肥沃月灣馴化。這個2016年的論文從位於黎凡特,在死海附近的Judean沙漠的Yoram Cave遺址中,成功獲得惹銅石並用(Chalcolithic)時期,距今6000年古代大麥的基因組,研究這種超重要糧食作物的遺傳史。這樣講地點應該沒人聽得懂,總之就是在以色列的某處。而6000年,也是至今最古老的古代植物基因組。

Genomic analysis of 6,000-year-old cultivated grain illuminates the domestication history of barley

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中東地區的人,在12000年前正式步入農業,成為全世界最早的農夫,隨後農業向各方傳播,永遠改變了人類本身與這個世界。這個2016年的論文,定序了中 東地區,從尚未步入農業社會的採集狩獵族群,一直到青銅時代為止,介於3400到14000年前的44個古代基因組,研究世界上最早農夫族群的遷徙與混血,與中東地區的遺傳史。

Genomic insights into the origin of farming in the ancient Near East

F0

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