目前日期文章:201601 (13)

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至今不少古代基因組被定序成功,大大增進我們對人類遺傳史的知識,然而,由於非洲氣候不利DNA保存,一直都無法取得古代DNA的一手資訊,也就無法追溯這個遺傳多樣性世界最高人類起源地的遺傳史。這個2015年的論文,從衣索比亞高原的洞穴中,獲得4500年前採集狩獵族群Mota樣本,他的基因組定序後(來自耳骨,petrous bones),coverage高達12.5。

Ancient Ethiopian genome reveals extensive Eurasian admixture in Eastern Africa

原本論文:Ancient Ethiopian genome reveals extensive Eurasian admixture throughout the African continent

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用化石研究人類演化的歷史,其實只有100多年。出生於1913年的瑪麗.李奇(Mary Leakey),與她的老公路易斯(Louis Seymour Bazett Leakey),是最初投入這個領域的先驅,他們在東非的一系列研究,證實人類祖先起源於非洲。

Animated Life: Mary Leakey(內有影片)

fff  

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南瓜是人類的食物,也是童話裡灰姑娘的馬車,還是感恩節與萬聖節前夜(Halloween)的要角,例如「傑克南瓜燈(Jack-o'-lantern)」。南瓜屬於南瓜屬(Cucurbita),這個屬還有好幾種植物,本來認知是,大概在一萬多年前的中部美洲,也就是現在的墨西哥一帶,美洲原住民馴化了這些南瓜屬植物。

Gourds and squashes (Cucurbita spp.) adapted to megafaunal extinction and ecological anachronism through domestication

Light a Pumpkin  via 這裡

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最初的農業起源於一萬多年前的中東,有了農業以後,人類邁入新石器時代,接著8000多年前位於現在土耳其,安那托利亞地區的農夫,又把農業向西傳入歐洲。這個2016年的論文,定序了來自安那托利亞西北方Kumtepe遺址的樣本「Kum6」,研究安那托利亞與歐洲早期農夫間的遺傳關係。

Genomic Evidence Establishes Anatolia as the Source of the European Neolithic Gene Pool

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尼安德塔人的長相,跟我們一看就不太一樣,尼安德塔人的臉明顯比智人更突出。臉看起來不同,是因為臉部骨頭的形狀不一樣。這個2015年的論文比較了智人、尼安德塔人,以及分類上算是早期尼安德塔人的胡瑟裂谷化石,彼此上頜骨(maxilla)發育模式的差異。

Ontogeny of the maxilla in Neanderthals and their ancestors

Face_poster   via 這裡 

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種類繁多、千變萬化的羽毛,是鳥類最顯眼的特色之一,羽毛對求偶及生殖相當重要。這個2015年的論文,大規模研究了《Handbook of the Birds of the World(世界鳥類手冊)》上的6000多種鳥,量化每種鳥的男生與女生,各自的羽毛色彩鮮豔程度之後,再分析牠們的各種特徵,例如居住地點、體型大小、性擇等等,對兩性羽毛色彩的影響。

The effects of life history and sexual selection on male and female plumage colouration

birds diversity  

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黏體動物(Myxozoan)是常見的水生寄生蟲,常常感染魚類,一共有2000多種。黏體動物在形態與遺傳上的很多特徵,都不像動物,它們沒有嘴巴、沒有腸,也沒有所有動物都有,控制身體發育的Hox基因,甚至生活史的某些時候,只會剩下幾個細胞。雖然很多種又很常見,黏體動物的演化來歷卻不太能確定,具有這麼多奇特特徵的生物,在演化上跟誰最親近?

Genomic insights into the evolutionary origin of Myxozoa within Cnidaria

1  via 這裡

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鼠疫桿菌:伴隨人類5000年的死神  原載於泛科學

大規模傳染病一直伴隨在人類左右,近幾年令大家印象深刻的就有SARS、禽流感、狂犬病、伊波拉、MERS、登革熱等等,而衛生條件不佳的古代,致命的傳染病更是相當普遍。講到歷史上的傳染病,絕不可能忽略鼠疫桿菌(Yersinia pestis)。

dr via 這裡

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幾百年前大西洋奴隸貿易(Atlantic slave trade)盛行時,位於西非外海的維德角是重要的轉運站(Cape Verde,又叫綠角,它是一個群島,現在是獨立國家),大量來自非洲的奴隸途經維德角,隨後被奴隸商人賣到歐洲或美洲。

500-Year-Old Church Discovered in Slave Trade Settlement

church   via 這裡

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這3年生物學領域裡,最熱門的主題之一CRISPR,本來是原核生物的後天免疫系統,不過當有人發現CRISPR系統中,有種叫做「Cas9」的蛋白質,可以輕易地用來做基因改造後,CRISPR的身價就不一樣惹。

Cpf1 Is a Single RNA-Guided Endonuclease of a Class 2 CRISPR-Cas System

cpf1  

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智人起源自非洲,所以一定要離開非洲,才能前進世界,目前非洲之外大多數人的祖先,應該都是7萬年內,6萬年前左右離開的,但到底是走哪條路離開,仍有爭議。

Africacaca  

原地圖取自:這裡

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最知名的直立人化石-北京人,可以直接叫作「Peking Man」,不過最近論文中常見的稱呼是「Zhoukoudian Homo erectus」,Zhoukoudian就是周口店,意思是「周口店的直立人」。北京人生存的年代屢有爭議,這個2009年的論文採用鋁鈹同位素定年法,重新測量周口店遺址的地層年代。

Age of Zhoukoudian Homo erectus determined with 26Al/10Be burial dating

Peking_Man   via 這裡

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演化上,一些生物的性狀會呈現「取捨(trade-off)」的狀況,典型的例子像是鳥類的羽毛:男鳥羽毛顏色鮮豔,可以吸引女鳥,增加交配的機會產下後代,卻也會鳥大招風,更容易被捕食吃掉,減低傳宗接代的機會,演化上成功的男鳥,勢必在兩者間有所取捨。鳥的羽毛差異在顏色,與視覺有關,與聲音有關的聽覺,最近也得知一個trade-off的例子。

Evolutionary Trade-Off between Vocal Tract and Testes Dimensions in Howler Monkeys Testes

吼吼吼 via 這裡

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